Nature子刊:北京大学陈鹏团队开发相分离体系中蛋白质互作的时空...
根据这一思路,利用G3BP1-BirA结合δK*,捕捉和鉴定了应激颗粒(SG)中SARS-CoV-2的核衣壳(N)蛋白的互作蛋白质组,并解析了宿主激酶介导的磷酸化对N蛋白在SG中与许多功能性RNA结合蛋白互作的促进作用,进一步阐释了病毒与宿主相互拮抗过程的机制。他们也鉴定和比较了m6A修饰的“阅读器”YTHDF1、YTHDF2在SG中的互作...
中国农大植保学院周涛团队揭示玉米与病毒互作新机制
为进一步理解SCMV调控可变剪接的机制,该研究中利用TurboID邻近标记结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)的方法,筛选了多个与NIa-Pro潜在互作的剪接因子;进一步通过可变剪接报告系统、互作验证及内源剪接因子表达沉默实验,证实了SCMV编码的NIa-Pro通过与ZmU2AF65B的互作,进而操纵RNA剪接。随后,利用Iso-Seq技术,该研究发现Z...
前沿透视|Cell:人工智能引领发现介导受精过程的膜蛋白相关新型...
AlphaFold-Multimer通过结构预测方法来预测蛋白质-蛋白质之间的相互作用。在预测结果中,Izumo1与Spaca6和Tmem81之间的相互作用得到了高分(图2),表明它们可能在结构上相互靠近。通过进一步的分析,发现Tmem81是一个在精子中表达的单次跨膜蛋白,虽然前人的研究并未发现其与受精过程有明确关联。图2.AlphaFold-Multimer...
Nature | 蛋白质稳定性的遗传结构
利用12个结构特征建立的线性回归模型有效预测了耦合强度,验证了能量耦合与蛋白质结构互作之间关系密切。通过设计组合饱和突变实验,作者验证了主链残基距离与能量耦合强度的相关性。结果表明,尽管残基在三维结构中相互接近,其主链中的相对位置对耦合强度的影响更为显著。主链距离与耦合强度高度相关,表明蛋白质序列中残基位置...
Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略
筛选了一系列具有强效配体的穿梭蛋白,并将其成功用于多种内源蛋白的重新定位。开发了一个定制的成像分析流程,展示了通过分子偶联到含有足够强定位序列的穿梭蛋白,可以调节蛋白质的稳态定位。由此提出了一种通过蛋白质转运重构细胞互作网络的靶向治疗方法,为治疗疾病提供了新的思路。
解密蛋白质互作网络的关键方法:深入解析GST Pull-Do
2.GSTPull-Down实验在蛋白质互作网络研究中的应用蛋白质互作网络是由大量蛋白质相互作用所构成的复杂网络(www.e993.com)2024年11月20日。GSTPull-Down实验被广泛应用于研究蛋白质互作网络中的关键节点和功能模块。通过这种实验方法,可以筛选和鉴定与目标蛋白特异性结合的互作伙伴,从而揭示蛋白质相互作用的动态调控机制。此外,GSTPull-Down实验还...
...科技大学水雯箐/庄敏团队解析内源GLP-1受体的细胞膜蛋白互作组
对于两种细胞中新发现的若干GLP-1R潜在互作蛋白,研究团队首先利用生化实验验证了11个候选蛋白与GLP-1R的相互作用。其次,在INS-1Eβ细胞中,证明5个互作蛋白的敲低会显著提高高糖条件下GLP-1刺激的胰岛素释放效应。进一步的机制研究暗示,这些细胞膜互作蛋白主要通过抑制GLP-1R介导的cAMP信号通路来削弱GLP-1刺激的胰岛素...
Nature子刊:南京大学陈加余团队系统解析三链体DNA互作蛋白的调控...
为实现在活细胞中系统捕获内源三链体DNA互作蛋白,研究团队开发了特异性识别三链体DNA的光交联化学探针photoBQQ。该探针在Benzoquinoquinoxaline(BQQ)分子的基础上增加了双吖丙啶(diazirine)和炔基(alkyne)基团。双吖丙啶具有紫外光交联活性,而炔基基团可通过点击化学反应连接生物素,以便后续富集。
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
实验步骤相对简单,不需要用到特殊的仪器设备。实验条件温和。可以证明两个蛋白有直接的相互作用。该实验是体外实验,可能无法完全反映体内条件下的蛋白互作情况,可结合Co-IP技术进行检测。??实验步骤1、GST标签蛋白表达和纯化;2、GST标签蛋白偶联GSH琼脂糖珠或者磁珠;...
FIDA分子互作仪:带你复现Nature青睐蛋白质与核酸互作50分顶级发文...
图1.结构生长轨迹分析方法(左)和II-C型Cas9的生长轨迹图(右)通过生化实验和冷冻电镜解析复合体结构表明,来自金黄色细菌属(Chryseobacteriumsp.)的CbCas9生长出了一个全新的增强Cas9活性的β-REC2结构域,以及一个全新的能够与其关联基因PcrIIC1互作的CTH结构域。通过蛋白间相互作用,2个CbCas9蛋白和2个PcrIIC1...