圣湘生物申请一种病毒宏基因组测序数据的分析方法等专利,提升病毒...
本发明提供了一种病毒宏基因组测序数据的分析方法,包括如下步骤:S1、获取病毒宏基因组测序数据;S2、将所述测序数据按照物种进行匹配,并按照物种获取病毒物种reads数集;S3、对所述病毒物种reads数集的病毒reads序列进行特异性鉴定,获取病毒物种特异性和非特异性reads序列集S4根据如下公式获取病毒物种reads数集的GA??ra...
AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过...
传统RNA病毒鉴定方法高度依赖序列同源性比对,即通过比较未知病毒与已知病毒的序列相似性来进行识别。但是,由于RNA病毒种类繁多且高度分化,传统方法难以捕捉缺乏同源性或同源性极低的「暗物质病毒」,这限制了新病毒发现的效率。在过去10年中,人工智能相关方法,尤其是深度学习算法,在生命科学领域的各个研究领域产...
中山大学:解锁“AI+病毒学”的科学密码
过去,人们通过分离培养病毒,在显微镜下观察确认病毒的存在。随着技术发展,科学家们利用测序技术,通过比较未知病毒和已知病毒核酸序列的相似性,来识别和鉴定新病毒。然而,这些传统的病毒发现方法比较依赖既有知识,尤其在面对缺乏同源性或同源性低的“暗物质病毒”时,很容易失灵。如何突破传统病毒发现方法的瓶颈,用...
中山大学用智能技术研究病毒获突破 借助人工智能新发现超16万种...
过去,人们通过分离培养病毒,在显微镜下观察确认病毒的存在。随着技术发展,科学家们利用测序技术,通过比较未知病毒和已知病毒核酸序列的相似性,来识别和鉴定新病毒。然而,这些传统的病毒发现方法比较依赖既有知识,还有很多病毒缺乏同源性或同源性低,用传统方法很难识别,这类病毒被称为“暗物质病毒”。如何突破传统...
疫苗前沿 | 甲型流感病毒的反向疫苗学:从基因组测序到疫苗设计
计算机技术的使用大大减少了鉴定潜在疫苗所需的时间和成本,也简化了选择抗原的繁琐过程。RV方法已成功地应用于鉴定血清B群脑膜炎球菌(MenB)、炭疽芽孢杆菌、肺炎链球菌等新疫苗。作为研究案例,我们将深入探讨RV技术在甲型流感病毒上的应用。1、介绍自Rappuoli于2000年初提出该术语以来,“反向疫苗学”一词预示着...
中国科学家团队发现大量全新RNA病毒
该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,发现了传统研究方法未能发现的病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的新路径(www.e993.com)2024年11月1日。传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,面对RNA病毒这种高度分化、种类繁多且容易变异的病毒识别效率低。在该研究中,团队开发的人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序...
中国科学家运用人工智能算法发现大量全新RNA病毒,大幅拓宽RNA病毒库
中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志上发表论文,报告了180个超群、超过16万种全球RNA病毒的发现,这是迄今为止规模最大的RNA病毒研究,大幅扩展了全球RNA病毒的多样性,该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,发现了传统方法未能发现的病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的新路径...
研究发现大量全新RNA病毒 刷新全球病毒圈认知
最早,人们通过分离培养病毒,在显微镜下观察确认病毒的存在。随着生命组学的发展,科学家们能够利用测序技术,比较未知病毒和已知病毒核酸序列的相似性,识别和鉴定新病毒。这种方法十分依赖对病毒的既有认知。“传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识。面对RNA病毒这种高度分化、种类繁多...
猫麻疹病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立
摘要:为建立检测猫麻疹病毒(FeMV)敏感、特异且快速的方法,本研究根据FeMV的L基因保守区设计引物,通过反应条件的优化,建立了快速检测FeMV的SYBRGreenI荧光定量RT-PCR方法。以质粒标准品pMD19t-FeMV-L为模板,结果显示该方法最低检测下线是30拷贝/μL,是常规RT-PCR方法的100倍。组内和组间的重复性试验显...
最新指南:关于呼吸道合胞病毒感染,你必须知道的12个问题
儿童呼吸道感染病原多样,采用多重病毒核酸检测能够快速鉴定病毒,如多病原核酸检测阴性,且病情持续进展,可酌情应用NGS。推荐意见2核酸检测适用于各级医院门诊和急诊,有核酸检测条件的医院可以直接进行核酸检测;多重核酸检测方法适用于住院患儿入院前以及住院后的检测;...