“被忽视的英雄”——酪氨酸!Sci. Adv揭示:饮食中非必需氨基酸Tyr...
研究补充苯丙氨酸(Phe)可以恢复由Tyr缺乏引起的生育力下降,表明Tyr代谢物可能与生殖调控无关。研究表明,Tyr的饮食需求不仅取决于其合成能力,还与其消耗速度有关。由于产卵是雌性果蝇最需营养的过程之一,研究人员通过使用雄性果蝇和无卵雌性果蝇探究了生殖能力对Tyr剥夺表型的影响。结果显示,在雄性果蝇和无卵雌性果蝇中,...
目标替代动物的器官芯片,走到哪里了?
器官芯片产生的数据复杂而多样,包括细胞活性、代谢物水平和电生理信号等。人工智能,尤其是深度学习算法,能够有效处理这些多维度的数据。AI可以识别出人类难以察觉的微妙模式,比如细胞行为的细微变化。它还能将不同类型的数据,如基因表达、蛋白质水平和代谢物浓度等整合分析,从而得出全面的结论。此外,AI在异常检测方面表...
《食品科学》:新疆农业科学院吴斌、张平研究员等:氯化钙调控能量...
本研究针对鲜杏货架期间快速转黄的问题,以小白杏为试材,采用CaCl2雾化熏蒸处理,分析果皮和果肉中叶绿素的变化规律,探究CaCl2对能量代谢的调控模式,明确能量代谢与果实转色之间的关系,为进一步揭示外源CaCl2在小白杏保鲜过程中的作用机制提供理论基础。1CaCl2处理对采后小白杏外观品质和色泽的影响如图1所示,随着贮藏时间...
科学家联合揭示孕期糖尿病遗传密码
研究人员还通过串联质谱技术,检测了84种孕期代谢指标(如氨基酸、维生素等),并识别出了53个与之相关的基因,其中23个为新发现的基因。他们发现,同一种代谢物在妊娠期与非妊娠期的中青年女性中表现出不同的遗传效应,揭示了妊娠期代谢物水平特异的遗传调控机制。进一步分析显示,这些母体代谢指标与15种中老年疾病及表型间...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
short-read测序是检测和定量转录组范围基因表达的最常见方式,部分原因是因为它比表达芯片更便宜、更易于应用,但更主要的是它可以获得全转录组水平高质量的表达数据。采用Illumina的short-read测序做DGE分析的核心步骤包括RNA提取,cDNA合成,接头连接,PCR扩增,测序和数据分析(图一)。由于mRNA片段化和基于beads的文库纯化过...
通过对拟南芥基因表达的研究,揭示其他各类生物体的生存进化规律
其中有1000多个基因组的相关系数较高(见表),但有些小型基因组的相关系数较低,比如被分类为“前体代谢物和能量产生”的PH数据集(www.e993.com)2024年10月20日。把基因按照对植物激素的响应分成不同组(IAA、玉米素、GA、ACC、BL、ABA和mJA),分析它们在数据集中的噪声——可塑性相关性,结果如下表:还是老方法,根据基因表达水平...
浅谈抗白粉病和易感栽培黄瓜品种,了解黄瓜对黄瓜感染的代谢反应
抗PM黄瓜系的遗传育种是控制这种破坏性疾病的有效方法。在过去的几年中,已经在各种黄瓜品种中鉴定出许多PM抗性相关基因和代谢物。两种黄瓜翻译控制蛋白CsTCTP1和CsTCTP2被确定为对富氏链球菌感染的防御反应的负调节因子。CsPTI1编码细胞质激酶,参与对真菌病原体富里吉内氏菌的防御反应。
Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的...
01NatureMethods研究报告了SwitchSeeker,一种综合计算和实验方法,用于系统鉴定功能性RNA结构开关。02研究团队将SwitchSeeker应用于人类转录组,识别出245个潜在的RNA开关。03通过基因组范围的CRISPR筛选,鉴定出通过该RNA结构开关调控基因表达的反式因子。04此外,研究发现无义介导的mRNA降解以构象特异性方式作用于该元素...
《食品科学》:湖北工业大学李欣博士等:鲁氏接合酵母对高盐和高温...
微生物基因表达和代谢在逆境下会发生剧烈变化,对营养物的需求应该会发生相应的调整。考虑到高温逆境和高盐逆境可能会关闭某些营养物的自身合成途径,使得酵母细胞对营养物获取的方式发生变化,因此,分析全合成培养基中8种有机酸、7种维生素、7种核苷类物质和14种氨基酸对酵母细胞生长的影响,将有助于阐明鲁氏接合...
基于影像多组学数据库的无创可视化新方法,揭示乳腺癌肿瘤内异质性...
本研究概述了铁死亡的基本生物途径,并对比了高IITH和低IITH肿瘤相对于正常组织的代谢基因表达的差异。如图7F所示,高IITH肿瘤显示出不饱和脂肪酸合成、铁运输、费顿反应和硫代还原酶途径的激活。对与肿瘤铁死亡相关的放射组学特征进行深入探索发现,灰度共生矩阵特征的差异熵和一阶特征的方差表现出显著的图像异质性。总之...