...内蒙古农业大学吉日木图教授等:基于UPLC-MS非靶向代谢组学分析...
为进一步区分不同组别差异,采用有监督的PLS-DA方法对数据进行分析。由图6可知,3组样本均被有效地区分开,各组样本内部聚合度较PCA方法更加聚合。5不同年龄组驼肉的OPLS-DAOPLS-DA是一种有监督的判别分析统计方法,本研究采用SIMCA软件分别建立I、II和III组的OPLS-DA模型。OPLS-DA得分图表明(图7a、c、e),I...
...结构生物学,研究提出基于弱监督学习的冷冻电镜颗粒挑选新方法
更丰富的数据增强技术和重叠分区策略来提升小训练集时模型的性能;为提高颗粒定位的速度,DeepETPicker采用图形处理器(GPU)加速的平均池化-非极大值抑制(MP-NMS,meanpoolingandnon-maximumsuppression)后处理操作,与现有的聚类后处理方法相比提升挑选速度数十倍。
一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识
因此需要选择适当的前处理流程,主要包括:直接涂抹法、原位甲酸提取法、甲酸乙腈提取法、双甲酸法等多种方法??[??6??]??,??图1??中总结了不同类型微生物的MALDI-TOFMS样品制备流程。图1基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定不同病原微生物适用的前处理方法高致病性微生物的鉴定,应在灭活后采用甲...
快速准确定位识别生物大分子 中国团队基于人工智能研究提出新方法
采用精确率-召回率、F1-分数、对数似然概率贡献度、最大值概率、RH分辨率、全局分辨率6个定量指标全面评价颗粒挑选的质量,结果表明,DeepETPicker在仿真与真实数据集上均可实现快速准确的颗粒挑选,其综合性能明显优于现有的其他方法,生物大分子结构重建达到的分辨率也达到采用专家人工挑选颗粒进行结构重建同样...
...等:基于CATA和GC-MS-O的不同牧场牛奶感官特性及香气活性物质分析
采用单因素方差分析、对应分析(CA)和偏最小二乘回归(PLSR)等方法,分析影响不同牧场牛奶感官差异的香气活性化合物,以期为实际乳品工业中的牛奶感官品质的控制提供进一步的理论参考。1牛奶样品的感官分析50名参与者通过CATA问卷对牛奶样品的感官属性进行勾选,表2显示了4个牛奶样本的22个感官属性描述词的使用...
...一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算方法
为阐明宏基因组样本的基因组成,通常采用两种主要方法,各有利弊(www.e993.com)2024年10月20日。第一种方法是将测序读数精确地映射到一组已知的、有注释的参考基因组序列上,以提供已知生物、基因和潜在功能的快速概览。MG-RAST就是擅长这类分析的系统之一。在第二种方法中,将大量读数从头组装为contigs/scaffolds,可以为了解以前未被描述的生物体及其...
质谱流式细胞技术流程:实现细胞级蛋白质分析的关键步骤
在完成抗体标记后,样品被送入质谱流式细胞仪器。在仪器中,样品被气化并被电离,然后通过时间飞行质谱仪进行分析。每个细胞被检测到的金属离子信号反映了该细胞中对应生物标志物的量。5.数据分析获得的原始数据需要经过专门的软件进行处理和分析,包括质控、标准化、聚类分析等,以识别不同的细胞群体和它们的功能状态,...
...基于气相色谱-质谱技术与多元统计分析咸蛋黄热加工中的异味组分
咸蛋黄挥发性物质聚类热图分析从图2可知,2组样品分别聚类,表明两组咸蛋黄挥发性物质相对含量间存在显著差异,与感官评价结果一致;各样品的3个平行检测均分别聚类,说明本研究的实验条件和方法具有较好的稳定性。在2组样品中,正己醛、正壬醛、正辛醛、2-戊基呋喃、3-甲基丁醛、苯甲醛、苯乙醛和1-辛烯-3-醇的...
《食品科学》:华中农业大学陈玉琼教授等:基于多元统计分析的抹茶...
采用系统聚类法,以抹茶的感官品质、主要生化品质为指标,对36个茶树品种所制抹茶进行聚类分析(图1),根据不同品种抹茶的品质特征可分为三大类。第I类群有17个品种,分别为紫牡丹、中茶108、中茶102、迎霜、五峰310、乌牛早、台茶12、名选131、梅占、茂绿、马边绿、龙井43、黄旦、福云六号、福鼎大毫、福鼎大白...
iMeta | 东北林业大学冯富娟组发现丛枝菌根真菌诱导削弱镉的迁移
WGCNA是一种无监督的分析方法,可以根据180种物质特异性样本的表达谱对基因进行聚类。为了稳健地构建共表达网络,我们仅保留至少一种物质的对应区域的mappedreads≥5的色谱峰面积,以及由CLCGenomicsWorkbench生成的区域之间的差异表达基因。物质表达按log2(FPKM+1)表达进行归一化。软阈值功率β计算邻接。为了最...