中山大学科研人员报道代谢组学AI分析新方法
该研究开创性地提出可解释性集成深度学习方法DeepMSProfiler,可端对端地进行非靶向代谢组学数据分析。DeepMSProfiler方法能够直接将原始的LC-MS下机数据转换为样本所属疾病类别、疾病相关的关键代谢物和疾病相关的代谢物-蛋白质网络等结果,提供了全面的疾病相关代谢组图景。DeepMSProfiler无需使用传统的代谢组学分析过程中...
...会-付湘晋教授:感官评价结合代谢物组学方法解析虾酱呈味物质基础
感官评价结合代谢物组学方法解析虾酱呈味物质基础以山东、广东、河北等地区15个虾酱样品为研究对象,采用感官评价法对虾酱呈味特性进行评价,采用超高效液相色谱串联质谱对虾酱中的代谢物进行检测。结果表明,鲜味和咸味是虾酱的主要滋味特点,苦味是虾酱的主要滋味缺陷。相关分析表明,鲜味与咸味、整体滋味呈显著正相关,酸...
...教授等:基于UPLC-MS非靶向代谢组学分析不同年龄双峰驼肉代谢物...
本实验以变量投影重要度(VIP)值>1为筛选标准,初步筛选出各组间的差异代谢物,进一步采用单变量统计分析,验证差异代谢物是否具有显著性。选择同时具有VIP>1和P<0.05的代谢物,作为具有显著差异的代谢物。IvsII组间共筛选鉴定出显著差异代谢物78个,其中I组上调47个,II组上调31个;IIvsIII组间共筛选鉴定出...
...代谢物提取和高分辨率质谱对人体心脏组织进行全面的代谢组学分析
图2展示了六种方法通过DI-FTICR得到的代谢物SmartFormula注释,其中最大的三个交叉区域分别是六种方法共享、三相法特有和乙腈/异丙醇/水(3:3:2)特有的,分别有1287个、1010和703个,且发现多相提取的重叠度会更高。虽然在三相提取中可以获得更多的代谢特征,但该方法的重现性也最低。故对于发现代谢组学实验,Matyas...
Nature子刊:中山大学李伟忠团队运用深度学习方法,探秘癌症特异性...
导读使用质谱法进行的非靶向代谢组学分析,可提供全面的代谢分析,但其医疗应用面临着数据处理复杂、批间变异性高和代谢物不明的挑战。在本研究中,团队介绍了DeepMSProfiler,这是一种可解释的基于深度学习的方法,能够对原始代谢信号进行端到端的分析,并具有高精度和可靠性的输出。
大咖面对面丨细胞代谢组学新法 助力新污染物筛查和风险评估
“第三,如何从发生变化的小分子代谢物的质谱信号中,挖掘隐藏其后的生物学信息,进而揭示环境污染暴露特征(www.e993.com)2024年10月21日。在分析脂质组学的相关数据时,课题组通过充分的文献调研和数据挖掘鉴定出一些和特定亚细胞器相关的脂类生物标志物。通过测定细胞中上述生物标志物的丰度变化,揭示了污染物复合暴露对细胞线粒体、溶酶体、内质网、...
Nature重磅:用反向代谢组学方法,挖掘IBD中的微生物新分子 | 热心...
Nature:反向代谢组学方法,挖掘IBD新线索Nature——[64.8]①开发反向代谢组学方法,通过合成新化合物→获得质谱图(LC-MS/MS)→搜索公共代谢组数据(MASST)→元数据分析(ReDU),揭示代谢物与表型、物种、样本类型的关联;②对4类人体代谢物进行合成和探索,其中胆汁酸类分子的分析表明,克罗恩病中Glu、Ile/Leu、Phe...
...推出针对综合肠道细菌代谢物和微生物群分析的最新解决方案
宏基因组学主要分析肠道微生物群的遗传信息,而代谢组学主要研究肠道微生物群所产生代谢物的特性。通过整合这些方法,Noster可以评估肠道微生物组的功能和宿主的健康状况。Noster的代谢组分析服务专注于膳食纤维和脂肪酸分解过程中肠道微生物群产生的脂肪酸代谢物。其中包括短链脂肪酸和独特的多不饱和脂肪酸衍生代谢物...
倒计时2天!3??15“第六届代谢组学前沿”精彩报告预览
在药物研究方面,参与过2个一类新药的临床前药代动力学研究工作;代谢组学方面,在临床代谢组学、暴露代谢组学有较丰富的经验;脂质组学方面,非靶脂质研究流程、上千种脂质化合物定量方法等;在AnalyticalandBioanalyticalChemistry,JournalofChromatographyB,BiomedicalChromatography,frontiersinpharmacology等...
高强度间歇性运动前后高水平女子足球运动员尿液代谢组学特征研究
结论1)高水平女子足球运动员在大强度比赛后显著变化的代谢物主要涉及ATP-CP系统、糖酵解系统、有氧氧化系统、神经调节系统以及氨基酸代谢系统;2)代谢组学方法能够为运动员在备战期和赛前的饮食与营养补充以及运动效果的评价提供更全面、更具针对性的数据分析与指导。