谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...

1、基因表达谱分析:通过对基因表达谱数据进行深度学习,可以预测基因功能、发现新的生物标志物和生物路径径。2、结构生物学预测:通过对结构生物学数据进行深度学习,可以预测蛋白质结构、功能和互动。3、生物信息学数据集预处理:通过对生物信息学数据集进行深度学习,可以提高数据质量、减少噪声和缺失值,从而提高预测模型...

中科院1区-if27+: 旋覆花内酯靶向E2泛素结合酶UbcH5c抑制胰腺癌...

其中15个蛋白表达下调,148个蛋白表达上调。为了全面了解差异表达蛋白的功能,使用Metascape]进行通路和蛋白相互作用富集和聚类分析。通路富集分析揭示了与凋亡信号通路调节、蛋白定位到细胞核、MYC活性通路、抗原呈递和RNA代谢相关的通路(图5c),表明DHPO对细胞增殖和细胞死亡的总体影响。接下来,我们使用分子复合物检测算法识...

DropBlot——一种化学固定单细胞蛋白质组分析的混合微流控平台

4.能够分析蛋白质亚型:可以分辨不同细胞类型基于其独特指纹蛋白质和蛋白质亚型的差异,例如在分析乳腺癌细胞系时,能够区分上皮细胞系和间充质细胞系中蛋白质的表达差异。5.检测细胞亚群:通过“细胞门控”模式,能够分析特定细胞亚群中蛋白质亚型的表达情况,如同流式细胞术一样,但在分析蛋白质亚型方面具有独特优势...

利用LC-MS检测揭示生物样品中的差异蛋白表达

2.1差异蛋白的鉴定:通过LC-MS技术,可以对生物样品中的蛋白质进行高通量鉴定,发现在不同生理或病理状态下表达差异显著的蛋白质。2.2蛋白质定量:利用LC-MS技术的定量功能,可以对差异蛋白的表达水平进行准确的定量,比较不同样品之间的差异。2.3功能注释和通路分析:结合蛋白质数据库和生物信息学分析工具,可以对差异蛋白...

一次性单细胞蛋白质组和代谢组同步分析策略

随后,作者还利用scPMA方法在单细胞水平上研究了多柔比星对肿瘤细胞的诱导作用(图5)。对比药物处理组的各个单细胞样本发现给药后不同的单细胞在蛋白质表达上存在着异质性,这也是在群体分析中无法观察到的现象。与未给药的细胞相比,给药组共鉴定出255个差异蛋白(图5b、c),一些肺癌细胞中过表达的蛋白显著降低。大...

C S C|类原肠胚发育的动态蛋白表达图谱及细胞类型异质性解析

此外，单细胞蛋白质组学可以在单个细胞层面，揭示细胞群体中的个体细胞之间的差异和异质性，进而深入了解细胞在不同状态下的功能和表达水平的变化，从而揭示细胞群体中隐藏的多样性和特异性(www.e993.com)2024年11月3日。然而，截至目前也尚未对植入后胚胎或基于干细胞的胚胎发育模型进行基于质谱的单细胞蛋白质组学分析。近日，荷兰奈梅亨大学Oncode...

不同HER2蛋白表达水平的HER2阳性乳腺癌,对HER2靶向治疗的反应存在...

越来越多的数据表明,HER2阳性乳腺癌受HER2蛋白表达水平、HER2基因拷贝数水平、ER状态等多种因素影响,对HER2靶向治疗表现出不同的应答反应。近期,在线发表于BritishJournalofCancer的一项研究利用大型乳腺癌队列(n=7390),评估HER2不同免疫组化亚型(IHC3+和IHC2+/ISH+)的临床病理特征和基因表达差异(DGE),并探...

4D蛋白质组学解析:从静态到动态的生物大数据分析

这种分析方法可以通过跟踪蛋白质表达水平的变化，或者监测蛋白质翻译后修饰的动态过程，来获取更全面的信息。动态蛋白质组学的研究可以帮助我们理解生物系统的时序调控和复杂性。3.生物大数据分析：4D蛋白质组学的特点之一是其产生的海量数据。这就需要强大的生物大数据分析技术来解读和提取有价值的信息。这涉及到统计...

...室王永成和傅旭东团队实现深度单细胞转录组与蛋白质组分析新突破

scSTAP分析平台被应用于减数分裂前后鼠卵单细胞的多组学分析,首次实现了同一单个鼠卵细胞的转录组与蛋白组同时分析,在GV期和MII期单个鼠卵细胞样品中达到了19948个基因和2663个蛋白质组的平均定量水平。在不同时期卵细胞间转录与蛋白的差异表达研究中,鉴定出2392个差异表达转录本和127个差异表达蛋白质(图2)。

...室王永成和傅旭东团队实现深度单细胞转录组与蛋白质组分析新突破

scSTAP分析平台被应用于减数分裂前后鼠卵单细胞的多组学分析,首次实现了同一单个鼠卵细胞的转录组与蛋白组同时分析,在GV期和MII期单个鼠卵细胞样品中达到了19948个基因和2663个蛋白质组的平均定量水平。在不同时期卵细胞间转录与蛋白的差异表达研究中,鉴定出2392个差异表达转录本和127个差异表达蛋白质(图2)。