【蛋白纯化直播课】详解蛋白纯化优化技巧与蛋白互作技术
图1.Strep-tag??标签与配体IBALifesciences公司提供用于纯化的填料、重力柱、上机柱,用于蛋白互作研究的磁珠、SPR试剂盒、BLI试剂盒。此外还有质粒、抗体、纯化过程中的Buffer、耗材等。IBALifesciences是一家为学术界和工业界的生命科学研究提供产品的生物技术公司。基于杰出的专利技术Strep-tag??系统,其开发出...
抗体亲和力增强17倍,百奥几何、复旦AI方法模拟细微蛋白质互作
(2)在特征提取阶段,采用多级消息传递方案来全面了解蛋白质界面上复杂的相互作用。(3)提出了一种基于对比学习的预训练算法,利用CATH中丰富的未标记单链蛋白质结构,将侧链扭转角知识提取到模型中,进一步提升模型性能。GearBind的强大性能研究人员用两个现实世界的抗体亲和力成熟项目检验了他们基于GearBind的管线。
Nat Chem:陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能...
利用该探针,作者在HeLa和A549细胞系中开展了化学蛋白质组学研究,特异性捕获并通过定量质谱成功鉴定了78个高置信度的三链体DNA互作蛋白,为理解三链体DNA的动态调控机制奠定了坚实基础。随后,作者通过多组学数据(ChIP-seq,CUT&Tag,S1-END-seq等)的联合分析揭示了这些调控蛋白的分子调控机制及潜在生物学功能。作者对...
中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...
中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端结构域识别其固有无序靶标的结构机制。相关研究成果以“Combinedpredictionanddesignrevealthetargetrecognition...
质谱革命:推动蛋白组学市场快速增长的黄金技术
蛋白质组学技术已从最初的蛋白质定性鉴定扩展至多个领域,包括蛋白质定量表达分析、翻译后修饰鉴定和定量、蛋白质互作分析、蛋白质复合物成分解析、空间蛋白质组分析以及单细胞蛋白质组分析。这些技术不仅应用于基础科学研究,更在药物开发、临床医学和转化医学等领域展现出巨大潜力。这一切得益于质谱技术、蛋白质分离技术、...
Nature子刊:南京大学陈加余团队系统解析三链体DNA互作蛋白的调控...
为实现在活细胞中系统捕获内源三链体DNA互作蛋白,研究团队开发了特异性识别三链体DNA的光交联化学探针photoBQQ(www.e993.com)2024年10月16日。该探针在Benzoquinoquinoxaline(BQQ)分子的基础上增加了双吖丙啶(diazirine)和炔基(alkyne)基团。双吖丙啶具有紫外光交联活性,而炔基基团可通过点击化学反应连接生物素,以便后续富集。
Nat Chem | 陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能...
为实现在活细胞中系统捕获内源三链体DNA互作蛋白,作者开发了特异性识别三链体DNA的光交联化学探针photoBQQ。该探针在Benzoquinoquinoxaline(BQQ)分子的基础上增加了双吖丙啶(diazirine)和炔基(alkyne)基团。双吖丙啶具有紫外光交联活性,而炔基基团可通过点击化学反应连接生物素,以便后续富集。作者通过一系列体外和体内...
研究发现一氧化氮互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制
同时,该研究从NOP-1标记的蛋白质中鉴定出α-微管蛋白。通过蛋白pulldown实验和药理学操纵等手段,研究进一步证明NO通过酪氨酸硝基化α-微管蛋白,扰乱骨架蛋白稳态,最终导致细胞凋亡。????研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金等的支持。NO互作蛋白调控低糖诱导神经元凋亡的新机制...
分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...
实验步骤相对简单,不需要用到特殊的仪器设备。实验条件温和。可以证明两个蛋白有直接的相互作用。该实验是体外实验,可能无法完全反映体内条件下的蛋白互作情况,可结合Co-IP技术进行检测。??实验步骤1、GST标签蛋白表达和纯化;2、GST标签蛋白偶联GSH琼脂糖珠或者磁珠;...
FIDA分子互作仪:带你复现Nature青睐蛋白质与核酸互作50分顶级发文...
图1.结构生长轨迹分析方法(左)和II-C型Cas9的生长轨迹图(右)通过生化实验和冷冻电镜解析复合体结构表明,来自金黄色细菌属(Chryseobacteriumsp.)的CbCas9生长出了一个全新的增强Cas9活性的β-REC2结构域,以及一个全新的能够与其关联基因PcrIIC1互作的CTH结构域。通过蛋白间相互作用,2个CbCas9蛋白和2个PcrIIC1...