AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过...
如图B所示,只有RNA测序读数能够成功映射到与病毒RdRP相关的序列,而RNA和DNA测序读数则分别映射到了与DNA病毒、逆转录病毒(RT)和细胞生物相关的序列。进一步地,如图C所示,通过应用更灵敏的RT-PCR方法,研究团队在115个病毒超群中进一步确认了17个。在这些超群中,DNA提取未能检测到...
AI 发现 16 万种新 RNA 病毒成果登上《Cell》后,我们和阿里云算法...
我们训练的模型LucaProt,只要输入一个序列,就能判断其是否是RNA病毒,而不需要复杂的生信过程,或者传统生物方法的过程。我们有一个独立测试数据集来测试这个模型的效果泛化性,发现效果很好。通过全球大规模推理,经过生物实验的验证,用AI的方法发现了超16万种新RNA病毒。AI科技评论:相较于LucaOne模型...
我国科学家证明寨卡病毒直接导致小头症
我国神经生物学家与病毒学家合作,首次建立了寨卡病毒小头畸形动物模型,证实了寨卡病毒可以直接导致新生儿小头畸形。这一成果于北京时间12日凌晨在线发表于国际学术期刊《细胞-干细胞》上。这一研究团队是由中国科学院遗传与发育生物学研究所许执恒研究员、军事医学科学院微生物流行病研究所秦成峰副研究员联合领导的。...
曹雪涛连发两篇论文,利用单细胞时空分析,揭示肺部防御病毒感染及...
病毒清除后,Slamf9+巨噬细胞分化为Trem2+和Fbp1+巨噬细胞,促进后期炎症消退,最终补充肺泡巨噬细胞。这些发现在SARS-CoV-2感染的hACE2小鼠模型中得到了验证,并在公开的人类尸检单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中得到了证实,这表明了Slamf9+巨噬细胞及其与中性粒细胞的协作在损伤后组织修复和炎症消退中的潜在作用。
...| 剧烈运动可短期内提高执行功能;利用AI发现16万种新RNA病毒...
此外,研究表明,执行功能,如工作记忆和抑制功能,是受运动影响最大的认知领域。研究中采用了贝叶斯分层模型,确保了结果的稳健性,并通过修剪和填充方法减少发表偏差。未来,研究团队计划结合实验室任务和现实活动进一步验证剧烈运动对认知功能的具体影响。研究发表在CommunicationsPsychology上。
科学智能又一重要成果:中澳科学家用AI发现超过16万种新病毒
另一种情况是,当我们在动物或媒介昆虫中监测潜在的人类病原体时,需要一个工具来判断在这些动物和媒介中新发现的病毒是否具备跨物种传播到人类并引发大流行的潜力(www.e993.com)2024年11月27日。”他说。研究团队表示,将继续训练该模型以发现更多的病毒多样性,并且同样的方法可以用于识别细菌和寄生虫。没有参加这项研究的生物进化学家姜小炜博士...
中国科学家团队发现大量全新RNA病毒
利用LucaProt,研究团队对来自全球生物环境样本的10,487份RNA测序数据进行病毒挖掘,发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群(相当于门或纲的分类级别),使RNA病毒超群数量扩容约9倍。其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。
AI发现超16万种RNA病毒,中山大学、阿里云联合研究成果在国际顶刊...
据介绍,研究团队对来自全球生物环境样本的10487份数据进行病毒挖掘,发现了513234条病毒基因组,代表161979个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。使RNA病毒超群数量扩容约9倍,病毒种类增加约30倍,其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质“。该论文还揭示了多个病毒学领域新发现:发现迄今为止最长的...
...鲁凤民/王麟团队合作利用LNP递送系统建立肝炎病毒感染动物模型...
合作团队通过将体外转录后加帽的全长HAV和HEV基因组RNA包裹于LNP中,通过静脉注射的方式分别接种到Ifnar1-/-小鼠和兔子中,建立了HAV和HEV的感染模型。LNP-vRNA(HAV)感染小鼠可出现粪便排毒、肝组织核酸阳性、血清抗体阳转、血清ALT水平升高、肝脏组织病理学损伤等与临床急性甲型肝炎患者相似的临床表现及病毒学动...
mBio|清华大学基础医学院丁强团队建立虫媒黄病毒Powassan病毒细胞...
病毒复制子(replicon)是自主复制的病毒RNA,一般是在基因组中将负责病毒颗粒组装的结构蛋白基因删除,只包含执行病毒基因组复制功能的非结构蛋白基因。结构蛋白基因的缺失使其不会产生感染性病毒颗粒,可在BSL-2环境下操作[5]。为了构建POWV复制子细胞模型,丁强课题组宋晶伟博士构建一个包含分泌型荧光素酶(Gluc)报告基因...