连发三篇Nature | 一次说清血液蛋白质组学研究思路与及数据分析

●深入分析国内外大型临床队列研究的最新进展,剖析研究设计思路,并探讨蛋白质组学技术潜力方向;●揭示如何利用血浆蛋白组学技术全面解析血液生态,挖掘疾病诊断指标与治疗靶点;●分享血液蛋白质组学在临床队列研究中的应用策略,以及定量蛋白质组学技术方法;●全面介绍多组学原理和研究内容,通过蛋白组学案例分析,对...

Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略

这些发现表明,通过靶向蛋白质重新定位的方法,有可能改善疾病相关的蛋白错位现象。与此同时,研究人员探索了利用TRAM实现内源性蛋白质重新定位的能力。他们采用了CRISPR-Cas9基因编辑技术,将结合域和荧光蛋白标签插入到内源性蛋白PRMT9、SOS1和FKBP12上,使用METAP2和PARP1作为内源性细胞质和核的穿梭蛋白,并合成了能够...

克隆与表达干货4-Western Blot检测蛋白表达

将封闭的PVDF膜用TBST清洗一遍，加入稀释过的一抗液（稀释方法参考说明书）中，4℃摇床缓慢摇动孵育12小时左右。注：一抗的孵育时间可从2h至过夜（一般不超过18h）不等，取决于抗体与蛋白的亲和性和蛋白的含量丰度，建议使用较高的抗体稀释倍数和较长的孵育时间来保证特异性结合。2.8二抗杂交一抗孵育结束...

中国成人肥胖指南_减肥知识库_39健康网

结果表明:体重指数达到或大于24(BMI≥24kg/m2)者患高血压的危险是体重正常(BMI=18.5-23.9kg/m2)者的3-4倍,患糖尿病的危险是体重正常者的2-3倍,具有2项及2项以上危险因素(即危险因素聚集,主要的5个危险因素包括血压高、血糖高、血清总胆固醇高、血清甘油三酯高和血清高密度脂蛋白胆固醇降低)的危险是体重...

蛋白质组学种类的选择:质谱组学方法与技术

二维电泳质谱是一种常用的基于时间的质谱方法。它通过将蛋白质样品在两个不同的维度上进行分离,然后通过质谱仪进行质量测量。这种方法可以用于鉴定和定量复杂样品中的蛋白质。液相色谱质谱是另一种常用的基于时间的质谱方法。它通过将蛋白质样品在液相色谱柱中进行分离,然后通过质谱仪进行质量测量。液相色谱质谱具有高分...

初代timsTOF Pro单个细胞蛋白质定量突破3000大关

利用DIA-NN(MBR算法)进行library-free数据检索,可在A549、HeLa和U2OS三种细胞的单细胞样本中,分别平均定量到3008、2926和2259种蛋白质,展现了PiSPA平台在单细胞蛋白组定量分析中的覆盖深度;此外,有2869、2772和1889种蛋白质在至少80%的A549、HeLa和U2OS单细胞样本中被重复定量到,说明了PiSPA平台有很高的重复性和...

AI+Science新视野:用物理信息引导AlphaFold 2预测蛋白质动力学

用上文提到的两种方法都可以成功得到AdK的变构路径。如图3C所示,用Lid、NMP两个结构域与Core结构域分别所成的夹角来衡量变构路径,所预测的变构路径与实验及分子模拟结果一致。该方法甚至可以根据需求而给出蛋白质不同于变构路径的独特结构,相关的探索对蛋白理性设计问题具有重要参考意义。

David Baker 任科学顾问,发布世界最大蛋白质相互作用数据库!

AlphaBind则利用积累的数据，训练能够预测蛋白质序列结合的机器学习模型，通过实验测试模型并快速迭代改进，从而加速药物发现并设计更好的治疗方法。A-AlphaBio技术平台现阶段，AlphaSeq能够通过一次实验同时快速定量测量数百万个蛋白质-蛋白质结合亲和力，经过训练的AlphaBind能够根据序列预测结合强度。A-AlphaBio...

Nat. Methods. 速递:考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型

此外,文章采用定量统计学计算方法表明,模型考虑细胞类型信息后,的确会让来自相同细胞类型的蛋白表示相似度更高,反之亦然(图3a-b)。从组织层面,文章发现模型生成的组织层次表示也是合理的(图3c)。其次,研究者们选取了典型可结合蛋白对:PD-1/PD-L1和B7-1/CTLA-4,通过消融实验证实加入生物背景信息(细胞...

...| 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测

ACE技术在质谱细胞术中的验证和信号放大的定量结果(Credit:NatureBiotechnology)HEK293T细胞验证:图a展示了使用绿色荧光蛋白(GFP)瞬时转染的HEK293T细胞来验证ACE放大方法的实验设计。通过对GFP表达的细胞进行ACE放大,与常规的荧光标记抗体和免疫SABER(免疫滚环扩增)放大进行比较,验证ACE的特异性和放大效率。