53026个生命故事:华山医院郁金泰团队绘制血浆蛋白质组图谱揭示...

4.血浆蛋白质组学的诊断和预测潜力:血浆蛋白质组学有潜力作为辅助诊断工具和完善疾病风险评估,改善健康状况,提高医疗服务效率。5.因果蛋白的确定:通过整合pQTL和疾病GWAS数据,团队提供了一种利用群体水平数据发现药物的数据驱动方法,有助于确定促进治疗靶点发现的因果蛋白。6.未来发展方向:需要在动物或人类身上开...

科学家开发无柱纯化高性能蛋白质制备方法,纯度达到98%,可用于研发...

最终，相关论文以《一种单步无柱的高性能蛋白质制备方法》（Ahigh-performanceproteinpreparationapproachinasinglecolumn-freestep）为题发在TrendsinBiotechnology（IF14.30）。图|相关论文（来源：TrendsinBiotechnology）黄源是第一作者，林章凛教授（目前任职广东工业大学）和华南理工大学杨晓锋教...

打破传统蛋白质进化方法局限性:MIT团队设计新型蛋白质大模型,发现...

“我们通过少量实验数据和高效的计算模型显著提升了蛋白质活性，标志着蛋白质工程领域的一次重要突破。”谈及和团队近期发表在Science的论文，美国麻省理工学院博士生姜凯议如是说。研究人员结合蛋白质大模型、主动学习和回归模型，开发了一种创新的蛋白质工程方法EVOLVEpro（EVOlutionViaLanguagemodel-guidedVarianc...

【Cell】53,026个生命故事:华山医院郁金泰团队绘制血浆蛋白质组...

4.血浆蛋白质组学的诊断和预测潜力:血浆蛋白质组学有潜力作为辅助诊断工具和完善疾病风险评估,改善健康状况,提高医疗服务效率。5.因果蛋白的确定:通过整合pQTL和疾病GWAS数据,团队提供了一种利用群体水平数据发现药物的数据驱动方法,有助于确定促进治疗靶点发现的因果蛋白。6.未来发展方向:需要在动物或人类身上开...

...中国科大、哈佛等联合开发PocketGen模型,可高效生成蛋白质口袋

PocketGen能够建立有利的蛋白质-配体相互作用,从而为这些药物配体生成高亲和力口袋。对于PocketGen,生成的口袋中亲和力高于参考值的百分比分别为11%、40%和45%。相比之下,排名第二的最佳方法RFAA在相同情况下仅达到0%、10%和18%。总而言之,目前阶段PocketGen模型能生成如此具有高亲和力和结构有效...

ByteDance Research登Nature子刊:AI+冷冻电镜,揭示蛋白质动态

CryoSTAR是首个成功在冷冻电镜实验数据上应用蛋白质原子结构模态先验的方法，方法的主要特点有：结合蛋白质结构先验知识：CryoSTAR方法创新性地利用原子模型信息作为结构正则化来解决冷冻电镜数据中的构象动态问题，这与以往大多数仅从计算机视觉角度处理问题的方法不同(www.e993.com)2024年11月29日。它要求一个初始原子模型作为参考，将其结构信息用于...

中国科大建立新的蛋白质从头设计方法

图1.用SCUBA模型进行蛋白质设计的原理。(a)SCUBA主链能量面上的极小对应了蛋白质的可设计主链结构,即特定氨基酸序列下的最低自由能结构;(b)SCUBA中用神经网络表示的统计能量项;(c)和(d)用近邻计数(NC)-神经网络(NN)方法从蛋白质结构原始数据中学习解析能量函数的方法框架。

Nature︱细胞内的“搬运工”:揭秘蛋白质定位调控的新策略

为了有效地重新定位靶蛋白,TRAM必须与能够克服靶蛋白内在定位的穿梭蛋白充分结合,蛋白质相对再定位能力的量化将有助于合理选择穿梭-靶组合。为了开发一个定量方法来评估通过TRAM介导的蛋白质重新定位的潜力,研究人员建立了含有一系列遗传构建的多克隆细胞系,这些构建将核激素受体(GR和ERα)与已知的NES序列配对,以及将...

David Baker:从头设计蛋白的“上帝之手 ”,极大地推动了蛋白质...

美国生化学家、华盛顿大学蛋白质设计研究所所长DavidBaker,因开发能够设计出在自然界从未见过的新型蛋白质的技术获得2020年科学突破奖生命科学奖。图源:httpsipd.uw.edu/david-baker/导读昨天,诺贝尔化学奖授予蛋白设计和蛋白预测领域的三位学者。来自华盛顿大学

2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

AlphaFold尽管较传统方法有较大突破,但仍存在诸多不足,如预测结果精确度尚待提高,距离90分以上(完美预测)仍有较大差距;预测结构平均分辨率为0.66纳米(大于0.3纳米仅显示蛋白质链轮廓),与实验方法所得最佳分辨率0.1纳米(原子半径尺度,这种程度下可清晰展示单个原子位置)也存在上升空间。