【学术进展】基因组学再创新高,生命科学迎来颠覆性进展,解决历史...

1.1全连接深度神经网络DNN在基因组学中的应用举例1.2卷积神经网络CNN在基因组学中的应用举例1.3循环神经网络RNN在基因组学中的应用举例1.4图卷积神经网络GCN在基因组学中的应用举例2.无监督的神经网络算法2.1自动编码器AE在基因组学中的应用举例2.2生成对抗网络GAN在基因组学中的应用举例实操内容1.Linux操...

一种新型研究的出现,造福全人类

实操内容包括DeePMD软件的进阶使用与补充讲解,包括多GPU并行训练,LAMMPS以多GPU并行方式运行机器学习力场模型,使用Python代码快速可视化机器学习力场模型在等变与不变设计上的区别,使用多种机器学习的降维方法结合K-Means聚类从分子模拟轨迹中以低冗余方式提取多帧结构文件,NequIP模型的超参数介绍和使用,...

2024年诺贝尔生理学或医学奖揭晓,专家解读微小RNA对基因调控的作用

这些miRNA大多能定位于细胞核内，而其进一步研究发现，这些miRNA能够与增强子结合，并在全基因组的水平上激活基因表达。于文强最后表示，此次针对microRNA领域研究获奖，也意味着现在诺奖不仅仅是停留在基础研究层面，还要能进一步去解决问题，miRNA激活基因的研究无疑是下一个研究热点，将推动miRNA研究进入2.0时代。“目前...

2024 CSCO会后集锦|因知·真见精彩回看,基因组学点亮肿瘤精准医学...

目前中国血液肿瘤的基因检测常以少数基因单项检测或靶向panel为主,相比之下,全基因组测序和全转录组测序(WGTS)可在一次检测中实现对基因突变、拷贝数变异、结构变异(SV)等多种变异的检测,结合基因表达信息提供更精准、更全面的生物标志物信息以指导临床实践。JohnJiang博士以急性髓系白血病(AML)为例,基于最新的研究...

Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...

组合遗传策略作为一种新兴的研究方法,正在逐渐显现其独特价值。该策略通过综合运用多种遗传学手段,深入探究癌症的遗传机制,为癌症治疗提供新的思路。组合遗传策略是指在单一实验模型中同时操作多个遗传变量,以模拟癌症的多基因性质。这种策略不仅关注单一基因的作用,更重视不同基因间的交互作用及其对癌症发展的综合影响。

以古基因组学系统解读现代人遗传演化路径

理论上讲,这种古基因组学研究的直接方法是极其强有力的工具,可以揭示现代人基因组背后的遗传变化(www.e993.com)2024年11月18日。但是,由于目前所获得的灭绝古人类和早期现代人的基因组数据较少,这些古老群体的基因多样性并未得到全面的了解,这使得该方法的使用受到极大的限制。尽管如此,研究人员仍然利用直接方法取得了重要发现。比如,目前发现的、...

...乳酸化修饰在肿瘤进展、免疫治疗作用机制等研究思路解析

1.筛选重要的乳酸化调控位点:使用乳酸化蛋白质组学技术对样本中的蛋白质乳酸化位点进行定性定量检测,寻找实验组和对照组之间的差异乳酸化;中科新生命提供奥斯卡DIA乳酸化组产品,Astral质谱仪加持,检出位点突破19000;2.乳酸化位点的功能研究:可将赖氨酸(K)突变为精氨酸(R),构建功能缺失性突变。目前尚无模拟乳酸...

Cell 50周年专刊 | 时空组学在生物学和医学的新机遇

同时,科学家们仍在持续努力解读这部由30亿碱基对组成的生命“天书”,近年来,从细胞组学到时空组学的全面突破,使得我们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到我们身体每个细胞的全景特征,彻底颠覆了我们认知生命的方法论,为理解这部基因组“天书”、为生物学和医学研究带来了前所未有的机遇。

特别关注|非酒精性脂肪性肝病多组学研究现状

表观基因组学是研究表观遗传机制的全基因组变化,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、基因印记和非编码RNA表达。这些修饰通过调节基因的表达,影响细胞功能和特性,从而影响个体健康。表观基因组学在医学领域具有重要意义,可为早期诊断和治疗提供新的思路和方法,对NAFLD相关研究有重要的促进作用。

国自然撰写:经典分子机制研究(一)

通常是几种不同的转录因子控制一个基因的表达,一种转录因子也可以参与调控不同的基因表达调控。转录因子的数量是有限的,转录因子的组合作用方式使有限的转录因子可以调控不同的基因表达。2.研究思路2.1确定基因B启动子转录核心区域2.1.1扩增基因B上游启动子区...