独创方法提升蛋白质结构预测精度 腾讯AI Lab联合研究登上Nature子刊
所谓“从头折叠”,是相对于“模板建模”的一种蛋白质结构预测方法。“模板建模”是目前最普遍的蛋白结构预测手段,但有一个使用前提——人类已知的蛋白结构数据库(即PDB)当中,必须存在和预测的蛋白相似的结构,否则就无法使用。而腾讯AILab采用的“从头折叠”方法则跳出了这个限制,可以不依赖于模板来预测蛋白结构。...
打破AlphaFold大模型局限,世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq...
DavidBaker是华盛顿大学教授、蛋白质研究所所长。他领导团队从头开发的Rosetta算法奠定了用深度学习方法预测蛋白质结构的基础,揭开了AlphaFold和ESMFold的帷幕。A-AlphaBio成立于2017年,根据CrunchBase的数据,他们已经融资64.1M美元,旨在通过合成生物学和机器学习技术来测量、发现、预测和设计蛋白质-蛋白质相互作用,从而...
[安徽日报]中科大研究人员找出新方法 给蛋白质重新设计结构
同时,他们利用一种基于细菌细胞耐药性报告蛋白质折叠好坏的方法,来快速检测人工设计的蛋白质是否能折叠成稳定的三维结构,不仅检测效率高,还能通过实验筛选对设计做出改进。刘海燕称,该工作建立了蛋白质从头设计的新途径,其效果能够达到甚至可能超过现有最好方法,为蛋白质结构功能的设计改造提供了新工具。2014年11月06日...
拓展蛋白质相互作用研究的新视野:最新鉴定方法与技术进展
1.免疫沉淀法:通过利用特定抗体与目标蛋白结合,实现对目标蛋白的纯化和相互作用伴侣的鉴定。2.亲和标签蛋白法:通过蛋白质工程技术,将亲和标签融合到目标蛋白中,实现与结合蛋白的特异性结合。二、组学方法1.蛋白质互作组学(Protein-proteininteractionproteomics):结合质谱技术和大规模筛选方法,系统鉴定蛋白质相互...
...教授等:蛋白质-香气化合物结合作用的研究方法及影响因素研究进展
其次,同步荧光光谱法可以反映特定氨基酸所处的微环境极性,也常用以分析蛋白质构象的变化。根据前人的研究,荧光猝灭光谱法和同步荧光光谱法往往需要热力学方法辅助从而判断两者作用过程的主要驱动力,进一步探究蛋白质和香气化合物的结合机理。不同于荧光光谱法,圆二色光谱法可以得到蛋白质中各二级结构的相对含量,进而推测...
揭示蛋白质结构谜团:圆二色谱计算二级结构的方法与意义探析
2.结构演化研究通过圆二色谱计算二级结构,我们可以研究蛋白质结构的演化和进化(www.e993.com)2024年9月7日。通过比较不同物种或不同蛋白质的二级结构,我们可以揭示结构演化的模式和机制,了解蛋白质结构的起源和演变。圆二色谱计算是一种重要的方法,用于解析蛋白质的二级结构。准确确定蛋白质的二级结构对于理解蛋白质的功能、相互作用和结构演化具...
...多尺度研究院马剑鹏团队在计算生物学取得突破,实现蛋白质结构...
这一新方法能有效建立高精度的生物大分子结构模型,帮助解决药物设计中因目标蛋白结构不准而导致的新药研发失败问题。研究人员介绍,生物大分子的许多重要功能是通过其高度的柔性特质来完成的,但柔性也是负面影响结构测定精度的主要因素。在处理冷冻电镜数据的过程中,生物大分子结构柔性引起的构象多样性使得从单个样本中...
人工智能终结了蛋白质研究吗?一文读懂蛋白质折叠的前世今生
通过观察,他发现,展开或折叠错误的蛋白质可以自发地重新折叠成正确的结构。这一发现证明了蛋白质的三维结构是由内部编码(由氨基酸串的编码)决定的,ChristianAnfinsen也凭此获得了诺贝尔奖。基于这一发现,Anfinsen提出了一个假设:应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——这就是后来广为人知的蛋白质折叠...
研究人员揭示了一种治疗退行性疾病的新方法
ZIP7也是在内质网中发现的唯一锌转运蛋白,内质网是一种膜状结构,细胞在其中制造注定要运往细胞外膜或分泌出细胞的蛋白质。我们大约三分之一的蛋白质都是在这里制造的。如果说ZIP7是我们的核心,那么错误折叠的蛋白质及其处理就是本研究的主题。对于蛋白质来说,形式决定功能。仅仅拥有正确的成分是不够的,蛋白质...
...生成式AI设计抗体,蛋白质设计领域“鼻祖”David Baker的最新研究
首次用生成式AI设计抗体,蛋白质设计领域“鼻祖”DavidBaker的最新研究_腾讯新闻,davidbaker,baker,生成式ai,蛋白质,抗体,alphafold,生物医药,david