Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
基于PacBio技术的Iso-Seq能够检测长达15kb的全长转录本cDNAreads,这有助于发现大量先前未注释的转录本,并通过全长测序确认了早期基于跨物种同源序列的基因预测结果。在标准的Iso-Seq实验流程中,模板置换逆转录酶可以将高质量RNA转化为用来测序的全长cDNA。然后将得到的cDNA进行PCR扩增,并构建PacBio单分子实时(sing...
无创DNA检测跟羊水穿刺要怎么选择?
香港无创DNA检测是通过抽取孕妇的静脉血,从中提取游离的DNA片段,采用新一代高通量测序(NGS)技术,通过序列比对将这些染色体片段精确定位到每个染色体上,便可以筛查胎儿染色体异常状况。羊水穿刺是用穿刺针经腹壁、子宫壁穿刺到羊膜腔内,抽取羊膜腔中的羊水(含胎儿的脱落细胞、酶、病原体、代谢产物等)用于生化、细胞...
cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量
DNA甲基转移酶(DNMTs)是一类在细胞中起关键作用的酶,可以调控DNA甲基化。DNMT主要负责向DNA中的胞嘧啶残基添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,从而实现DNA甲基化。DNMT能够与DNA结合并识别靶DNA序列,通常是CpG。一旦DNMT与靶DNA序列结合,它们就会将甲基从SAM供体转移到DNA中的胞嘧啶碱基。该过程涉及形成共价键,将甲基添加到胞...
【云飞杂记】真菌传之测序
实际上,rRNA是一种酶,在核糖体内部负责蛋白质合成。rRNA由rDNA转录而成,是细胞内所有RNA的主要形式,大约占总体RNA的80%左右。核糖体中rRNA约占60%、蛋白质约占40%。相对而言,rDNA保守,而ITS承受的选择压力较小,进化速度较快,具有很高的可变性,且在核基因组中高度重复,这样可以根据保守序列中的变异位点设计特殊...
加快发展新质生产力·一线调研|“DNA存储”锻造合成生物学“底层...
DNA合成是合成生物学领域的关键基础性技术。沈玥说,华大深耕基因测序领域,其“解码”DNA即“读”的能力具备世界领先优势。“写”DNA相当于重新“编码”遗传信息,让生命体和细胞行使新的功能,可以理解为,一个细胞如何生长、生成什么都是可控的。华大展厅里,一个形似珊瑚的模型引人注目。“这是酵母的基因组染色体...
数字PCR应用丨naica??微滴芯片数字PCR技术定量DNA标准品助力...
作者已经证明,通过将NGS与可量值溯源标准品的dPCR方法串联,并通过使用Vibrio-Sequins标准品,实现了混合样本中几种弧菌DNA的精确定量(www.e993.com)2024年10月18日。因此,该方法可能应用于定量宏基因组样品中未知数量的DNA,从而能够检测痕量的弧菌DNA。Vibrio-Sequins的实施以及NGS与dPCR的联合应用,将提高现有宏基因组测序方法的准确性。
人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化
酶的DNA可及性是用于定量染色质可及性的技术基础。这些酶既可以切割可及DNA(DNase-seq和ATAC-seq),也可以甲基化可及胞嘧啶(NOMe-seq),这两种酶都可以通过高通量测序进行检测。将这些方法应用于微量(low-input)和单细胞(single-cell)应用,能够对人类胚胎的染色质可及性进行分析。
病原靶向测序(tNGS)——一种快速崛起的感染性疾病诊断方法
mNGS检测获得的常规数据量中特定微生物的序列数一般不足样本总序列数的5%,特异性序列覆盖度通常不到特定微生物基因组的1%,因此几乎不可能用于特定微生物的耐药基因及毒力基因进行突变分析。而tNGS可以通过引物或探针对耐药基因及毒力基因进行富集测序,检测出耐药及毒力[2-4]。
解码重庆生态智治④|环境DNA技术——只需一瓶水,便知江里有哪些鱼
据介绍,环境DNA技术通常指直接提取环境样本中的总DNA,使用特异或通用引物进行聚合酶链式反应(PCR),通过高通量测序和生物信息学分析,来识别环境中目标物种序列的生物监测手段。“DNA作为遗传信息存在于生物的每个细胞中,当个体于所处环境活动时,生物体会通过排泄、表皮脱落、体液分泌等方式将DNA释放到环境中。所以...
详解丨基因KO了,蛋白还残留?|细胞|抗体|特异性|转录本|蛋白质...
构建基因敲除(KO)细胞时,明明DNA测序已经产生了移码的indel,但用WesternBlot检测蛋白还是不理想,到底是什么问题呢?图1敲除前后,WB条带无差异1.首先考虑抗体特异性。在评估基因过表达或干扰效果时,抗体能够检测到条带差异即可,对于非特异性条带的容忍度较高。然而,对于确认基因是否被完全敲除,非特异性条带...