Dev Cell | 范衡宇实验室揭示RNA解旋酶MTR4介导的RNA监管机制决定...

生信分析表明,MTR4缺失后核中滞留的转录本多为加工不完全的废物RNA,部分内含子异常保留的转录本甚至被进一步运输到胞质中。通过在Mtr4敲除的卵母细胞中显微注射回补MTR4,检测到异常累积的转录本含量明显减少,证实了MTR4介导的RNA监管机制在监管RNA质量和维持RNA正常的核质分布比例中发挥直接作用。

生研院范衡宇实验室Developmental Cell发文揭示RNA解旋酶MTR4介导...

生信分析表明,MTR4缺失后核中滞留的转录本多为加工不完全的废物RNA,部分内含子异常保留的转录本甚至被进一步运输到胞质中。通过在Mtr4敲除的卵母细胞中显微注射回补MTR4,检测到异常累积的转录本含量明显减少,证实了MTR4介导的RNA监管机制在监管RNA质量和维持RNA正常的核质分布比例中发挥直接作用。图2:MTR4缺...

Nat Methods丨scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因组复杂...

其中,该研究在GM12878细胞系中发现编码RNA甲基转移酶的METTL8基因内含子区域存在多个增强子元件之间的H3K4me3修饰共占位事件。据之前的研究报道,METTL8在GM12878细胞中特异的高表达,这暗示METTL8基因上的多个增强子之间的直接互作共同调控了METTL8在GM12878细胞中的转录活性。和基于二代测序平台的方法scCUT&Tag类似,sc...

RNA疗法的研究和临床进展

Leber先天性黑矇(LCA)由于包括中心体蛋白290(CEP290)在内的各种基因的内含子突变,导致视网膜营养不良,引起青少年失明或严重视力损害。QR-110是一种单链、硫代磷酸化、2′O-甲基修饰的剪接调节RNA寡核苷酸,用于靶向CEP290。临床研究(NCT03140969和NCT03913143)显示,玻璃体内注射QR-110可以重建LCA患者成纤维细胞中的CEP2...

干货分享:蛋白质融合表达的标签及切割研究汇总

在大多数情况下GST融合蛋白是完全或部分可溶的。推荐采用位点专一的蛋白酶如凝血酶或Xa因子从融合蛋白切除GST标签。蛋白酶解后,GST载体和蛋白酶通过谷胱甘肽琼脂糖亲和层析去除。GST标签可位于N端或C端,可用于细菌,酵母,哺乳细胞,和杆状病毒感染的昆虫细胞.。GST融合蛋白已成为分子生物学家的基本工具。

马铃薯液泡转化酶基因受低温诱导高度上调表达之谜揭开

研究人员发现,液泡转化酶基因在马铃薯低温糖化过程中起着至关重要的作用,其在常温块茎中的表达量始终维持在很低水平,但在低温块茎中显著上调表达(www.e993.com)2024年11月15日。研究人员从先前构建的马铃薯全基因组超敏感位点图谱中检测到一个位于液泡转化酶基因第二个大内含子的超敏感位点,推测该超敏感位点可作为增强子调控液泡转化酶基因的表达;研...

...| 植保学院朱旺升教授团队揭示双重亚细胞定位的β-葡萄糖苷酶...

中国农大新闻网讯11月27日,中国农业大学植物保护学院朱旺升研究团队在国际知名期刊《植物生物技术杂志》(PlantBiotechnologyJournal)在线发表了题为《双重亚细胞定位的β-葡萄糖苷酶赋予玉米病虫害抗性和生长平衡》(Adual-subcellularlocalizedβ-glucosidaseconferspathogenandinsectresistancewithoutayieldpenalt...

作为丝氨酸蛋白酶中的一个家族,颗粒酶具有哪些特性?

颗粒酶亚家族具有胰蛋白酶样、糜蛋白酶样和弹性蛋白酶样特异性,它们的基因分别集中在“胰蛋白酶”位点、“糜酶”位点和“met酶”位点上,这些基因簇有它们自己的特性。例如,在小鼠和人类中,颗粒酶M基因AZU和PR3的内含子1都位于先导序列的-7和-6之间,表明进化密切关系在人类中,编码颗粒酶B和H和组织蛋白酶G的...

中国科大在经典核酶的自剪接机制研究取得重要进展

自剪接内含子(核酶)是具有催化活性的RNA,主要参与RNA的加工与成熟。与蛋白酶类似,核酶也会折叠成高级结构发挥功能。RNA在一级序列的基础上形成局部的helix、loop等二级结构元件,再在金属离子的帮助下进一步折叠成具有酶活中心的三级结构,在无需蛋白质的情况下催化反应。但由于RNA的异质性和灵活性,使RNA结构的解析受到...

Trends Genet | 表型进化的分子基础:超越常见的疑点

虽然保守外显子-内含子连接处的突变很容易影响RNA剪接并可能导致表型改变,但新出现的例子表明,不位于正常剪接位点的外显子和内含子SNP也可能引发替代剪接或影响剪接效率。例如,MSX2A基因编码一种与成骨细胞分化有关的同源域转录因子,它是造成海洋三刺刺鱼与淡水同类背脊长度差异的原因。前者产生全长MSX2A转录本,而后...