中国科大揭示Lon蛋白酶在单个蛋白水解位点对底物进行持续切割
Lon组装成同源六聚体复合物,每个单体中包括共价连接的N端区域、AAA+(与多种细胞活动相关的ATP酶)域和蛋白酶域。晶体结构表明,AAA+和蛋白酶结构域形成一个封闭的腔室,六个ATP酶位点朝外,六个蛋白水解活性位点朝内。已有研究表明了与共价抑制剂结合的蛋白水解活性位点的结构,然而,与蛋白酶活性位点结合的底物结构尚未...
ACS Catalysis:华东理工大学D-氨基酸脱氢酶创制与应用新进展
图片说明:分层改造突变位点的选择(A&B)及进化路线图(C)该论文采用分层改造策略,对来自嗜热芽孢杆菌的DAPDH酶活性口袋进行分子改造,获得了对多种大位阻α-酮酸底物催化性能显著提升的D-氨基酸脱氢酶。最佳突变体M5对大位阻苯甲酰甲酸底物的比活力达到1.65Umg????,是母本的275倍,其产物D-苯甘氨酸是生产头孢菌...
蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得新进展
近日,西北农林科技大学信息工程学院李富义教授团队在蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得重要研究进展,研究论文“ProsperousPlus:aone-stopandcomprehensiveplatformforaccurateprotease-specificsubstratecleavagepredictionandmachine-learningmodelconstruction”在线发表于《BriefingsinBioinformatics》。
...SARS-CoV-2 刺突蛋白多碱基裂解位点的连续糖基化调节病毒活性
总的来讲,GalNAc-T3和T7的活性可能是在重组刺突蛋白上鉴定出的O-糖基化位点的原因,这些位点是T678、S686和S689。GalNAc-T3和T7抑制刺突蛋白的弗林蛋白酶加工为了测试GalNAc-T3和T7引发的O-糖基化是否可以抑制细胞中S蛋白多碱基裂解位点的蛋白酶加工。首先构建了一个基于荧光素酶的生物传感器,该传感器编码夹...
科研人员在蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得进展—新闻...
近日,西北农林科技大学信息工程学院李富义教授团队在蛋白酶特异性底物裂解位点预测方面取得重要研究进展,相关成果在线发表于BriefingsinBioinformatics。了解蛋白酶的特异性底物裂解是准确了解蛋白酶功能机制的基础。蛋白酶的底物特异性通常可以通过肽特异性分析或高通量质谱技术来识别,但实验手段鉴定蛋白质裂解比较困难、耗...
...等:蛋白核小球藻胰脂肪酶抑制肽的分离纯化、鉴定及其降脂活性
FLGPF与PTL蛋白也存在范德华力(www.e993.com)2024年9月15日。相关研究发现底物(脂类)与胰脂肪酶活性中心催化位点Ser152、His263、Asp176相结合,而分子对接结果显示FLGPF与酶催化活性中心之外的位点Arg79、Trp252、Tyr114相结合,符合非竞争性抑制作用特征,此结果与图12所示的抑制动力学结果一致。
干货| 酶切实验切开 or 切不开,真的是玄学吗?
??标准底物检测酶活性。-反应条件不合适-??检查各组分添加量、反应温度、反应时间是否为最佳。-反应条件不合适-1.模板DNA不纯??模板DNA中含有SDS、酚、EDTA等酶切抑制因子,可将DNA过柱纯化。2.内切酶对甲基化敏感,底物DNA酶切位点上的碱基被甲基化??甲基化的DNA可耐受部分限制性内切酶的...
2024年6月小分子药物专利-吉利德小分子 GLP-1R 激动剂 GS-4571
与物种间Polθ的高序列同源性一致,在跨物种测试时,用化合物A观察到了类似的Polθ抑制作用(大鼠,pIC50=8.0;狗,pIC50=7.8;小鼠,pIC50=7.8;猴,pIC50=7.9)。在酶活性测定中测量Polθ重组解旋酶结构域的ATP酶活性。由ATP底物产生的ADP通过与NAD+产生相关的偶联酶测定来确定。
【科技前沿】丁建平组发现乳酸脱氢酶D是一个广谱性的D-2-羟基酸...
LDHD的酶学性质、活性位点识别底物的结构基础、以及催化反应的分子机制。a.LDHD催化D-LAC的饱和曲线;b.LDHD对不同底物和类似物的催化活性;c.LDHDFAD+Mn+D-LAC结构中底物结合位点的表面电势示意图,底物结合位点由亲水性的subsiteA和疏水性的subsiteB组成;d.LDHDFAD+Mn+D-LAC结构中D-乳酸、FAD、Mn2+和...
从蛇毒中获得灵感,这款开启高血压治疗新纪元的疗法是如何诞生的?
首先,它们的活性位点都含有一个紧密结合的锌原子,能与待切割的肽键相互作用。其次,这两种酶的作用机制还都是从肽底物的羧基末端切割氨基酸。两者的区别在于,ACE切除的是肽底物末端最后的两个氨基酸,而羧肽酶仅切除肽底物末端的一个氨基酸。一个大胆的想法在库什曼博士脑中浮现:这两种酶如此相似,或许羧肽酶A抑制剂的...