不改变DNA序列即可实现精准基因调控,一文了解表观遗传编辑技术的...
表观遗传学指的是一种可逆的遗传机制,它可以在不改变DNA序列的情况下,通过对DNA与组蛋白(histone)的修饰来影响基因表达,这是控制细胞分化和胚胎发育等关键生物过程的重要机制。在不同类型的表观遗传修饰当中,DNA甲基化(methylation)是其中最被广为研究的机制之一。基因启动子区域上的特定DNA甲基化会抑制该基因的转录...
Cell重磅发现:新型DNA调控元件——促进子,促进增强子对基因表达的...
增强子(Enhancer)就是DNA中的一种调控元件,它们位于基因之间,在不同的时间和水平上以不同的组合来开关基因。尽管在40多年前就发现了增强子,但其工作原理仍然没有完全被理解。最近还发现了“超级增强子”(SuperEnhancer,SE),它们是多个单独的调控元件组成的团队,共同驱动非常高水平的基因表达,超级增强子通常是细胞身...
10分+ 使用单细胞数据预测序列模序对基因调控的影响
以前开发调控基序定量模型的尝试仅限于组织水平或细胞系或免疫细胞,并且他们经常使用组蛋白标记而不是序列来预测表达水平。与现有主要识别序列中过度代表性的基序的分析方法不同,scover还确定了每个基序对基因表达的相对影响。通过与基因表达水平进行比较,这些分数可用于查明与观察到的模式相关的推定TF。卷积神经网络可用...
科学家揭示IKAROS调控基因组3D结构机制,为多领域提供理论指导
基于基因增强子远程调控基因表达的特征,他们推测IKAROS可能通过控制基因调控元件之间的远程物理连接来发挥功能,并以此影响更高级别的基因组3D结构。为了验证这一猜想,建立了B细胞发育阶段特异性的基因敲除小鼠模型、前体B细胞体外诱导基因敲除、体外分化模型,以及人上皮细胞异位诱导基因表达模型。并且,在此基...
清华团队揭示L1反转录转座子的转录活性调控染色质拓扑结构域边界...
转座子曾被称为基因组中的“暗物质”,转座子活性与多种疾病和发育密切相关,但其具体生物学功能仍不清晰。转座子在人基因组中约占50%,其中L1反转录转座子约占人基因组的17%,是目前人体内唯一活跃的并且能够自主转座的转座子。L1在基因表达调控、基因组变异、疾病发生以及个体发育过程中均发挥重要作用。但是,...
妇女代表上头条丨彭琴:破解基因密码,揭开生命神秘面纱
彭琴,深圳湾实验室特聘研究员(www.e993.com)2024年7月6日。主要研究染色质活细胞成像技术及基因表达调控机制,并开发针对肿瘤等重大疾病的诊疗新技术和新工具。“知止而后有定,定而后能静,静而后能安,安而后能虑,虑而后能得”这是彭琴求学与工作中自始至终遵循的准则18年前...
科学家建立全脑甲基化和三维基因组图谱,为大脑提供分子百科全书
如果将大脑比喻为交响乐团,每种细胞就像在合奏同一曲目、但各有分工的乐器。对应到基因表达调控或表观遗传学,大脑的细胞都有近乎相同的基因组序列,但是每个细胞的基因组在不同的位置活性不同,所以导致它们的基因表达呈现出多样性,并且最终变成不同的细胞。为了充分理解大脑细胞复杂的多样性,该团队的核心思路是通过...
GIPR蛋白:糖和脂肪代谢的重要调控者,糖尿病、肥胖症“救星”?
GIPR在胰腺细胞、胃、小肠、脂肪组织、肾上腺皮质、心脏、垂体、骨骼、肺和脾脏等组织均有表达。在胰岛中只有a和β细胞表达GIPR。GIPR通过激活G蛋白,活化的G蛋白使细胞内cAMP水平和Ca2+水平提高,通过PI3K、PAK、PKB等信号通路对下游基因进行表达调控[2-4]。当人体摄入食物后,GIPR信号能够促进胰岛素的分泌,从而使得...
基因检测:构筑超越百岁之道的新维度
FOXO3属于“转录因子”家族,转录因子负责调节其他基因的表达方式——也就是说,调控它们是被激活还是被沉默。我觉得转录因子更像是细胞维护部门。它的职责很广泛,涉及各种细胞修复任务,调节新陈代谢,照顾干细胞,以及各种其他类型的内务管理,包括帮助处理细胞废物或垃圾。但它自己并不做繁重的工作,比如拖地、擦洗、小面积...
IF 10.5|大黄基因组为蓼科植物基因组进化和蒽醌积累提供见解
该研究构建了药用大黄高质量的同源四倍体基因组,探究了蓼科植物如荞麦和藜科植物的基因组进化与重要基因家族的演化,解析了转座子在基因组进化、基因拷贝数变异和基因表达调控中的重要作用,并揭示了药用大黄根中高蒽醌含量的遗传学基础。安诺优达为本研究提供测序服务。01研究背景药用大黄(Rheumofficinale)是蓼科...