2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项

TBM又称同源建模,它利用新蛋白质初级结构与PDB中已有三维结构蛋白质的氨基酸序列比对结果为基础构建模型,并进一步完善,准确性取决于新蛋白质和PDB中蛋白质的进化距离,如果PDB缺乏新蛋白类似结构域的已知结构,则无法生成准确模型。FM又称从头计算方法,利用能量函数计算氨基酸空间相互作用,最终从所有可能结构中选取最佳形式,...

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?

在蛋白质结构预测领域,Folding@Home便是一项知名的“模拟派”项目,它由斯坦福大学教授VijayPande于2000年发起,联合全世界志愿者的计算机来构成一个超大的分布式计算机,它同时也是全世界第一台exaflops级别(每秒进行1018次双精度浮点数计算)的超级计算机。这样强大的算力使得Folding@Home能够对蛋白质折叠过程进行原子...

2024 年诺贝尔化学奖:又又又双叒叕是 AI?

那现在给大家出一个简单数学题:假设有100个氨基酸组成蛋白质,那就需要99个肽键,99个肽键有两种不同角度的结构,同时不同角度还会有三种可能的稳定结构,那就是3的198次方种可能,你要是慢慢穷举,从宇宙爆炸到现在都数不完,这就是利文索尔悖论——蛋白质结构非常非常多样,没办法用穷举来算完。氨基酸...

...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...

这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互...

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴

事实上,自1970年代以来,通过实验方法来确定蛋白质结构在不断进步,精度不断提高,特别是冷冻电镜技术得到应用后,结构生物学得到了长足的发展。通过实验方法确定的蛋白质结构也被认为是标准答案。不过这些实验方法非常耗时耗力,据估计,用实验方法确定一个蛋白质结构需要10万美元和长达数月的时间[2]。因此,如果能设计一...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

大脑不同区域的结构与功能连接关系随功能类型变化光流解析揭示大脑如何感知自我运动中的物体运动全身麻醉如何影响大脑预测与意识的联结机制大脑决策中的神经活动可能与选择无关█认知科学一次性合作的决策,不受收益的影响量子计算与机器学习融合:突破多体物理学难题...

深度| 为什么说想了解AI+合成生物学,必须先搞懂蛋白质?

在这长达半个多世纪的时间里,传统方法之下的蛋白质合成领域进展非常缓慢,仅解析出约15万个蛋白质,只覆盖了人类蛋白质序列中17%的氨基酸残基。并且传统方法下的科研人员需要使用实验仪器亲自测量蛋白质的三维结构,耗费了大量的时间和成本,甚至还不一定准确。

手表能发现致命打呼噜?这类人最需要这个功能

手表和手环的血氧读数,精度稍低于医用血氧计诊断OSA时,血氧饱和度是其中一项重要指标,它一定程度上代表了身体是否缺氧。血氧饱和度是个百分数,为血液里携带氧气的血红蛋白占所有血红蛋白的比例,正常人通常为95%~100%。最准确的测血氧方法是穿刺动脉取血,进行血气分析。但穿刺疼痛又有风险,显然不适合在夜间反复进行...

深市上市公司公告(4月8日)

可调整的Y向限位结构,使得辅具工作面精度达到0.1mm,满足了仪表自动取料对仪表管梁的高精度需求。动力源从辅助自动打开系统的传动轴至仪表夹持辅具系统的转动销,再到辅具手动打开把手,移动导向销,定位销固定板,最后至定位销上的动作传递结构,实现了仪表板管梁的自动脱离,满足了仪表自动取料对管梁自动脱离的需求。

影像未来,见所未见|第一届化学成像前沿科技及应用高端论坛成功举办

报告题目:正常和OA关节的骨软骨界面高清结构解析及其病理演变机制研究人体膝关节的“骨-软骨”界面组织,结构成分复杂,受力严酷易发生材料失效,进一步可引发骨关节炎(OA)。王小召博士后研究员利用多种微纳米分析技术,探究了正常和OA组织中骨软骨界面的结构解析及病理演变机制,为潜在的治疗靶向策略提供新方向。