不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|蛋白质是具有数亿种不同形状的分子。从在血液中携带氧气到引发化学反应,每一种蛋白质都具有特定的生物功能。功能通常由其形状或结构来定义。(来源:RCSBPDB)当谷歌将这一消息推向世界时,媒体为之疯狂。头条新闻宣称AlphaFold2“将改变一切”。那些毕生致力于研究单个蛋白质结构的蛋白质生物学家担心自己会失业。
中国科学家建立了新的蛋白质从头设计方法
理论计算和实验证明,用SCUBA设计主链结构,能够突破只能用天然片段来拼接产生新主链结构的限制,显著扩展从头设计蛋白的结构多样性,进而设计出不同于已知天然蛋白的新颖结构。“SCUBA模型+ABACUS模型”构成了能够从头设计具有全新结构和序列的人工蛋白完整工具链,是RosettaDesign之外目前唯一经充分实验验证的蛋白质从头设计方法,...
蛋白质摄入
2020年,谷歌旗下公司DeepMind发布了AlphaFold,实现通过靶点蛋白质的序列来预测三维静态结构,成功解决了生物学界50年的难题。今年5月,DeepMind发布了升级后的AlphaFold3
深入解析:翡翠蜘蛛网结构及其图片与图解
这种纤维状结构使得翡翠具有良好的蛋白质韧性和耐用性。与其他宝石相比,翡翠非常坚硬,不容易受到外界力量的有机破坏。这也是为什么翡翠在珠宝行业中被广泛使用,被用来做各种饰品,如手链、项链、戒指等。翡翠的样的纤维状结构也赋予了它特殊的矿石光学效应。翡翠具有类似于像牙的石头细腻纹路,这是由于光线在纤维结构中...
《自然》子刊:蛋白质结构预测新算法可大幅提高预测效率
全新的算法策略不仅能更好适配到蛋白设计、大规模虚拟筛选等需要频繁预测蛋白结构的任务中,且在多肽、抗体、纳米抗体等与大分子药物设计更相关的高可变蛋白场景上,效果也较优。这一算法还被应用于业界公认的抗原抗体匹配的任务中,为新冠病毒的刺突蛋白准确预测了抗原抗体对接面,预测的复合体构象与真实实验值的重合度...
诺奖剑指AI?谷歌蛋白质结构预测模型获2023年拉斯克奖
基础医学研究奖:AI系统精准预测蛋白质结构基础医学研究奖获得者(www.e993.com)2024年7月24日。图片来源:拉斯克奖官网DemisHassabis博士和JohnJumper博士领导AlphaFold团队借助人工智能(AI)系统成功解决了蛋白质结构预测难题,实现了准确性和速度的巨大突破。蛋白质在细胞内扮演关键角色,其功能与三维结构紧密相关。虽然60多年前科学家确定氨基酸序列...
...张文涛博士等:超声功率对牛肉干品质及牛肉肌原纤维蛋白结构的...
剪切力的降低可能是空化作用的破坏性和声波振动导致的肌肉纤维结构弱化引起的,也可能是超声作用破坏溶酶体,释放出可以促进蛋白质降解的钙激活酶和组织蛋白酶,进而改善了质构特性。04超声功率对牛肉条微观结构的影响如图2所示,随着超声功率的增加,肌纤维排列变得散乱,肌束间间隙增大,肌肉结构变得松弛,甚至发生细胞破裂...
上交团队开发蛋白突变结构和能量预测模型,将AI蛋白计算效率提升1...
蛋白分子突变与其特性和众多疾病具有明确的因果关系,因此准确预测蛋白质突变,对功能性质造成的影响至关重要。然而,三维结构的稀有性和复杂性严重限制了蛋白质性质功能预测模型的开发和应用。同时,基于结构信息的计算速度较慢,而通过序列进行模型构建对特征提取和算法具有非常高的要求,开发效率极低。
2024CMC-China博览会全日程曝光,贯通生物医药全产业链
◎CMC开发中的产品相关及工艺相关杂质问题◎稳定细胞株筛选及放大的成本效率的考虑◎质量分析方法的开发案例◎关键质量属性研究◎抗体CMC全生命周期管理◎工艺变更易忽略点◎可开发性评估◎抗体蛋白药物工艺开发策略08/15主题一多肽及GLP-1药物未来发展趋势...
Nature Plants | 清华大学孙前文实验室揭示植物异染色质染色中心...
通过对各物种中的ADCP1同源蛋白进行序列比对分析,发现ADCP1蛋白在不同植物中则存在显著的序列差异(图1a和b):在白菜、萝卜等十字花科植物以及醉蝶花中,ADCP1同源蛋白的序列与拟南芥中的ADCP1具有相似的结构特性(3对Agenet结构域通过两个linker连接),这些物种具有与拟南芥类似的典型染色中心(图1a和b);而在与...