为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,...
为什么诺贝尔化学奖又被人工智能学者拿了:阿尔法折叠,蛋白质结构...
它能从蛋白质的一级结构,即氨基酸序列的组合,来预判1)蛋白质的二级结构,即蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构;2)三级结构,即在二级结构基础上多段进一步折叠盘绕后形成的特定空间结构;3)四级结构,即蛋白质-蛋白质复合形成的结构,是更为复杂的生物大分子。AlphaFold系列对蛋白质结构与功能的预测,有望对人类在...
2024诺贝尔化学奖解读:他们破译了蛋白质令人惊叹的结构之谜
在蛋白质中,氨基酸以长链的形式相互连接,形成三维结构,这是蛋白质功能的关键。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图从氨基酸序列预测蛋白质结构,但这被认为是极其困难的。然而,四年前由戴米斯·哈萨比斯和约翰·江珀实现了一个惊人的突破。戴米斯·哈萨比斯其实是从游戏领域“跨界”来到化学领域。出生于1976年7月,四...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
第一步:贝克依赖于他们开发的Rosetta蛋白质结构预测算法,可以预测氨基酸序列在形成蛋白质时可能采取的三维结构。第二步:利用这个工具,他们针对随机生成的一系列氨基酸序列进行结构预测,这些序列都是在自然界中未被观察到的。如果预测结果显示出合理的蛋白质结构,那么这条氨基酸序列就会被保留下来,反之则抛弃该序列。第...
AI再问鼎诺贝尔化学奖!48岁DeepMind创始人因蛋白质结构预测摘桂冠
接下来,蛋白质的奇妙之处就体现出来了:氨基酸链会扭曲并折叠成一个独特的,有时甚至是独一无二的三维结构,正是这种结构赋予了蛋白质的生物功能。蛋白质可由十几个到几千个氨基酸组成,氨基酸链会折叠成特定的三维结构,而这种结构决定了蛋白质的功能有些蛋白质成为生命体的基本单元,可以构建肌肉、角或羽毛,而其他...
AI革新蛋白质设计,药物设计潜力凸显
在生命科学,尤其是创新药物研发领域,蛋白质设计优化是早期研发阶段非常重要的环节之一(www.e993.com)2024年10月17日。由于蛋白质结构复杂,传统技术限制下蛋白质设计优化不仅耗时较长,且成本高昂,是创新药研发的技术难点之一。AI技术的注入颠覆原有蛋白质设计的工作模式,大幅提升研发效率和成功率。此次诺奖化学奖获得者均利用AI技术在蛋白质设计与...
诺奖得主David Baker学生沈浩署名文章:蛋白质设计究竟是什么?
此外,贝克团队还基于AlphaFold框架开发了自己的开源程序RosettaFold,并结合扩散模型推出了RFDiffusion,用于生成全新蛋白质结构。两者的结合成为蛋白质设计的两大核心工具。当然,蛋白质设计领域广阔,不同应用场景需要不同的结构设计,这不仅需要天马行空的想象力,还需要对特定问题有深入理解并掌握扎实实验技术的团队共...
2024年诺贝尔化学奖也与AI领域有关!三位蛋白质研究科学家获奖
蛋白质通常由20种氨基酸组成,可以以无数种方式组合。利用DNA中存储的信息作为蓝图,氨基酸在人体细胞中连接在一起形成长链,并扭曲折叠成独特的三维结构,正是这种结构赋予蛋白质功能。一些蛋白质成为可以制造肌肉、角或羽毛的“化学构件”,而另一些则可能成为激素或抗体。它们中的许多部分形成酶,以惊人的精度驱动生命的...
PNAS:颜宁团队以《荷塘月色》为灵感,报道结构生物学研究新范式
由于TLP-1原纤维是从环境中收集的,预测结构与TLP-1相似的蛋白在UniProt数据库中都没有特定的功能注释。虽然对实验结构没有得到任何相似的折叠,但他们在检索到的许多相近序列中发现了一个有趣的特征,即所有检索到的细菌起源的实验结构都是通过DSE机制组装的菌毛。
2024年诺贝尔化学奖揭晓:AI破解了几乎所有蛋白质密码
财联社10月9日讯(编辑牛占林)当地时间周三(10月9日),瑞典皇家科学院宣布,将2024年诺贝尔化学奖授予大卫·贝克(DavidBaker)、戴米斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·江珀(JohnM.Jumper),以表彰他们在蛋白质设计和蛋白质结构预测领域作出的贡献,这些技术有潜力改变药物开发的方式,并且能够提高我们对生物学的理解...