Nature | 背靠背揭示结直肠癌的基因组特征
(3)特定驱动基因(如BRAF、TP53、SMAD4、PIK3CA和KRAS)在免疫原性较低的患者中突变频率显著较高,提示免疫编辑影响驱动基因景观。免疫逃逸机制:(1)在MSI和POL肿瘤中,多个基因(如TAP2、B2M、IRF1、TAP1、HLA-A、HLA-B和HLA-C)被正式且独立地归类为CRC驱动基因,且这些基因在MSI肿瘤中信号最强。(2)在MSS肿瘤中,...
科普|中药可以调控人体基因吗?
因此,从现有的研究来看,中药不仅在加工炮制后仍含有丰富的miRNA,而且这些miRNA能够通过口服后被吸收入血,发挥基因调控作用。有研究表明甘草中的miRNA对人免疫细胞基因表达具有明显的调节作用;在新冠病毒流行期间,有研究团队发现金银花汤剂中的miR2911能够抑制病毒复制,加速感染患者转阴等。中药miRNA跨界发挥作用的主要原因之...
Nature | DNA甲基化:从星形胶质细胞到神经干细胞的转化之钥
DNA甲基化与神经干性相关基因的调控研究表明,在健康状态下,星形胶质细胞中的DNA甲基化会抑制与神经生成相关的基因表达,维持其胶质细胞的特性。然而,在缺血性损伤(ischemicinjury)发生时,DNA甲基转移酶DNMT3A的表达增加,导致神经生成相关基因去甲基化(demethylation),从而激活这些基因,促进星形胶质细胞向神经干细胞的转化。
野萝卜MADS-box家族,其开花调控基因的筛选及功能分析,有何作用
花器官特征基因的激活,伴随着上游分生组织特征基因信号的传递,花离散区域内与花器官特征有关的基因相继被激活。花器官的形态建成,受花器官特征基因的影响,与花器官形态建成有关的基因开始大量表达,花器官各部分细胞和组织出现分化。植物在不同阶段由多个基因、多条途径进行复杂且精细化的调节,从而共同影响并决定植物...
...清华大学刘念团队发现转座子LINE-1转录选择性激活远程基因表达
有意思的是,很多的LINE-1表达调控因子与增强子调控和功能相关(KMT2D、CTBP1、METTL3、METTL14等),这提示LINE-1可能具有增强子活性。通过系统挖掘全基因组自转录活性调控区测序(STARR-seq)数据,研究团队发现LINE-15'UTR具有增强子特征,可以通过不依赖其位置或方向的方式激活基因表达。
Cell Geno:科学家在理解人类精神分裂症遗传特征上取得重大进展
那些有可能对精神分裂症发病有重要影响的生物活性的突变区分开来,这一点并不容易,其中原因有几个,其中之一就是遗传变异通常遗传自父母亲那里,因此,紧挨着的两个遗传突变或许就与精神分裂症的发生有关,一个可能对于在精神分裂症中扮演重要角色的基因表达非常重要,而另一个突变则可能在精神分裂症发生过程中并没有发挥...
通过MAML2基因融合检测案例,了解黏液表皮样癌
研究表明,MAML2基因重排阳性的MEC患者与阴性病例相比,表现出良好的病理特征(图6):如患者年龄较轻,肿瘤较小,淋巴结转移率、临床分期、组织学分级均较低,总生存期和无瘤生存期较长[6]。图6.黏液表皮样癌中MAML融合伴的临床病理表现3.黏液表皮样癌还需关注哪些治疗指标?
浅谈拟南芥rty基因,了解在草莓中的异源表达,及对耐旱性的影响
rty的基因表达可以阐明其对生长素浓度的直接或间接调控,并阐明该位点对植物生长发育的影响,包括不定根和侧根的形成,以及枝条的受控扩展。二、ABA在植物对干旱胁迫的反应rty编码的氨基转移酶也对脱落酸有反应,由于生长素和ABA生物合成和代谢途径之间的串扰,脱落酸的水平升高。
Adv Sci | 喜讯!浙江大学汪海峰团队发现IUGR仔猪在肝损伤中存在...
2.仔猪与人肝脏综合单细胞转录谱的高同源性研究通过单细胞RNA测序分析了正常和宫内生长受限猪仔的肝脏,发现猪和人类肝脏的细胞结构和分子特征高度相似。研究识别出22个主要细胞群,并使用经典标志物验证了细胞类型。将猪和人类的单细胞数据整合后,发现两者在免疫和非免疫细胞中的基因表达模式有显著重叠,且调控细胞分化...
刘小平/常啸团队Patterns:新算法通过矩阵分解以推断细胞间通信
单细胞的基因表达通常由两条路径控制:一方面,基因可以被同一细胞中的其他上游基因或因子直接调控;另一方面,由于细胞会受到同一组织或器官中其他细胞的影响或调控,细胞中的基因表达将受到其他细胞的间接调控。由此说明,单细胞基因表达矩阵将包含两部分信息:基因之间的调控信息和细胞之间的调控信息。