巴渝良种系列报道⑦|橘芯1号:全基因组解锁柑橘80多个性状
李强表示,柑橘的基因组包含9条染色体,总长近400Mb,我们鉴定了基因组里的4万余个SNP位点,近乎平均分布于整个染色体,也就是柑橘基因中每10000个碱基里就有发掘1个SNP。通俗来讲,10000个碱基可覆盖一个基因的长度。“平均每个基因段都找了代表性位点,可以说没有遗漏。”李强介绍,团队历时7年,通过对300多个...
中国畜禽科技发展高峰论坛暨第七届中国畜牧基因组产业转化高峰...
韩红兵教授研究团队构建了澳洲白羊基因组选择技术体系,涵盖了从基因型填充到遗传力估计的多个方面。研究比较了ABLUP、GBLUP、ssGBLUP和BayesR等基因组选择方法,发现GBLUP在实际应用中更具可行性。此外,研究还探讨了结合GWAS的基因组选择方法,发现其准确性与GBLUP相近,但样本量大小对结果有显著影响。该技术体系的建立为绵...
科技蜀光丨在小麦育种迷宫中找到通往高产宝藏的线索
此外还要获取基因型数据、绘制遗传谱图、计算目标性状的位点,以及在不同的遗传背景下进行验证等多个关键步骤,打通这一关通常需要6至8年的时间。最为艰巨的任务莫过于对产量性状表型进行精确测定。产量性状受众多基因的共同调控,与那些受单基因控制的抗病基因截然不同,它们更容易受到各种环境因素(如气候、土壤、水分和...
Nature Methods主题特刊:关注 AI 在生物学中的应用
机器学习方法在基因组学中产生影响的另一个领域是将序列映射到表型,AlexanderSasse、MariaChikina和SaraMostafavi在评论文章中讨论了这一点[9]。通过利用从许多不同的细胞类型和条件下收集的多模态数据,这些从序列映射到功能的模型旨在揭示不同遗传和环境因素影响下各种分子层面相互作用和调控的机制。空间转录组学...
Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...
基因型与表型关联的复杂性癌症作为一种遗传性疾病,其发展过程中基因型与表型之间的关联性极为复杂。这种复杂性不仅源于癌症本身的遗传多样性,还因为癌症的发展受到多种遗传和环境因素的共同影响。基因变异与癌症发展癌症的基因型通常指的是癌细胞中的基因组变异,包括基因突变、染色体重排、基因拷贝数变异等。这些变...
乳腺癌分子分型区别大盘点!
HER2-OE型:HER2基因拷贝数增加和EGFR/HER2信号蛋白标志(www.e993.com)2024年10月3日。Basallike型:TP53丢失;RB1和BRCA1丢失;MYC高倍体;P13K/AKT通路激活。No3:不同分子分型的免疫组化表型区别LuminalA型:ER+,PR≥20%,HER2-,Ki67low。这意味着该类型的肿瘤细胞表达雌激素受体(ER)和孕激素受体(PR),且阳性率超过20%。HER2的...
【云飞杂记】真菌传之基因组
表型是基因型和环境交互作用的产物,即特定的基因型在一定环境条件下的表现形式。因此,表型=基因型+环境条件。基因型控制着生物个体的表现型,是表型的决定性因素,但不是唯一的决定性因素,它与生物个体所处的特定的环境条件同时发挥作用,使得表型呈现出多样性。
原发性高草酸尿症 2 型:病因病理
目前PH2的低流行率,并不确定其基因型-表型相关性。命名法原发性高草酸尿症2型最初被描述为:??L-甘油酸尿症,指尿中L-甘油酸过多;??D-甘油酸脱氢酶缺乏,指酶在催化D-甘油酸脱氢过程中的非生理作用。由于更重要的酶反应似乎是乙醛酸还原反应,因此现在更倾向于使用乙醛酸还原酶这一名称。
2023糖尿病精准医学:1型糖尿病异质性和内型/亚型
T1DE2亚型可能是一系列表型的基础,这些表型具有不同程度的自身免疫性发生,因此进展为胰岛素依赖的速率不同,范围从经典的T1DM到成人隐匿性自身免疫性糖尿病或缓慢进展的胰岛素依赖型糖尿病。T1DM亚型是否存在仍是一个有争议的问题,但支持这一框架的数据正在积累,这将受益于进一步的研究,包括测试针对其潜在发病机制的干...
国际首创!中国科学家通过基因编辑技术建立孤独症家犬模型
孤独症突变犬对社会与非社会刺激瞳孔反应异常。WT,野生型对照;Mut,突变体。中国科学院遗传发育所供图在发表的其中一篇论文中,合作团队利用基因编辑技术,充分发挥家犬丰富多样的社交行为和高度发达的情感认知功能的独特优势,以临床上常见的Shank3基因突变为切入点在国际上首创孤独症家犬模型。研究结果显示,Shank3基因突...