IF 21.1|基因组所刘永鑫/南农袁军发布微生物组R语言分析的最佳实践

并提出了基于R语言进行微生物组分析的最佳流程,相关代码都可以在httpsgithub/taowenmicro/EasyMicrobiomeR获取。如果觉得项目有用,欢迎点击GitHub主页右上角Star支持本项目。摘要随着测序技术的逐步成熟,许多微生物组研究成果相继发表,推动了相关分析工具的出现和发展。R语言是目前广泛使用的用于微生物数据分...

R语言稀疏主成分分析、因子分析、KMO检验和Bartlett球度检验分析...

text(load,labels=names(mydata),ce因子分析library(psych)parallel并行分析表明,因子数=8。fit<-fa(r=cor因子载荷绘制前两个因子载荷绘制因子载荷矩阵因子分析或主成分分析的结果用每个因子上的主要载荷来初步解释。这些结构可以用载荷表表示,也可以用图形表示,其中所有具有绝对值>某个切点的载荷都表...

R语言:描述性统计

library(psych)describe(mydata)#itemname,itemnumber,nvalid,mean,sd,#median,mad,min,max,skew,kurtosis,seSummaryStatisticsbyGroupAsimplewayofgeneratingsummarystatisticsbygroupingvariableisavailableinthepsychpackage.library(psych)describe.by(mydata,grou...

R语言学习 - 热图美化 (数值标准化和调整坐标轴顺序)

R语言-箱线图一步法R语言-火山图R语言-富集分析泡泡图R语言-散点图绘制R语言-韦恩图R语言-柱状图R语言-图形设置中英字体R语言-非参数法生存分析R语言-绘制seqlogo图WGCNA分析,简单全面的最新教程psych+igraph:共表达网络构建一文学会网络分析——Co-occurrence网络图...