2024重组胶原蛋白行业白皮书:从美业革新先锋到精准医疗动力源
这些功能性结构域通过自组装形成稳定的分子结构,进一步加强了胶原分子间的力学耦合。同时,通过调控自组装行为,可以优化胶原蛋白三股螺旋结构之间的排布方式。不同的排列模式,如平行或反向平行排列,对机械稳定性有着不同的影响。借助计算模拟技术,可以预测出最佳的自组装构象和路径,从而找到最稳定的排列方式,提升胶原蛋白...
Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
输入数据:图a显示了DeepPBS的输入数据来源,包括实验数据(如PDB中的蛋白质-DNA复合物结构)、分子模拟快照以及设计的复合物。图中以PDBID2R5Y为例,展示了输入数据的形式。蛋白质结构表示:图b展示了蛋白质结构的图表示方法。重原子作为顶点,每个顶点计算了一些特征(例如原子类型、电荷、半径等)。这些特征作...
AlphaFold3迎来革命性进展!国内大佬手把手教授!|蛋白|蛋白质|多肽...
此次推出的AlphaFold3是一个强大的结构预测统一框架,涵盖了前所未有的广度和精确度,能够高准确性预测蛋白质与其他各种生物分子相互作用的结构。这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻...
NEJM:中国东北发现蜱传人新病毒——湿地病毒;科学界分成两大阵营...
具体来说,胶原蛋白分子中的酰基团通过共享电子,形成了一种稳定的网络结构,这种结构使得肽键免受水解作用的侵蚀。研究团队还通过构建胶原蛋白的两种模拟形态——天然的三重螺旋结构(trans)和角度旋转后的形态(cis),进一步验证了这一发现。实验结果显示,只有三重螺旋结构的胶原蛋白才能有效抵御水的攻击,保持其稳定性。该...
模拟5亿年自然进化史,全新蛋白质大模型ESM3诞生!前Meta老将力作Le...
初创公司EvolutionaryScaleAI发布了他们最新的98B参数蛋白质语言模型ESM3。不仅支持序列、结构、功能的all-to-all推理,团队还在实验中发现,它设计的新蛋白质相当于模拟自然界5亿年的进化。继AlphaFold3更新后,我们又看到了一个生命科学领域的大模型ESM3。
她,新晋「国家杰青」,专注生物材料研究!
Sci.Adv.:动态自适应熔融纤维状态的电组装模拟胶原蛋白结构蛋白是生物学中的重要组成部分(www.e993.com)2024年9月7日。通常,它们会利用各种分子相互作用机制,将它们的分级组装成赋予受控功能特性的复杂形态结构。一个经典的例子是胶原蛋白,在这类蛋白中三螺旋分子被引导在长度尺度的层次上组织。在某些情况下,这些分层组件通过可逆的相互作用机制...
重大突破!谷歌AI模型登《自然》期刊
同时,研究人员表示,阿尔法折叠3在预测蛋白质及其结构方面远远优于现有的软件工具。例如,对寻找新药感兴趣的科学家通常使用一款名为docking的软件来模拟化学物质与蛋白质的结合程度,而阿尔法折叠3被证明优于这个软件,同时也被证明优于另一个名为RoseTTAFoldAll-Atom4的基于人工智能的工具。约翰·詹珀和他的同事在稍...
欧盟提出战略举措,提升欧洲在先进材料领域的全球地位
德国科研团队开发新软件可快速模拟糖蛋白结构助力药物开发据phys网3月1日消息,德国马克斯·普朗克研究所开发出新算法GlycoSHIELD,为药物和疫苗开发提供了快速、高效、更低能耗的工具。该算法通过计算和预测蛋白质表面保护性聚糖的形式和排列,可了解糖的迁移率、可变性等动态信息,以及糖层对药物分子结合的影响。此外,该...
利用蜘蛛丝特性改进蚕丝蛋白结构植入式生物电子器件柔软“贴身...
近日,中国科学院上海微系统与信息技术研究所研究员陶虎团队与上海交通大学医学院附属第六人民医院合作,利用蚕丝蛋白材料的超收缩特性与键合工艺,实现了器件的水触发可控几何重构,开发出一种具有高度生物适配性的植入式生物电子器件。相关研究论文发表于《先进材料》。
用AI创造全新的蛋白质结构,这款软件与AlphaFold的区别在哪里?
据新闻消息,这款软件能够“绘制”或“幻想”出自然界中尚不存在的蛋白质结构,这是继AlphaFold之后蛋白质研究中的又一个里程碑。RoseTTAFold,AlphaFold,一个是用AI来从头合成蛋白质,一个是预测蛋白质折叠结构,各有千秋。它们会给蛋白质领域的研究带来什么样的变化?撰文|徐诗露责编|李晓韦图片来源:...