超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...
2024年诺贝尔奖中的生命科学
大多数蛋白质被设计来结合其他蛋白质、DNA、RNA或者其他类型的分子,这需要蛋白质能够形成并且保持其功能基团精确的空间组成形式。尽管大部分蛋白质具有确定的构象,但它们不是刚性的。各种类型的构象柔韧性(侧链及环区的移动、结构域的转动等)常常对其功能至关重要。蛋白质的可塑性极高。在保证蛋白质结构和功能不变的...
Nature子刊,快10倍,基于Transformer的逆向蛋白质序列设计方法
因此,CARBonAra可以解析和处理正在设计的蛋白质主链附近的任何分子实体,其中包括其他蛋白质、小分子、核酸、脂质、离子和水分子等一系列输入。数据集利用CARBonAra固有的灵活性,研究人员能够将RCSBPDB中的所有生物组装体纳入他们的训练数据集。这包括与其他分子实体(如离子、配体、核酸等)复合的蛋白质。训练数...
人体元素大揭秘:氧、碳、氢、氮的秘密
首先,碳是构成生物大分子如蛋白质和核酸的重要元素,这两种物质在维持生命活动中起着关键作用。蛋白质是构成细胞、组织和器官的基本材料,而核酸则是遗传信息的携带者。此外,碳还参与能量代谢过程,为身体提供能量。许多有机化合物,如葡萄糖、脂肪酸等,都是由碳、氢、氧等元素组成的,它们在细胞内经过氧化分解,释放出...
AlphaFold3来了!全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构...
在每一种植物、动物和人类细胞内部都有数十亿计的分子机器。它们由蛋白质、DNA及其他分子组成,只有通过观察它们在这无数种组合中的相互作用,我们才能开始真正理解生命过程。AlphaFold2的出现,引发了蛋白质结构及其相互作用建模领域的一场革命,为蛋白质建模和设计应用提供了广泛的可能。
Nature | 不止蛋白质结构!AlphaFold3可高精确度预测生物分子结构...
在PoseBusters基准数据集上,研究团队评估了AF3预测蛋白质-配体相互作用的性能,该数据集由428个蛋白质-配体结构组成(www.e993.com)2024年10月18日。结果显示,在不使用任何结构输入的情况下,AF3预测准确率为76%,性能显著优于传统对接方法Vina以及最新开发的RFAA模型(基于深度学习方法预测生物大分子结构)。对于蛋白质-核酸复合物和RNA结构,AF3预测准...
探索铬的奥秘
2.3增强蛋白质合成Cr3+通过胰岛素提高了机体对葡萄糖的利用后,Evans(1992)发现,老鼠骨骼肌细胞对氨基酸的吸收作用也随之增强,从而增加了骨骼肌的合成,提高了蛋白质在体内的沉积。2.4调节核酸代谢Cr3+有着比其他金属离子更强的核酸结合能力,在调节动物核酸代谢中起着重要作用(Okada,1982)。
周耀旗:AlphaFold 3的优势和短板在哪里?
其中一条重要中心法则是包含遗传信息的DNA分子,通过RNA分子,翻译生成蛋白质分子。蛋白质分子是一个几乎全能的分子机器,有记录在案的就有一万多种功能,包括分子马达、结构支持、信号传递、运输、加速生命必需化学反应、以及抵抗病毒、细菌侵入的抗体等等。从化学组成来讲,蛋白质是一个非常简单的线性高分子,由20个...
【冬闲学技】肥料对于农作物产量的影响有多少?
今天我们根据这个顺口溜,来具体谈几个特别重要元素的功效,希望各位农户能理解运用。一、无氮不生长氮是植物体内许多重要有机化合物的成分,在多方面影响着植物的代谢过程和生长发育,例如蛋白质、核酸、叶绿素、酶、维生素、生物碱和激素等都含有氮元素。其中蛋白质是植物细胞原生质组成中的基本物质,也是植物生命活动的...
2024,胶原蛋白大乱斗
长期而言,重组胶原蛋白要真正成为行业主流,和烟酰胺玻色因甚至HA透明质酸这样成为行业主流原料,还需要哪方面的突破?今天的重组胶原蛋白产品在新技术、新成分、前沿研究及应用研究上到底还欠缺哪些环节的进一步验证?而更深层的追问则是:全球范围的化妆品学术界,为什么尚未对重组胶原蛋白的功效达成共识?为什么最早是胶...