JGG | 海南大学三亚南繁研究院李靖团队发现两步调控介导印记基因...
IKU通路是调控胚乳早期发育的关键信号通路。该研究发现IKU通路下游基因ICF1表现出母本印记表达特性,且ICF1同源基因ICF2也表现出母本印记表达模式。传统的母本印记表达基因的DNA去甲基化和激活均发生在中央细胞。该研究发现,中央细胞的DNA去甲基化酶激活后,催化ICF基因的母本拷贝去甲基化,使其处于可被激活状态,而...
不止决定性别,XY染色体还广泛调控常染色体的基因表达
1、不活跃的X染色体和Y染色体能够调控体细胞中数千个常染色体的基因的表达;2、不活跃的X染色体和Y染色体通过共享机制调控常染色体的基因表达——由X染色体和Y染色体编码的同源转录因子ZFX和ZFY调控。论文链接:httpscell/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00306-3原标题:《挑战对性染色体的...
Cell重磅发现:新型DNA调控元件——促进子,促进增强子对基因表达的...
增强子(Enhancer)就是DNA中的一种调控元件,它们位于基因之间,在不同的时间和水平上以不同的组合来开关基因。尽管在40多年前就发现了增强子,但其工作原理仍然没有完全被理解。最近还发现了“超级增强子”(SuperEnhancer,SE),它们是多个单独的调控元件组成的团队,共同驱动非常高水平的基因表达,超级增强子通常是细胞身...
...的普遍认知:不止决定性别,XY染色体还广泛调控常染色体的基因表达
1、不活跃的X染色体和Y染色体能够调控体细胞中数千个常染色体的基因的表达;2、不活跃的X染色体和Y染色体通过共享机制调控常染色体的基因表达——由X染色体和Y染色体编码的同源转录因子ZFX和ZFY调控。论文链接:httpscell/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(23)00306-3...
...健团队发现胰腺癌seRNA甲基化调控组蛋白修饰和癌基因表达新机制
该研究运用了先进的ATAC-seq、RNA-seq和m6A-seq等多组学和多组学数据的整合分析策略,除了揭示CFL1-YTHDC2-MLL1表观调控轴可促进染色质开放和相应癌基因表达外,还积累了大量可靠数据,为全面的泛癌研究打下了重要基础。因为超级增强子表达具有显著的细胞和组织特异性,泛癌研究对于进一步阐明这种表观转录组和表观基因...
Life Med | 徐君/邓宏魁/韩春生筛选人激酶组基因发现ErbB通路调控...
由于KLF17同时也在人全能性细胞中富集表达,研究人员进一步尝试抑制ErbB通路是否对于人全能性诱导具有调控作用(www.e993.com)2024年10月19日。利用具有人全能性基因TPRX1报告体系的人胚胎干细胞系,研究人员发现ErbB信号通路的抑制能够在人全能性细胞诱导条件e4CL下进一步提升TPRX1阳性细胞的比例和强度。此外,在此条件下诱导的人全能性细胞中的多个典型...
清华团队揭示L1反转录转座子的转录活性调控染色质拓扑结构域边界...
综上,研究人员发现LINE-1转座子的插入和转录能够形成染色质拓扑结构域边界,而核基质蛋白SAFB特异地抑制这一过程来维护基因组结构和基因表达(图1)。该研究揭示了L1在基因组进化和基因表达调控方面的重要作用,也为研究RNA及RNA结合蛋白在染色质高级结构中的作用提供了新思路。
Cell | 双功能转录因子维持中等水平的基因表达稳定性
作者的研究表明,特定的凝聚体形成双作用转录因子(TFs)具有独特的调控基因表达的能力,能够在中等水平上同时进行激活和抑制。这些转录因子通过dCas9-6xMCP技术在基因组上的特定位置进行定位,能够将高表达基因的表达水平下调,同时将沉默基因的表达水平上调,达到中等水平(图4A)。这种调控机制不同于传统的激活因子或抑制因子...
人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化
在人类胚胎发生期间,染色质广泛重塑以改变其可及性,最大变化与关键发育的重要阶段重合(图1)。染色质可及性可定义为DNA可用于因子(包括转录机制和表观遗传修饰因子)结合的程度,其中主要决定因素包括核小体密度和间距。这样,染色质可及性代表了区域调控基因表达的潜力。
...子刊:杨建华/屈良鹄/李斌团队发现新结构型非编码RNA及其调控功能
而且,通过RNA半衰期分析和表达分析发现,napRNA在细胞内稳定表达并在不同的细胞刺激和分化阶段发生动态变化,这提示napRNA可能具有调控功能。有趣的是,研究团队还发现基因组的各种重复元件(repetitiveelement)可以转录和加工成多类新结构型ncRNA(repRNA),包括boxC/D,boxH/ACA和聚合酶III转录的ncRNA4。重要的是,...