为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学

模型建成后,科学家用尺来测量各原子之间的距离,确定蛋白质结构坐标。“这个方法很古老,”桑顿说。接下来,他们将所有坐标数据输入计算机中,计算机版本的蛋白质结构看上去像一片密林,她继续解释道,原子杂乱聚集在一起,只有戴上3D眼镜,才开始能看到蛋白质的拓扑结构。“整个过程非常折磨人,”桑顿说,“但结果出来后又令...

【CSCB2024】分会场回顾之细胞亚结构动态调控与细胞命运可塑性

本分会场主要围绕细胞亚结构动态调控展开,由中国科学技术大学符传孩和中国科学技术大学/中科院深圳先研院毕国强两位教授共同主持,分会邀请了来自国内高校的10位专家教授分享最新的研究成果,给我们带来了一场学术盛宴。

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?Vol.38

研究团队采用系统性基因敲除技术,在癌细胞中逐一降低305个与剪接体相关的基因表达,分析了它们对RNA剪接过程的影响。结果发现,剪接体的不同组分具有独特的调控功能。例如,U4/U6.U5三小核核糖核蛋白(snRNP)复合物的精确结构能够调节剪接位点配对,U1snRNP中不同蛋白质成分各司其职,决定外显子定义和5'剪接位点选择。这...

科学家用最先进的成像技术揭开细胞结构的神秘面纱

通过实时观察这种组装过程,可以更好地了解这些蛋白质在细胞器结构或功能中的作用。然而,要获得具有足够分辨率的视频序列来分辨如此复杂的显微元件,却面临着许多技术限制。为更好地观察细胞而充气中心粒尤其如此,这个尺寸不到500纳米(千分之五毫米)的细胞器由大约100种不同的蛋白质组成,分为六个亚结构域。直...

人体中心粒组装分子结构的时间序列重建

在随后的延伸阶段,微管蛋白骨架随着A-C连接体的募集而线性增长,随后是内侧支架(IS)蛋白的募集。通过以下六个结构模块,研究团队模拟了人体中心粒的4D组装。总的来说,这项工作为研究大分子的空间和时间组装提供了一个框架。据介绍,中心粒的生物发生,如同在大多数细胞器聚集一样,涉及支持其功能的亚结构元件的连续募...

iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞...

相比之下,SCIVVS由三个顺序步骤组成,从提取的活细胞产品中开始,以一种无需培养的方式进行(见图1B):(i)将益生菌细胞在100%D2OMRS液体培养基中孵育3小时;(ii)自动化采集D2O标记的SCRS,统计总活细胞计数、ID和物种水平的原位活力和活性;(iii)分选单个细胞,进行多位点扩增(MDA)和全基因组测序(通过scRACS-Se...

人类中心粒组装实现可视化

人类中心粒组装实现可视化转自:千龙网瑞士日内瓦大学科学家将高分辨率显微镜和运动学重建技术相结合,成功实现人类中心粒组装过程可视化。发表在《细胞》杂志上的这项研究,阐明了中心粒组装的复杂性,为研究其他细胞器开辟了新途径。中心粒是细胞内的一种桶状结构,由多个蛋白质组成。这些蛋白质的突变可引起一系列疾病...

再生医学之光:肝胆类器官移植猴模型,肝功能显著改善!

(A-C)通过HPA数据库的单细胞类型和组织细胞类型切片分析CTSV基因表达。结果表明,CTSV与肝脏窦状内皮细胞高度相关,并可在这些细胞中表达。(D)对HBO移植治疗8周后的肝脏组织切片进行CTSV、Lyve1和α-SMA的免疫荧光染色。代表性显微图像显示,与BDL模型组相比,HBOsTx组中CTSV的存在增加,而α-SMA的表达减少。比例...

Nature | 开辟治疗之路:反义寡核苷酸在蒂莫西综合征治疗中的突破

皮质类器官体(corticalorganoids)和前脑组装体(forebrainassembloids)模型在该研究中,皮质类器官体(corticalorganoids,hCO)和前脑组装体(forebrainassembloids,hFA)被用于评估治疗策略对神经疾病的影响。通过使用来自特定Timothy综合症的患者细胞创建的这些模型,研究人员能够模拟疾病的分子和细胞特征,并评估药物干预的...

2024年值得关注的七大科技

其中最为成熟的一些方法运用了“扩散”(diffusion)模型,这类模型也是DALL-E等图形生成工具的基础。这些算法先是被训练从大量真实蛋白质结构中去除由计算机生成的噪音(noise),当它们能成功对真实的结构元素和噪音进行分辨,它们就可以构建出满足用户需求同时又符合生物学原理的蛋白结构。