中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生

以下是大多数已发明的16SrRNA基因扩增子测序方法的标准流程：通过一对靶向16SrRNA基因保守区域的通用引物扩增菌群中细菌的16SrRNA基因，并利用高通量测序平台测序获得所有扩增的16SrRNA基因的序列。高通量的16SrRNA基因扩增子测序方法有以下优点：该方法基于16SrRNA基因的扩增，因此可以适用于未培养的细菌或低生物...

华智产品汇:微生物16S rDNA扩增子测序技术服务

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Zoonoses原创论文 | SPRI技术在高通量全长16S rDNA测序文库构建中...

具体方法包括DNA提取、PCR扩增、文库构建、SPRI核酸纯化和回收、SPRI珠比例优化、孵育时间优化、洗脱时间优化和正交实验设计等步骤。通过对不同参数的深度优化,研究人员确定了最佳的核酸纯化和回收参数组合,从而提高了核酸回收率和文库构建效率。该方法具有高效、快速、易于自动化等优点,有望在微生物学、生态学等领域得到...

16S全长测序揭示运动性脑震荡肠道微生物菌群变化

2.组学研究:对粪便样本和唾液样本进行ONT16SrRNA基因的测序分析。3.其他分子生物学检测方法:对血液样本进行炎症生物标志物的测量分析。■■■实验设计研究结果1.整个足球赛季期间运动员肠道微生物组成和通路变化全长16S测序读长大约1500bp,能够覆盖16SV1-V9高变区域。测序结果通过PCoA分析显示三个时间点...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

16SrDNA测序数据的质量控制与分析16SrDNA测序数据的质量控制是保证微生物组分析可靠性和重复性的关键步骤。本研究首先对原始序列数据进行处理,去除低质量序列和适配序列。在最初的数据处理中,我们使用了一系列生物信息学工具,包括FLASH(v.1.2.11)、fastp(v.0.20.0)和Vsearch(v.2.15.0)来完成特定的任...

贝瑞基因2024年半年度董事会经营评述

再次落地2台PacBioRevio超高通量测序平台,助力科学研究的快速发展,借助大规模三代测序平台,公司已在动植物基因组组装、三代动植物重测序、三代人重测序、三代全基因组甲基化,Iso-seq全长转录组、Kinnex全长转录组、三代16S扩增子以及三代宏基因组等产品上开发了多种数据应用,公司将在保证测序数据高质量和高产出...

iMeta | 齐素华/顾兵/罗兰/王亮-揭示玛咖来源细胞外囊泡可通过脑...

在行为测试完成后,我们处死小鼠并收集了粪便样本进行16SrRNA测序分析。本研究包括了对照组、对照组+Maca-EVs、UCMS组和UCMS+Maca-EVs组(每组n=3个实验)。(A,B)展示了不同类群在门和属水平上的微生物群相对丰度(前10位)。(C,D)显示了Faith's系统发育多样性指数(pd)的Alpha多样性,并呈现其在不同类群...

iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞...

然后对MPP-A产品进行检测,详细步骤如下所述,MPP-A在100%D2OMRS中厌氧孵育3小时,将孵育后的样品等分成三份,其中两个等分分别进行了基于16S-rDNA的扩增子测序和宏基因组测序作为对照实验,两者测序结果表明L.plantarum为MPP-A产品主要成分。另一份经过两次洗涤,进行单个细胞的SCRS鉴定,其中平均92.72%的SCRS被CNN...

幽门螺杆菌检测技术与预防胃癌的关键

样品准备和处理:从病人胃部组织或其他临床样本中提取DNA|PCR扩增:使用针对16SrRNA基因的特异性引物通过PCR(聚合酶链反应)技术扩增16SrDNA|DNA测序:对扩增的16SrDNA片段进行测序|序列分析与鉴定:比对测序得到的DNA序列与已知的细菌16SrRNA序列数据库,以鉴定样本中的细菌种类...

成都中医药大学: 茱萸丸抑制氧化三甲胺介导的ROS/TXNIP/NLRP3信号...

每取1只小鼠粪便换1次镊子,以防交叉感染,影响肠道菌群结果,且夹取粪便放入冻存管中务必迅速,以防空气中暴露太久,导致感染。小鼠粪便样本送至武汉迈维生物科技有限公司进行16SrRNA测序,按试剂盒说明进行操作。2.8.1DNA提取和质检使用MoBioPowerSoilDNAIsolation试剂盒提取基因组DNA,使用纳米滴检验DNA...