广州序科码生物取得基于单细胞测序数据唯一片段序列捕获方法专利...
包括以下步骤:基于单细胞测序文库中的DNA片段,以DNA片段上前10bp??20bp碱基作为识别序列,对含有相同所述识别序列的DNA片段进行归类,通过计算机软件将同类型的DNA片段生成一个数据集,从该数据集获得用于分析单细胞全基因组唯一序列。
50国2533种样本测序 大规模调查揭示万余种食物相关微生物
研究小组将新数据库与先前测序的19833个人类宏基因组进行了比较。他们发现,与食物相关的微生物物种约占成年人肠道微生物群的3%,占新生儿肠道微生物群的50%以上。“食物中的微生物与人类肠道微生物组存在一定程度的重叠,这表明我们肠道中的一些微生物可能直接来源于食物,或是人类历史上通过食物获得并逐渐适应成为人体...
探索DNA数据驱动器
数据写入DNA后,DNA微粒必须安全地保存在某个地方。已发表的存储示例有:将干燥的DNA微斑点放在玻璃或纸上,将DNA包裹在糖或二氧化硅颗粒中,或将DNA放入试管中。DNA读取可使用多种不同的商业测序技术完成。为了制造可以读写DNA数据的DNA驱动器,世界各地的组织已经迈出了第一步。通过微软和华盛顿大学保罗??艾伦计算机科...
RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析
如果对有临床注释的WES和RNAseq数据集的分析发现了相关靶标,靶向测序将充分发挥其潜力。在某些情况下,通过IG/TR基因靶向DNA测序进行克隆性评估可以提供额外的关键信息,例如,关于不同病变之间的克隆关系(如病例1)或区分新淋巴瘤和疾病复发。相同的克隆型信息也可以用于开发用于播散性疾病定量的分子检测,这在我中心正...
eDNA增进北极生物多样性研究:拖网与分子数据的结合分析
从采集的滤膜样本中,研究团队进行了DNA提取和测序。他们使用了修改后的Qiagen血液和组织提取试剂盒进行DNA提取,并通过PCR扩增12S线粒体基因区域。随后,利用Illumina测序技术对PCR产物进行测序,获取了大量的DNA序列数据。生物信息学分析是研究中的关键步骤。研究团队使用FASTQ软件检查序列质量,去除引物序列,筛选出符合要求的...
NGS Q40是终点吗?SBB测序数据作了“回答”
一旦适当的标记碱基与DNA链结合,就会发出荧光信号,并使用强大的光学器件进行测量(步骤2)(www.e993.com)2024年9月8日。与SBS测序的一个关键区别是,这种标记的核苷酸碱基不会并入DNA链中,而是在测序仪器捕获碱基信号后被洗掉。此后,通过去除可逆阻断剂来激活核苷酸的3'末端(步骤3)。这确保了从充满流动池的未标记、封闭的核苷酸中...
分析师指出,新质生产力的“三产”投资机会为技改传统产业、可控...
1.新增设备:主要包括数据中心、服务器、基站、光伏设备等新基建设备。2.能效水平尚未提升的设备:包括变压器、空气压缩机等。3.能效水平已经有所提升的设备:主要是传统家电、热泵等。(二)“二产”方向:可控新兴产业,关注“专精特新”与“工业五基”交集...
算力+存力:优化基因测序的关键所在
步骤1-3一级分析过程1-3步为一级分析过程,该过程主要由二代基因测序仪完成。完整的DNA测序样本在进行测序前会被用超声波击碎为上千万条(根据DNA链条长度不同,有时会高达上亿条)DNA片段。随后由基因测序仪将上千万条DNA片段中的序列内容解读出来,并将解读结果写入到FASTQ文件中。这些结果数据在FASTQ文件中是...
cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量
DNA去甲基化:除DNMT外,DNA去甲基化酶(如TET(10-11易位))也是DNA甲基化动态平衡的关键组成部分。TET酶可以从DNA中去除甲基,将5-mC转化为5hmC(5-羟甲基胞嘧啶),并参与DNA去甲基化过程。AID(activation-inducedcytidinedeaminase,活化诱导的胞嘧啶脱氨酶)和AB(Apobec)是脱氨酶,通常与DNA碱基脱氨和脱氧核糖修饰...
...市食药检院/美吉生物-??MIST: 可交互微生物鉴定和溯源分析平台
MIST集成了三种分析流程:基于16S/18S/ITS扩增子的微生物鉴定、基于WGS的微生物鉴定和基于SNP的微生物溯源追踪。MIST可以分析多种格式的序列数据,如Fasta、BCL、Fastq等。MIST可以连接到高通量测序仪器,直接获取测序数据。此外,我们为MIST(httpsyj.i-sanger)开发了一个可公开访问的Web分析平台,用户可...