中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
以下是大多数已发明的16SrRNA基因扩增子测序方法的标准流程：通过一对靶向16SrRNA基因保守区域的通用引物扩增菌群中细菌的16SrRNA基因，并利用高通量测序平台测序获得所有扩增的16SrRNA基因的序列。高通量的16SrRNA基因扩增子测序方法有以下优点：该方法基于16SrRNA基因的扩增，因此可以适用于未培养的细菌或低生物...
梅毒水平旋转仪|振荡器可支持多种梅毒检测方法 减少人为操作误差
二、操作步骤(以DNA提取为例)样品处理:根据样品类型(如血液、组织、细胞等),选择合适的裂解液进行裂解。蛋白酶K消化:加入适量的蛋白酶K,消化样品中的蛋白质。加入缓冲液:根据实验需要,加入特定的缓冲液,调节反应条件。沉淀核酸:加入无水乙醇等沉淀剂,通过离心将核酸沉淀下来。洗涤:用适当的缓冲液洗涤沉淀物...
谢国明教授:智能分子诊断领域的创新二重奏!
NOT逻辑门：通过插入互补引物（CPP）设计，当miR-21存在时，阻止PER扩增操作；miR-21不存在时，启动扩增。OR逻辑门：设计识别miR-21和miR-96的OR-CP序列，任一miRNA存在即可激活DSN辅助的目标循环和PER扩增。INHIBIT逻辑门：利用miR-21作为抑制剂，通过设计特定长度的CPP和引物，控制miR-96的响应。仅当miR-96存在...
Nat Methods丨scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因组复杂...
在基于二代短读段测序平台的CUT&Tag相关技术研究中,Tn5转座酶需要分别在具有染色质修饰(组蛋白修饰或转录因子结合)的基因组DNA的两侧进行转座,从而在短DNA片段(通常为200bp-500bp)的两端连接上测序接头,且只有双端带有不同测序接头的短DNA片段才能通过PCR扩增得到富集,进而构建测序文库。这意味着,捕获单个染色质修饰...
Nature Commun丨张勇与阮珏团队合作开发低DNA用量、无扩增的Pac...
首先,LILAP利用Tn5转座酶和发卡结构的PacBio测序接头组成二聚体转座复合物,一步实现DNA片段化和测序接头连接(图1)。所有流程在单个试管内进行,最大限度减少了建库过程中的DNA损失,简化了建库流程。与PacBio公司的标准建库和低DNA扩增建库方法不同(Genes2019;GenomeBiol2021),LILAP无需特殊实验仪器,所有试剂...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
采用Illumina的short-read测序做DGE分析的核心步骤包括RNA提取,cDNA合成,接头连接,PCR扩增,测序和数据分析(图一)(www.e993.com)2024年11月11日。由于mRNA片段化和基于beads的文库纯化过程中偏好150-200bp的片段,导致这个方案最后获得的cDNA片段都在200bp以下。每个样本平均测20-30millionreads,对每个基因或转录本进行定量,再统计分析差异基因(...
...CUT&Tag技术,可精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰
相比之下,二代测序方法只能获得基因组中所有DNA片段中的50%左右。此外,在PCR扩增步骤中,该研究设计了96种内侧细胞条形码和96种外侧细胞条形码。通过这种组合条形码策略,scNanoSeq-CUT&Tag技术可以灵活地控制每次上机的测序通量,在单次实验中可以灵活地对几个单细胞到上万个(96x96=9,216)单细胞进行测序...
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河南dna亲子鉴定检测一次多少钱(2024年费用标准汇总)
3.采样:根据检测项目的不同,采样方法也会有所不同。一般来说,个人鉴定只需采集口腔黏膜细胞;双亲亲子鉴定需采集父母和孩子的唾液或血液;无创胎儿亲子鉴定则需从孕妇静脉血中提取胎儿DNA。4.检测:收到样品后,安物亲子鉴定中心将进行DNA提取、PCR扩增等实验操作,终得出检测结果。
东北农业大学张微副研究员等:CRISPR/Cas-等温扩增技术
其扩增过程需要4条特异引物,首先,内部引物结合靶标物质,在BstDNA聚合酶的作用下延伸成双链,聚合酶延伸外引物以置换新合成的链,由于F1c和F1区域的杂交,使得位移链在5′端形成茎环结构,在3′端以类似的方式扩增,形成两端具有茎环结构的DNA,靶DNA的重复序列通过连续的延伸和置换进行扩增。由于LAMP技术使用4～6...