...化探究实验设计——以“检测生物组织中的糖类、脂肪和蛋白质...
此外,问题3)从实验设计的一般原则出发进行设问,部分学生观察到紫色颜色深、无砖红色沉淀,则主观上认定其“蛋白质含量高而含糖量低”,实际上此实验缺乏对照,且对“高”“低”的判断标准仅停留于主观意识层面,可引导学生补充对照组完善实验,甚至鼓励学生学习其他定量检测还原糖和蛋白质的新方法来进行后续拓展探究。
西湖大学李子青/深圳湾实验室周耀旗等解读AI赋能的蛋白质结构与...
本演讲介绍西湖大学在人工智能与生命科学学科交叉领域的最新进展,包括(1)中心法则的人工智能模型、(2)蛋白质结构编码与生成模型、(3)蛋白质进化树,(4)蛋白质组学从头测序、(5)配体-蛋白靶点相互作用及一体化药物设计系统,等前沿研究课题。周耀旗深圳湾实验室▌个人简介:周耀旗教授是深圳湾实验室资深研究员和系...
中科院计算所团队提出CarbonNovo,基于AI进行蛋白质结构从头设计
蛋白质从头设计主要包含两个步骤,蛋白质主链结构设计和序列设计(图1)。相应地,当前的主流模型通常采用「两阶段」框架进行:在训练过程中,结构设计模块和序列设计模块分别训练;在推断过程中,首先生成主链结构,然后为主链结构生成最优序列。代表性地,领域内使用RFDiffusion和ProteinMPNN这两个软件,依次生成主链结构和...
Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
蛋白质-DNA结构通常通过X射线晶体学、核磁共振光谱或冷冻电子显微镜实验获得,并存储在蛋白质数据银行(PDB)中。尽管这些结构显示了一个结合的DNA序列和相关的物理化学相互作用,但它们并不包含所有可能结合的DNA序列。相反,结合特异性数据可以通过蛋白质结合微阵列、SELEX测序、染色质免疫沉淀测序等实验获得,但这些实验不...
实验室超声波破碎仪(细胞粉碎机、裂解器)与雪花制冰机组合案例
样品预处理:首先,使用实验室雪花制冰机制备冰块,将组织样品置于冰上或用冰浴包裹,以保持低温状态,防止蛋白质降解。细胞破碎:将预冷处理后的组织样品加入适量的裂解缓冲液中,使用超声波细胞破碎仪进行破碎处理,释放细胞内的蛋白质。蛋白质纯化:破碎后的样品通过离心、过滤等步骤去除杂质,得到初步纯化的蛋白质溶液。
IP实验步骤指南:蛋白结构分析解析
IP(免疫沉淀)是一种常用的蛋白质分析方法,可以用于分离和富集特定的蛋白质(www.e993.com)2024年9月7日。以下是IP实验的基本步骤:3.1样品准备首先,需要准备含有目标蛋白质的样品。样品可以是细胞提取物、组织提取物或纯化的蛋白质溶液。3.2抗体选择根据目标蛋白质的特异性,选择适当的抗体。抗体可以是单克隆抗体或多克隆抗体,也可以是商业...
20个实验数据创造AI蛋白质里程碑!上海交大联合上海AI Lab发布FSFP...
(learningtorank,LTR)和参数高效微调(parameter-efficientfine-tuning,PEFT),开发了一种能在数据极度匮乏的情况下,有效优化蛋白质语言模型的训练策略FSFP,可用于蛋白质适配性的小样本学习,在使用极少湿实验数据的情况下,极大地提高传统蛋白质预训练大模型在突变-性质预测的效果,在实际应用中也显示出了巨大...
全球首次湿实验证实,上交成功实现“蛋白质功能定向进化”,零数据...
ProtLGN框架示意图荧光蛋白发光强度(FP),VHH抗体结合强度与热稳定性,以及中温核酸剪切酶(KmAgo)剪切活性的多点位突变结果湿实验结果表明,ProtLGN可以在没有湿实验数据或仅少量类似功能蛋白质的实验数据基础上达到40%的单点位改造成功率,并且在部分单位点上实现了多种功能协同提升。
蛋白质胶条鉴定:从交联实验到相互作用分析
蛋白质胶条鉴定包括以下几个步骤:1.样品制备首先,需要准备待测的蛋白质样品。样品可以是纯化的单个蛋白质,也可以是复杂的混合物,如细胞提取物。对于复杂样品,可以采用亲和纯化等技术来富集感兴趣的蛋白质。2.交联反应将样品与交联剂一起反应,使蛋白质分子之间发生交联。交联反应的条件需要根据具体实验要求进行优...
甲胎蛋白升高一定是肝癌吗?不一定,但要及时做好这些筛查!
1.甲胎蛋白(AFP)简介:甲胎蛋白是一种在胎儿发育过程中产生的蛋白质,通常在成人体内水平较低。肝癌相关性:在原发性肝细胞癌(HCC)患者中,AFP水平通常升高。AFP升高不仅可以作为肝癌的一个重要指标,也可能出现在其他肝病(如肝炎、肝硬化)或某些生殖系统肿瘤中。