微生物组-扩增子16S分析和可视化(2024.10)

可全程记录分析过程,保证从数据到发表级图形的可重复计算,让团队分析水平上升到大牛级别。Alpha多样性各种指数:Shannon、Chao1、ObservedOTU、PDwholetree等,并配合Anova,LSD统计;Beta多样性各种距离矩阵:BrayCurtis、Jaccard、WeightedUnifrac、UnweightedUnifrac等结果的树状图、箱线图、散点图展示样品间差异;...

系统学习单细胞多组学、空间转录组和机器学习单细胞分析应用线上...

5,了解单细胞测序基本概念及原理、测序分析的常用软件、测序数据的下载方法和研究思路、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本6,空间基础处理、多样本联合分析、单细胞空间联合分析、空间转录组通讯分析...

AlphaFold3迎来革命性进展!国内大佬手把手教授!|蛋白|蛋白质|多肽...

5.1MSA采样聚类分析及结构预测5.2不同MSA可以预测构象之间的转变和功能6.利用AF2的部分算法模块做模型质量评估和侧链构象等6.1三角机制提升蛋白质模型质量评估6.2局部三角机制和evoformer用于蛋白质侧链预测第五天:深度学习蛋白质序列设计1.传统的蛋白质序列设计a.基于力场b.基于同源序列c.走向...

AIGC应用与开发@硅创社AIGC3月图书推荐榜

1.1.3解密GPT模型的标记化和预测步骤71.2GPT模型简史:从GPT-1到GPT-491.2.1GPT-191.2.2GPT-2101.2.3GPT-3111.2.4从GPT-3到InstructGPT121.2.5GPT-3.5、Codex和ChatGPT141.2.6GPT-4151.3LLM用例和示例产品161.3.1BeMyEyes161.3.2...

引领药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白...

??数据结构:列表、元组、字典、集合、操作和常用方法。??文件操作:读写文件,文件与异常处理。2.Python进阶??类和对象:面向对象编程基础,创建类,实例化对象,理解封装、继承和多态。??模块和包:导入标准模块,使用第三方包,创建自定义模块和包。

品牌社交媒体营销数据分析初学者指南(一)

以下信息将我们会将整个过程进行梳理,以便社交媒体分析更容易理解一些(www.e993.com)2024年11月6日。什么是海外社交媒体???人天生就是社会性的,他们会通过外部的感官与自我的分析进行自动的聚类,这就是人以群分,物以类聚。他们渴望沟通交流,一起决策。后疫情时期,社交媒体更加是保持安全免疫距离的最佳选择。

simpleEnrichment--对GO富集分析结果进一步处理!

通常我们进行功能富集分析,对基因集进行功能注释的时候,往往会得到大量显著富集的功能,今天小编给大家介绍的simplifyEnrichment包,就可以通过binarycut的方法,将GOSemSim得到的GO相似度矩阵进行划分,从而将GO划分为几个类,通过注释就可以知道每个类对应的功能是什么。

会计大数据分析与处理技术:助推数据赋能财务新未来

5.数据分析。数据分析可分为数据探索和数据算法两部分。数据探索是介于数据清洗和数据算法之间的重要环节,是通过作图制表、计算统计量等方法来探索数据内在结构和规律,了解数据集自身特点以及数据间的相互关系的一种开放性分析方法,可帮助了解数据的整体情况,对数据的主要特征、规律进行概括,为后续数据算法模型的构建和...

(生信实操)用R语言处理芯片数据及结果可视化分析

聚类分析:分析基因或样本之间的相互关系。常用聚类方法包括分层聚类和K-均值聚类。分层聚类可直接通过聚类树观察到样本和基因之间的相似程度,将n个样品各作为一类,计算n个样品两两之间的举例,构成距离矩阵,合并距离最近的两类为一新类,计算新类与当前各类的距离,再合并、计算直至只有一类为止。分层聚类方法广泛应用于...

数据不够?生信分析帮你凑!学会深度挖掘快速发文章

能够用R语言进行数据分析掌握PCA、共表达、聚类、Heatmap、富集、Cytoscape等分析掌握GEO数据库数据的下载、挖掘了解其他领域的方法在医学领域中的推广虽然很难从小白一下子变成R语言高手,可是在这里,你能迈开第一步,不会担心装不上各种软件,不会看不懂反馈的分析图,给自己信心,才是成为高手的第...