蛋白质设计师David Baker:我喜欢做那些“魔法”般的事
之后,你可以设计出这个蛋白质的大致形状,这个形状应当能与靶蛋白互补;然后,再去设计结合面上的氨基酸序列,让二者在几何形状和化学上都能相互匹配。这之后,你要去检查这个设计出的新序列,确认你所需要的结构是不是这个序列所能折叠成的能量最低的结构。上面这些步骤,基本上都是在计算机上自动完成的。然后,你就可...
诺奖得主David Baker学生沈浩署名文章:蛋白质设计究竟是什么?
这时,他灵机一动:既然计算整个蛋白质的折叠过于复杂,不如从局部肽段结构入手,看看能不能通过拼装搞定整个折叠过程。于是,贝克和他的团队将蛋白质数据库(PDB,ProteinDataBank)中的蛋白质打碎成小肽段,并通过随机插入组装的方法,用能量函数判断是否接受每一步,像搭积木一样,研发出了Rosetta蛋白质结构预测软件。
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
1、基因表达谱分析:通过对基因表达谱数据进行深度学习,可以预测基因功能、发现新的生物标志物和生物路径径。2、结构生物学预测:通过对结构生物学数据进行深度学习,可以预测蛋白质结构、功能和互动。3、生物信息学数据集预处理:通过对生物信息学数据集进行深度学习,可以提高数据质量、减少噪声和缺失值,从而提高预测模型...
...以“检测生物组织中的糖类、脂肪和蛋白质”为例/郑珩艺等
设计实验预习报告,引导学生课前阅读教材、查阅相关资料,完成实验报告中的预习部分(实验目的、实验原理、实验步骤等),以熟悉生物组织中的糖类、脂肪和蛋白质检测实验的基本原理和操作步骤。生活中有许多关于营养膳食的传言,运用多媒体展示相关报道:1)越甜的水果,糖含量越高。2)1个鹌鹑蛋的营养等同于3个鸡蛋。3...
一谱识菌: MALDI-TOF MS 在病原微生物临床应用的专家共识
1.快速、简便、通量高:前处理及上机操作步骤操作简单,短时间内即可完成多标本检测。2.准确度高:MALDI-TOFMS的鉴定准确率为90.0%~95.0%,显著高于微生物生化鉴定系统??[??4??]??。MALDI-TOFMS检测的是保守且具有种特异性的核糖体蛋白,对近缘菌种的区分能力较传统方法更强,尤其对有重要临床意义的菌种鉴...
首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布
量化了水稻内主要组织中超过15000个基因的蛋白质水平,鉴定了8964个蛋白质,并为另外7077个蛋白编码基因提供了蛋白质水平证据,从而绘制出了水稻全景定量蛋白质组图谱(www.e993.com)2024年10月16日。研究还发现,N6-腺苷酸甲基化修饰是调控蛋白质表达量的关键因素。该研究为水稻的基因功能研究和表达调控提供了重要的蛋白质组和蛋白质修饰组信息。
DropBlot——一种化学固定单细胞蛋白质组分析的混合微流控平台
研究过程一.工作原理概述及步骤DropBlot是一种用于化学固定单细胞蛋白质组分析的混合微流控平台,通过微流体H-型连接点产生水包油(W/O)液滴,将单个固定细胞与含有表面活性剂的抗原提取缓冲液共封装在液滴中。DropBlot通过液滴技术实现了对单个固定细胞的抗原提取,然后通过开放流体芯片进行单细胞PAGE和免疫印迹...
2025天津医科大学全国硕士研究生入学统一考试《618生物化学与分子...
1.蛋白质化学考试内容氨基酸的分类,20种常见氨基酸的简写符号氨基酸的酸碱化学性质和氨基酸的化学反应氨基酸混合物的分析分离蛋白质的化学组成和分类肽和肽段的结构及物化性质蛋白质分子的结构(一级、二级、高级结构的概念及形式)蛋白质一级结构的测定...
重组胶原蛋白赛道群雄逐鹿 中国企业集体行至“关键阶段”
“重组胶原蛋白实际上的技术含量非常高,涉及到对基因序列的精确设计和合成,以及对蛋白质表达、纯化、加工等过程的精细控制。”张新原认为,重组胶原蛋白的生产需要高度的技术实力和专业知识,包括生物工程、基因工程、蛋白质工程等多学科的交叉应用,同时,随着技术的不断进步,重组胶原蛋白的应用领域也在不断拓展,如...
蛋白质质谱分析:多肽结构鉴定的新视角
1.蛋白质质谱分析的原理蛋白质质谱分析是一种基于质量-电荷比(m/z)的技术,通过将蛋白质分子转化为离子,并在质谱仪中进行分析,从而得到蛋白质的质谱图。蛋白质质谱分析的原理主要包括以下几个步骤:1.1样品制备在蛋白质质谱分析前,需要对样品进行制备。常见的样品制备方法包括胶体电泳、液相色谱等。这些方法可以...