新热点!代谢重编程构建肿瘤风险模型发表8分+|GMII|谷氨酰胺|膀胱...
2023年6月15日 - 健康界
通过STRING数据库分析PPI网络,并通过Cytoscape可视化以获得三个主要网络图(图1C-E)。通过Cytoscape软件中的算法获得共同的Hub基因,并在TRRUST数据库中预测Hub基因的转录因子(图1F,G)。图102、聚类分析差异分析后获得的具有谷氨酰胺代谢相关基因的膀胱癌患者的聚类分析表明,膀胱癌患者最好分为两个cluster,每个clust...
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...| 北京大学高歌课题组发表单细胞多组学数据整合与调控推断新方法
2022年5月4日 - 网易
作者基于pcHi-C,eQTL等调控特征及scRNA-seq与scATAC-seq数据,对转录因子与基因间的调控关系进行了预测,并利用TRRUST数据库进行验证,说明GLUE可以实现基因调控网络的准确重构。最后,作者还使用了百万级别的scRNA-seq与scATAC-seq数据,充分展示了GLUE方法对大规模单细胞数据集的整合计算能力。上述结果表明,GLUE方法通过整合...
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