【医药】浙大侯廷军课题组在J. Med. Chem.报道针对机器学习打分...
医药浙大侯廷军课题组在J.Med.Chem.报道针对机器学习打分函数开发的无偏数据集构建方法近日,浙江大学药学院侯廷军教授团队、中南大学曹东升教授团队和腾讯量子实验室联合提出了一种用于机器学习打分函数训练和测试的无偏数据集构建新方法,相关工作发表在JournalofMedicinalChemistry上。在药物虚拟筛选中,打分函数...
浙大侯廷军团队报道蛋白降解靶向嵌合体数据库PROTAC-DB2.0
近日,浙江大学药学院侯廷军教授课题组在NucleicAcidsResearch期刊发表了题为:PROTAC-DB2.0:anupdateddatabaseofPROTACs的论文,对初代PROTAC-DB做出了重大更新。PROTAC-DB始建于2020年,是首个PROTAC在线数据平台,囊括了化学结构、生物活性、理化性质在内的多种数据,现已成为PROTAC领域的重要数据...
STTT丨孙毅课题组自主研发靶向UBE2F-CRL5轴的小分子抑制剂,能在...
孙毅教授课题组前期工作发现,拟素E2耦联酶UBE2F通过促进Cullin-5拟素化修饰,活化CRL5,降解底物蛋白NOXA,从而抑制肿瘤细胞凋亡,促进其增殖5。而且其高表达,与肺癌患者的不良预后相关,是一个具有吸引力的抗肿瘤治疗靶点5。然而,至今尚无靶向拟素E2耦联酶UBE2F的小分子抑制剂的报道。2022年10月17日,浙江大...
靶向蛋白降解: 小分子药物的下一个黄金时代
2020年,浙江大学侯廷军教授课题组建立了首个线上PROTACs数据库(PROTAC-DB)。截至2021年4月,该数据库包含200多个靶点,共有2258个PROTACs,275个蛋白配体,68个E3配体和1099个连接子。相比之下,现有E3数量极少,在临床中使用的E3更少(仅有VHL和CRBN)。人体中有超过600种E3,如何拓宽E3在PROTAC设计中的应用也是需要...
Nucleic Acids Res.|DDInter:药物-药物相互作用数据库
NucleicAcidsRes.|DDInter:药物-药物相互作用数据库今天给大家介绍一篇来自中南大学曹东升教授课题组、浙江大学侯廷军教授课题组和湘雅医院刘韶教授课题组联合发表的一篇文章“DDInter:anonlinedrug–druginteractiondatabasetowardsimprovingclinicaldecision-makingandpatientsafety”。药物-药物相互作用(...
PROTAC技术简介及近期重大研究成果
侯廷军课题组长期关注计算机辅助药物分子设计研究中存在的技术难点和问题,聚焦基于靶点结构的虚拟筛选方法和成药性理论预测,进而展开了系统和深入的方法学研究,并把发展的方法用于多个重要靶点的药物分子设计,发现多类全新结构的抗肿瘤和抗炎症先导化合物(www.e993.com)2024年9月17日。本文中,为了促进PROTACs的合理设计,作者开发出一个基于web的、集结...
靶向蛋白降解:小分子药物的下一个黄金时代
E3配体、蛋白配体和连接子的变体越多,PROTAC的合成就越困难。这在实践中是一项巨大的工程。经过10多年的积累,科学界和工业界已经开发出数千种PROTAC分子。2020年,浙江大学侯廷军教授课题组建立了首个线上PROTACs数据库(PROTAC-DB)。截至2021年4月,该数据库包含200多个靶点,共有2258个PROTACs,275个蛋白配体,68...
重磅!《麻省理工科技评论》2020年“全球十大突破性技术”,18位...
浙江大学侯廷军课题组发展了基于MM/GBSA结合自由能分解和支持向量机的MIEC-SVM方法用于蛋白—多肽/小分子相互作用预测[10],有效降低了自由能计算误差对预测的影响。朱峰课题组针对药靶发现的假阳性和稳定性问题,将多种AI方法引入可药靶性发现,成功降低了临床药靶发现的假阳性率[11],将发现稳定性提升了一个...
蛋白降解靶向嵌合体数据库PROTAC-DB 2.0来了!
本文转载自浙江大学药学院,原标题:浙江大学药学院侯廷军课题组在NucleicAcidsResearch报道了蛋白降解靶向嵌合体数据库PROTAC-DB2.0。参考资料:[1]GaoqiWengetal.PROTAC-DB2.0:anupdateddatabaseofPROTACs.NucleicAcidsResearch.2022....