Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
SHAPE测序(SHAPE–seq)通过与RNA骨架的核-2′-羟基反应来标记未配对的ssRNA,发夹环中的碱基堆积会降低标记效率。Structure–seq和硫酸二甲酯测序(DMS-seq,dimethylsulfate)用DMS标记腺嘌呤和胞嘧啶残基,阻断了逆转录,使得能够通过分析所得的截断cDNA推断出RNA结构。SHAPE和突变图谱分析(SHAPE–MaP)和DMS突变图谱分...
科学家在陨石中发现DNA和RNA的重要组成部分为有生源说提供支持
一方面,有嘌呤。这类化合物包括鸟嘌呤和腺嘌呤,以前曾在撞击我们星球的陨石中发现过。但是,如果没有另一种核碱的存在,DNA和RNA就无法形成(因此生命也无法发展),这种核碱的结构更大、更复杂:嘧啶类。这一类包括胞嘧啶、尿嘧啶和胸腺嘧啶。嘧啶从未在陨石样本中被发现过,而且浓度很高--直到现在。由日本北海道大学...
Science:利用人类线粒体mRNA结构组揭示人类线粒体中的基因表达机制
Science:利用人类线粒体mRNA结构组揭示人类线粒体中的基因表达机制来自迈阿密大学和哈佛医学院的研究人员在一项新的研究中改进了一种利用硫酸二甲酯(DMS)对mRNA结构进行化学探测的方法,其中硫酸二甲酯可将腺嘌呤和胞嘧啶未配对且可触及的碱基配对面甲基化。人类线粒体基因组(mtDNA)的表达为催化有氧能量转移并维...
拓新药业:公司在抗肿瘤方面的医药中间体主要有:胞嘧啶用于抗肿瘤...
拓新药业：公司在抗肿瘤方面的医药中间体主要有：胞嘧啶用于抗肿瘤药物吉西他滨、5氟胞嘧啶用于抗肿瘤药物卡培他滨、胞苷用于抗肿瘤药物阿糖胞苷、尿苷用于抗肿瘤药物盐酸阿糖胞苷、次黄嘌呤用于抗肿瘤药物巯嘌呤每经AI快讯，有投资者在投资者互动平台提问：您好！请问公司除了给默沙东提供新冠新药原料药，在抗肿瘤...
Nature Biotech背靠背 | 脱靶率极低,中外团队分别开发基于腺嘌呤...
首先,该研究证明了ABE尤其是高活性ABE8e可介导高效的胞嘧啶编辑,猜测TadA-8e脱氨酶对腺嘌呤和胞嘧啶有一个共同的催化口袋,活性位点及其周围的关键氨基酸改变可能会影响催化底物的选择。基于结构导向的理性设计和筛选,发现在TadA-8e脱氨酶的活性口袋引入关键突变N46L,消除其固有的腺嘌呤脱氨酶活性而展现高效的胞嘧啶...
Nature子刊:李兵辉团队发现癌症的阿喀琉斯之踵——嘧啶小体
在增殖细胞中,嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸可以通过回收途径回收或从头途径合成(www.e993.com)2024年11月16日。所有催化嘌呤从头生物合成的六种酶都可以形成一种被称为“嘌呤小体”的多酶复合物来调节嘌呤通量。嘧啶的从头合成由3种代谢酶催化的6种化学反应组成,分别为位于胞质的CAD、锚定于线粒体内膜的二氢乳清酸脱氢酶(DHODH)以及胞质的尿苷5'-三...
Nature子刊:李大力团队开发精准高效的腺嘌呤颠换编辑器ACBE
目前,不依赖DNA双链断裂和模板参与的单碱基编辑器(baseeditors)是治疗遗传病强有力的基因编辑工具。现有的碱基编辑技术CBE(C-to-T),CGBE(C-to-G),GBE(C-to-G/C-to-A)和ABE可实现胞嘧啶转换/颠换编辑以及腺嘌呤的转换突变,由于缺少切除肌苷的内源DNA糖苷酶,ABE的产物纯度可达99%。然而,仍有25%的人类...
再获重磅突破,邦耀生物开发精准安全的新型腺嘌呤碱基编辑器—ABE9
碱基编辑技术最早由哈佛大学刘如谦(DavidLiu)团队开发,主要分为两类:胞嘧啶碱基编辑器(CBE)与腺嘌呤碱基编辑器(ABE),分别由胞嘧啶脱氨酶或改造的腺嘌呤脱氨酶与Cas9酶活突变型蛋白(nickaseCas9)融合而来。目前,CBE与ABE虽已在多个物种中得到广泛应用。然而通过不少实验研究表明它们仍存在严重的随机脱靶...
RNA的分类有哪些?简单聊聊信使RNA和转移RNA
③5′末端碱基往往是鸟嘌呤。④3′端是CCA序列,其中的腺苷酸常称为A76,其3′-羟基是氨基酸结合位点。而tRNA二级结构则约有50%碱基配对,形成四段双螺旋,与五段非配对序列形成三叶草形结构。该结构中存在四臂四环:①氨基酸臂。②二氢尿嘧啶臂,即DHU臂和二氢尿嘧啶环,即DHU,特征是含二氢尿嘧啶DHU。③反密码...
Nature子刊:杨辉团队开发新型DNA碱基编辑器,首次实现高效腺嘌呤...
然而,还没有一种碱基编辑器能够实现A-to-T和/或A-to-C这类碱基之间的颠换(即嘌呤变嘧啶)。开发能够实现腺嘌呤碱基颠换的新型DNA碱基编辑器对基因治疗领域有着重大的潜在价值。2023年1月9日,杨辉团队与临港实验室/上海脑科学与类脑研究中心胥春龙团队合作,在NatureBiotechnology期刊发表了题为:ProgrammableA...