金匙医学申请一种靶标病原或耐药基因多重数字PCR引物探针设计与...

专利摘要显示,本申请涉及生物信息学技术领域,具体公开一种靶标病原或耐药基因的多重数字PCR引物探针的设计与评估方法。本申请通过自定义算法先对单目标病原或耐药基因所有的引物探针进行评分和排序,然后按照逐次增加靶标数或重数方式添加单目标病原或耐药基因的较优引物探针,并评估每次增加引物探针后整个组合体系的二级结构...

...TOF质谱检测密集单核苷酸变异位点的引物和探针的设计方法专利...

通过本发明提供的一种设计MALDI??TOF质谱检测平台的密集SNV位点各突变类型特异性检测杂交探针的方法,利用该方法设计的引物,可以快速准确地对密集单碱基突变位点进行检测,对突变序列具有高度的特异性,并且能用于突变序列丰度的定量检测。

圣湘生物获得发明专利授权:“一种设计引物的方法、设备、可读介质...

本发明提供一种设计引物的方法,所述方法包括:S1、获取目标物种序列数据,构建序列数据集;S2、过滤短序列及序列比对;S3、根据所述碱基信息,重新构建兼并碱基的参考序列;S4、对所述S3所构建的参考序列进行引物模板筛选,设计引物。本发明的方法采用种子序列定位及延伸算法比对,其时间复杂度远低于多序列比对,耗时短,可以最...

北京大学申请基于深度学习的16SrRNA基因测序引物设计方法及系统...

首先获取目标细菌群落相关的属列表,基于属列表得到代表性16SrRNA基因全长序列,利用预先训练的区域划分模型预测代表性全长序列的各个可变区域及保守区域,确定符合测序平台要求的候选扩增区域用于引物设计,针对每个候选扩增区域确定对应的正向引物结合区序列集和反向引物结合区序列集,基于两种序列集分别进行多序列比对得到候选...

从此再也不用自己设计qPCR引物了,包括66种植物3331426个基因引物...

但该方法的准确性和一致性与设计引物的特异性和扩增效率密切相关。虽然,qPCR引物可以人工设计,但该过程非常耗时,且很难保证引物的特异性、扩增效率一致性。该研究团队设计了基于热动力学的基因特异qPCR引物设计流程,并对人、小鼠、家蚕、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、水稻、玉米和油菜等共147个已完成全基因组测序物种...

鹰谷InSequence序列编辑器新品发布,引物设计、序列比对软件,不止...

5、引物设计与质粒设计:内置引物设计和质粒设计模块,支持PCR、qPCR和测序引物的设计(www.e993.com)2024年11月19日。6、整合到鹰谷电子实验记录本中:InSequence同时具备客户端版和网页版,其中网页版已整合至鹰谷电子实验记录本中。InSequence免费下载:请搜索“上海鹰谷”访问鹰谷官方网站...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

标签测序法采用随机引物或带有oligo-dT的引物进行PCR扩增分选出转录本的3’末端的同时加上接头序列,优化掉了poly(A)富集、rRNA移除和接头连接等步骤。这一方法可以在更低的测序深度条件下达到与标准RNA-seq相当的敏感性,因此可以混合更多样本同时测序。因为不需要考虑外显子连接检测(exonjunction)和基因长度归一化,...

走进PCR小世界,常见问题知多少

一、引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。二、靶序列或扩增产物的交叉污染:整个基因组或大片段的交叉污染或者是空气中的小片段核酸污染。

师弟一举赢得 qPCR 「最美」曲线,暗藏哪些小心机?

1)杂峰在主峰之前,说明存在引物二聚体,建议需要重新设计引物。2)杂峰在主峰之后,大多由非特异性扩增引起,建议调整稀释倍数、减少引物。2.扩增曲线抖动,不光滑或没有平台期可能因为仪器不准或模板不纯。建议进行仪器校准;增大模板稀释倍数。3.实验重复性差...

最高人民法院知识产权法庭裁判要旨摘要(2023)

裁判要旨在缺乏其他证据佐证时,现有设计物证上的铭牌所载明的“出厂日期”,通常不能直接认定为“销售公开日期”或者“使用公开日期”。24.外观设计是否具有明显区别的认定案号(2022)最高法知行终567号裁判要旨如果专利设计仅是对相同种类产品上的同一对比设计中不同部分的设计特征,运用居中、对称等惯...