他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

结构性的蛋白质组成生物的身体——头发和指甲里的角蛋白,皮肤里的胶原蛋白,肌肉纤维里的肌球蛋白,血管里的弹性蛋白。功能性的蛋白质推动生物体内的机能与反应——帮助消化吸收的淀粉酶、脂肪酶,控制血糖的胰岛素,运输氧气的血红蛋白,存储铁的铁蛋白,传递信号的神经递质……一些蛋白质的大小对比。蛋白质分子的直径...

科普|人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖...

贝克的研究团队首先提出一个全新结构的蛋白质，然后利用Rosetta计算哪种氨基酸序列可以生成所需的蛋白质。为了验证该软件的成功率，贝克的研究小组将软件建议的氨基酸序列基因引入细菌，这些细菌生产了所需的蛋白质。然后，他们利用X射线晶体学确认了蛋白质结构与他们的设计几乎完全符合。该成果于2003年发表。此后，他的研...

蛋白质分子结构技术解析

1.样品准备蛋白质需要在溶液中,保持其天然状态。2.数据收集蛋白质样品置于强磁场中,随后通过射频脉冲激发样品。收集样品原子核的磁共振信号。3.结构解析分析这些信号,提取原子间的距离约束和角度约束信息。利用这些约束信息来计算蛋白质的三维结构。4.优点可以在近生理条件下观察蛋白质,包括蛋白质的动态信息。

中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...

晶体结构与预测模型高度一致,证明两段无序区发生协同折叠,形成包含三段反平行β的折叠片层与一段α螺旋堆积的有序核心结构,其中β折叠片层由来自4.1G的两段无序区包夹来自NuMA的无序靶标片段共折叠形成;进一步分析表明,4.1GC端结构域与其他靶标蛋白的结合采用了类似结构机制(图1)。图1.研究流程概述该研究揭示...

中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...

LonAAA+蛋白酶(LonA)是一种在原核生物和真核生物细胞器中保守的ATP依赖性蛋白酶。LonA组装为同源六聚体,每个单体都包含一个N端结构域、一个中间ATP酶结构域和一个C端蛋白酶结构域。LonA通过降解受损或错误折叠的异常蛋白质在细胞蛋白质稳态中发挥重要作用,从而防止这些不需要的蛋白质种类形成有毒聚集体。LonA还...

质谱技术揭秘蛋白质:从结构到功能的深度解析

质谱技术可以帮助我们研究蛋白质的修饰,如磷酸化、甲基化、糖基化等(www.e993.com)2024年11月3日。通过质谱分析,我们可以确定修饰位点和修饰类型,从而了解修饰对蛋白质功能的影响。4.蛋白质结构研究:质谱技术与其他结构生物学方法(如X射线晶体学和核磁共振)结合,可以用于蛋白质的结构研究。质谱数据可以提供关于蛋白质的碎片离子和氨基酸序列的信息...

...突破性的纳米蛋白质组学技术揭示人体心肌肌钙蛋白复合物的结构...

在非变性条件下,使用肽功能化的超顺磁性纳米粒子对cTn复合物进行富集和纯化,以实现cTn复合物的同位素解析,揭示其复杂的结构和组装。此外,nTDMS阐明了cTn复合物的化学计量和组成,定位Ca2+结合域,定义cTn-Ca2+结合动力学,并提供蛋白质形态的高分辨率图谱。这种天然纳米蛋白质组学策略为内源天然蛋白质...

...团队发展免疫邻近标记技术高分辨解析神经元轴突起始段蛋白质组

图2:通过标记内源基因筛选AIS分子总结一下,该研究发展了可用于标记神经元亚细胞结构AIS的免疫邻近标记技术,揭示了AIS在神经元发育过程中的蛋白质组动态变化。该蛋白质组数据有助于指导后续针对AIS组分的研究,对深入理解AIS调控神经元兴奋性和引发病理缺陷的机制奠定了基础。

清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法

DNA与蛋白质相结合是生物学中许多关键生物过程的基础,包括DNA转录、复制、表达等环节。转录因子是一类特殊的DNA结合蛋白质,它们通过与特定的DNA序列(基序)结合,调控基因的转录过程。因此二者的相互作用是维持生物体遗传信息传递的关键一步,现有一些计算方法主要分为从基于序列角度和结构角度来预测二者的结合位点,基于序列...

专访| 复旦大学复杂体系多尺度研究院首任院长马剑鹏:AI for...

同时,AI在蛋白质结构解析技术上的发展,将对酶工业、抗体改造和生物材料等领域产生深远影响,实现更高效和定制化的创新成果。比如,AI可以解析酶的活性位点并识别关键的氨基酸残基,从而帮助工程师通过定向进化或理性设计改造酶,以实现更高的催化效率、稳定性等。