追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
AlphaSeq是全球最大的PPI数据集,包含超过7.5亿条测量数据,为研究人员提供了丰富的资源,用于更精确地预测和设计蛋白质。通过这一数据集训练的AlphaBind模型,能够预测具有不同结合特性的蛋白质序列,从而为药物开发和蛋白质设计提供支持。此外,AlphaSeq实验平台还具备高效的大规模数据收集能力,每月可执行数百万次PPI结合亲和...
Nature Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互...
蛋白质-DNA结构通常通过X射线晶体学、核磁共振光谱或冷冻电子显微镜实验获得,并存储在蛋白质数据银行(PDB)中。尽管这些结构显示了一个结合的DNA序列和相关的物理化学相互作用,但它们并不包含所有可能结合的DNA序列。相反,结合特异性数据可以通过蛋白质结合微阵列、SELEX测序、染色质免疫沉淀测序等实验获得,但这些...
蛋白组学测序数据表怎么看
蛋白质的通用名称或描述性名称。3、谱图计数(SpectralCount)检测到的谱图数量,反映了蛋白质在样本中的相对丰度。4、肽段序列(PeptideSequence)用于识别蛋白质的特定肽段的氨基酸序列。5、肽段数(PeptideCount)检测到的特定肽段的数量。6、丰度值(AbundanceValue)蛋白质在样本中的定量信息,通常用质...
胶原蛋白在化妆品中的应用
所有胶原蛋白结构的一个特征是形成所谓的绳索,即右手超螺旋,这是由三条左手、单一多肽链围绕自己的轴缠绕而成。每种CLG在生物合成过程中有不同的起始阶段。共同步骤包括细胞内反应和三螺旋形成、翻译后修饰、酶促糖基化和赖氨酸羟基化、前胶原的蛋白酶裂解,以及自然交联。迄今为止,在人体组织中已检测到30种不同形...
在这迷人又壮美的科学领域,"中国玩家"能奋起直追吗?
科学家将蛋白质培育成晶体,用X射线轰击它们,并测量射线的弯曲,这就是X射线晶体学。20世纪60年代,生物学家马克斯·佩鲁茨和约翰·肯德鲁用这种方法确定了血红蛋白和肌红蛋白的3D结构,又一项获得诺贝尔奖的工作产生了。随着更多蛋白质结构被发现,科学家们在1971年建立了蛋白质结构的免费档案库——蛋白质数据银行。最...
准确率比现有方法高50%!谷歌DeepMind全新深度学习模型AlphaFold 3...
AlphaFold3的生物分子结构准确率比现有最好的方法高50%论文称,基于AlphaFold2能力的提升,AlphaFold3如今能预测蛋白质与其他蛋白质、核酸、小分子、离子、修饰蛋白质残基的复合物,以及抗体-抗原相互作用,其预测准确性显著超过当前预测工具,包括AlphaFold-Multimer(www.e993.com)2024年9月7日。DeepMind团队称,这意味着AlphaFold3将人类带到了蛋白...
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
??与AlphaFold2.3相比,AlphaFold3在预测蛋白质-蛋白质结构方面,抗体结合结构显著增强;??此在蛋白质-核酸相互作用方面,AlphaFold3优于其他竞争方法,如RoseTTA2FoldNA等;??在RNA结构预测方面,AlphaFold3优于自动化技术,但略低于顶级CASP15参赛者,后者涉及专家手动干预。但饶有意味的是,针对...
...烟台大学杨建荣副教授等:不同处理方法对蛋黄及其组分结构和...
鸡蛋是天然食品中最理想的蛋白质来源之一,主要由蛋壳、蛋清和蛋黄组成,蛋黄是其中结构最为复杂的一部分。通常认为蛋黄组分难以分离,现阶段最简单的分离方法是对蛋黄进行冷冻离心分离,得到蛋黄颗粒和蛋黄浆质。蛋黄颗粒与蛋黄浆质的结构均较为复杂,且是天然的纳米和微米尺度自组装结构单元。与浆质相比,颗粒结构更为复杂...
复旦团队开发新型AI算法“看清”蛋白质精细结构,可与AlphaFold...
该算法不但能够成功地解析冷冻电子显微镜(Cryo-EM)结构解析技术中因传统方法无法分辨而缺损的生物大分子(比如蛋白质、核酸或蛋白质/核酸复合物等)结构,并且高效精准地分辨出柔性结构域在受测样品中的构象分布。这一新方法能有效建立高精度的生物大分子结构模型,帮助解决药物设计中因目标蛋白结构不准而导致的新药...