优选项目齐聚燕城!永安这场创新创业大赛有看头(二)!
解决冷冻电镜使用过程中存在气液界面、冰层过厚、进孔率低、样品位移等问题,大大提升蛋白解析能力。13单位BGI未来实验室石墨烯热管理石墨烯均温板本产品改用固态的具备高导热性能的石墨烯作为内芯,制备了新型的金属基复合散热材料。具体采用金属(主要为铝合金或铜)对石墨烯进行封装制成的“三明治”结构均温...
...马剑鹏团队在计算生物学取得突破,实现蛋白质结构冷冻电镜解析...
图1.OPUS-DSD重构结构模型与传统冷冻电镜软件解析的模型对比。在虚线标示的区域中,OPUS-DSD重构的模型(绿色)比传统冷冻电镜软件解析的模型(紫红色)有更加完整的电子密度。这是因为OPUS-DSD能分开重构不同三维构象,而不会将其重叠在同一个三维模型中。▲图2.OPUS-DSD解析的构象变化。绿色和古铜色分别代表OPUS...
Nature Methods | 超过AlphaFold2精度,蛋白质互作结构预测新工具
DMFold算法包括两个部分,蛋白质单体结构预测算法DMFold-Monomer和蛋白质复合物结构预测算法DMFold-Multimer。三、结果分析(1)提升蛋白质单体结构预测精度这项研究首先在蛋白质单体预测问题上与AlphaFold2算法进行了比较。图6展示了DMFold(DMFold-Monomer,后文简称DMFold)与AlphaFold2在132个非冗余的困难蛋白...
追问|蛋白质结构预测模型再升级,解锁新功能直接作用药物设计
DeepMind称,AlphaFold-latest可以预测蛋白质数据库(PDB)中几乎任何分子的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)以及含有翻译后修饰(PTM)的生物分子。DeepMind表示,这一模型的扩展功能和性能将加速生物医学领域的突破,推动人类迈向下一个“数字生物学”时代,为疾病通路的功能研究、基因组学、生物...
科学家解析光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体结构,助推原核生物光合...
科学家解析光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体结构,助推原核生物光合作用元件研究,蛋白,细胞,亚基,玻璃,叶绿素,玫瑰菌,光合作用
...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...
Natput.Sci|基于深度学习的无rotamer蛋白质设计ComputStructBiotech|深度学习用于蛋白质设计:从结构到序列与功能本课程围绕蛋白设计基础与前沿工作展开讲述,从蛋白结构的预测与优化到蛋白的从头设计进行深度教学,本课程主要面向有编程基础的学员,对基础知识进行详细讲解,并且会结合前沿文献讲解相关技术的应用(www.e993.com)2024年9月16日。
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
其中,英伟达、AMD等产业龙头为AI提供了坚实的算力基础;谷歌云、亚马逊云和阿里云等成熟云服务供应商则为AI应用提供了稳定、高效的软件支持。在蛋白质相关的人工智能算法领域,国内大部分公司在AI研发方面选择采用开源的算法底层框架,如TensorFlow、PyTorch等。常用的包含蛋白质信息的数据库,比如,蛋白质结构信息...
解析R848结合流感疫苗的偶联剂依赖效应:对APC激活及体内免疫原性...
使用流式细胞仪采集样品,并使用相应软件进行分析,随后对肿瘤坏死因子α和IL-12p70进行酶联免疫吸附试验。9.为小鼠接种疫苗在3周龄BALB/c小鼠肌肉注射IPR8、IPR8-SM(PEG)4-R848或IPR8-GMBS-R848。免疫后14天分离小鼠血清(P.V.)。并检测PR8特异性免疫球蛋白抗体。用6周龄幼稚的BALB/c小鼠血清作为未接种...
大连化物所叶明亮团队开发出一种位点特异性糖型的高稳健蛋白质组...
在本工作中,研究人员开发了一个高稳健的位点特异性糖型蛋白质组学分析系统。该系统采用自动化方法富集生物样本中的N-完整糖肽,然后采用微流LC-MS/MS系统检测N-完整糖肽,并利用团队开发的Glyco-Decipher软件鉴定和定量位点特异性糖型。科研人员使用该系统分析了200多个样品,发现其富集特异性保持在88.1%到91.7%之间,...
Nature Methods | 张阳团队开发远超AlphaFold2精度的蛋白互作结构...
图4.DeepMSA2蛋白质复合物MSA构建的算法(DeepMSA2-Multimer)通过将DeepMSA2算法与AlphaFold2端到端结构训练模块结合,该研究提出了蛋白质单体及复合物结构预测算法DMFold。DMFold算法包括两个部分,蛋白质单体结构预测算法DMFold-Monomer和蛋白质复合物结构预测算法DMFold-Multimer。