中国科大在基因转录调控研究中取得突破性进展

最近中国科大生命科学学院单革教授实验室研究发现,秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55,共调控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等在内的数以千计的靶基因的表达,从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《发育·细胞》(DevelopmentalCell)上。为了获知这两个...

中国科学院团队发布GeneCompass:解析基因调控密码,打造新范式

如果把基因表达值看作单词,组合在一起构成细胞「句子」,进而形成组织「段落」和器官「文章」,并将不同物种作为生命「语种」,利用LLMs相关技术有望构建系统精准破解基因密码的生命基础大模型,探索生命普遍存在的非线性基因调控机制,增进理解生命底层共性规律并创新各种重大疾病的诊疗手段。对此,中国科学院多个院所(包括...

...构建:基于模型构建发展核心素养的教学探索——以“基因的表达...

1)通过分析科学史系列实验、阅读文本、视频配音、模拟基因表达过程等活动任务,构建基因表达的概念模型和物理模型。2)分析转录、翻译的相互关系,阐明基因表达的整体性,建立结构与功能观、信息观等生命观念,领悟科学实证主义精神。3)通过设计实验、分析实验、讨论交流等活动,提升科学探究能力、科学思维,培养团队合作意识。

西交团队研发TDEseq生物测序法,能揭示存在特定表达模式的基因

具体而言:在单细胞RNA测序(scRNA-seq)的时间序列数据分析中,人们通常会进行基因差异表达分析。通过此,可以识别那些表达水平随时间变化或生物过程发展而变化的基因(这种基因也被称之为“时间动态差异基因”)。在一些生物过程中,这些基因可能扮演着重要角色。特别是那些表达模式呈现出随时间逐步上调或下调、或者先上...

茭白MADS-box基因家族有哪些保守基序和基因结构特征?

MADS-box基因在N-末端含有一个高度保守的区域,由58~60个氨基酸组成,与DNA结合,是转录激活的重要组成部分。根据保守域和系统发育关系,MADS-box蛋白可以分为两类:类型I(M型)和类型II(MIKC型)。类型I包含三个亚家族,Mα、Mβ和Mγ,类型II不仅包含MADS保守域,还包括干预域、角蛋白样域和C-末端域。类型II可以...

一文全面掌握 NSCLC 中的 MET 基因异常相关临床问题

NSCLC中主要存在哪些MET异常?NSCLC中MET异常包括MET基因第14号外显子跳跃突变(MET14跳突)、MET基因扩增、MET基因点突变(主要是激酶区突变)、MET基因融合及MET蛋白过表达等(www.e993.com)2024年11月20日。2不同类型的MET异常如何导致肿瘤发生?MET14外显子跳跃突变是MET降解失活的主要原因。MET14外显...

MOL NEURODEGENER综述:小胶质细胞中的阿尔茨海默病风险基因

APOE可能属于高危和高患病率的类别,在AD患者中ε4等位基因的频率在19.2%-36.7%之间,在对照人群中为8.9-19%。APOE编码血浆脂蛋白的核心成分,其功能是将脂质从一种组织或细胞类型运输和输送到另一种组织或细胞类型。APOE在健康人脑的星形胶质细胞中高度表达,但其表达在人AD大脑中以细胞特异性方式失调—它在小胶质细...

HER2 变异形式有哪些?不同瘤种分别推荐何种检测方式?又如何判读?

目前,免疫组织化学(IHC)法是检测HER2蛋白过表达的「金标准」,荧光原位杂交(FISH)法是检测HER2基因扩增的「金标准」,而二代测序(NGS)、Sanger测序、实时荧光定量PCR等则主要用于HER2突变检测,其中NGS技术不仅能够检测出几乎所有的HER2突变类型,而且能够检测HER2基因扩增情况,并能同时检测多种其他...

解读诺贝尔奖:微小RNA如何调控细胞的命运?

当然miRNA和表观遗传之间,其实有两方面,一方面miRNA通过post-transcription作用,就是转录后的一些调控,这是目前转录抑制调控非常重要的东西,通过3’端来抑制作用。我们知道,表观遗传还涉及转录水平的调控。这一块牵涉非常多,比如外界环境是怎么来影响这些基因的表达。

Nature Methods | 革命性的CRISPR-CasRx筛选平台:开启癌症基因组...

平台的核心组成包括:高通量测序技术:为了实现对大量lncRNA的同时筛选,该平台采用了最新的高通量测序技术,保证了数据的准确性和高效性。精准的gRNA设计:通过先进的生物信息学算法,为每个目标lncRNA设计特异性高的gRNA,确保了编辑的准确性和效率。高效的Cas13d表达系统:优化的载体和表达系统保证了Cas13d在细胞中的...