AI填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制,促进新药...
然而,结构生物学领域历来专注于研究折叠成稳定3D结构的蛋白质和核酸,目前对蛋白质在细胞中如何发挥功能的理解大多基于“序列-结构-功能”关系这一概念。而真核生物中约有30%的蛋白质并不折叠成稳定的3D结构,这些动态变形的蛋白质就是IDPs,或者当它们位于其他结构化蛋白质域的背景下时,被称为“固有无...
中国科大揭示跨膜蛋白SIDT1调控人类核酸摄取的分子机制
结构分析显示SIDT1呈现同源二聚体结构,每个亚基包含两个细胞外结构域(ECD1和ECD2)和一个由11股跨膜螺旋组成的跨膜结构域(TMD)。结构比对表明SIDT1属于跨膜水解酶CREST超家族,但与该超家族的其他成员相比,却以同源二聚体形式发挥作用,且具有相反的拓扑结构。SIDT1每个亚基的TMD中存在额外的分支状密度,可容纳一个...
AlphaFold3问世,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构
它们由蛋白质、核酸、糖类等分子组成,但没有一个单独的部分可以单独发挥作用。只有了解它们如何在数百万种组合中相互作用,科学家才能开始真正理解生命的过程。GoogleDeepMind发布的AlphaFold3无疑是一种革命性的模型,能够以前所未有的精度,预测所有生命分子的结构和相互作用。对于蛋白质与其他分子类型的相互作用,Alpha...
生物学研究选什么牌子型号紫外可见分光光度计?FUP UV系列应用广
在蛋白质和核酸的定量分析中,自动建立标准曲线能够确保测量结果的准确性,减少人为误差。FUPUV系列支持全波长光谱扫描功能,用户可以获取样品的光谱图,进一步分析样品的化学结构和组成信息。虽然这一功能在直接定量分析中不占主导地位,但它为定性分析提供了有力支持,有助于验证定量结果的准确性。二、生物分子结构研究...
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
蛋白质作为生命活动的基本组成单元,其结构、功能、相互作用与调控机制复杂性一直是科学家们探索的重点。传统的蛋白质研究方法,如X射线晶体学、核磁共振和冷冻电镜等,虽然在解析蛋白质结构方面取得了巨大成就,但仍面临着成本高、效率低、数据获取有限等挑战。
研究揭示哺乳动物SID-1跨膜家族蛋白低pH核酸转运的潜在分子机制
综上,该研究解析了哺乳动物细胞跨膜家族蛋白SIDT1和SIDT2的冷冻电镜结构,并首次提出了SIDT1和SIDT2与RNA的pH依赖性结合和寡聚化的分子特征(www.e993.com)2024年9月8日。因此,该成果为SID-1跨膜家族蛋白在核酸转运方面奠定了分子基础,并为“基因跨界调控”现象提供了直接的理论分子依据。
中国科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的...
在生命体健康的情况下,Ago蛋白会以个体的形式在生命体内游弋。当检测到病毒的核酸入侵时,它们会迅速组合成功能单位,迅速分解体内的辅酶I(NAD+,即烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)。辅酶I是负责传递氢离子的辅酶,参与生命体内的糖酵解、呼吸链等生命活动。它的大量消耗意味着被病毒感染的生命体会迅速走向死亡。而随着宿主的死去...
他,博士毕业五年就获“国家杰青”资助,玩转核酸材料!
基于框架引导组装(FGA)策略,作者通过筛选一系列跨膜肽作为主要疏水基团(LHG),成功制备了结构组成与真核细胞相似的异质脂质体。结果表明,LHG的构象和跨膜模式在FGA过程中起主导作用。FGA脂质体的形成具有良好的稳定性,这可能进一步为细胞骨架-膜蛋白-脂质双层模型提供证据。作者相信,该系统提供了进一步的证据,证明细胞...
...丁玮/朱洪涛团队揭示外源核酸触发NAD+酶激活原核短Ago蛋白的机制
Argonaute(Ago)蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点,达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago,原核生物的Ago展现出多样性,分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域,即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域。这...
更高准确性,覆盖蛋白等更多分子,DeepMind发布AlphaFold新版本
通过解锁蛋白质和配体结构以及核酸和含有翻译后修饰的结构的建模,AlphaFold-latest为检查基础生物学提供了更快速和准确的工具。其中一个例子涉及到CasLambda与crRNA和DNA结合的结构,这是CRISPR家族的一部分。CasLambda具有CRISPR-Cas9系统的基因组编辑能力,通常被称为「基因剪刀」,研究人员可以用它来改...