...杨茂君破译线粒体超大分子量多酶复合物的全景空间结构及组装机制

二者同属α-酮酸脱氢酶复合体家族(OADHcfamily)1,该家族成员主要由三个种类的酶单元多聚构成:(E1)α-酮酸脱氢酶家族蛋白;(E2)酰基转移酶家族蛋白;(E3)黄素蛋白;其分子量在4到10兆道尔顿(MDa)之间。长期研究表明,OADHc在线粒体内多条能量代谢通路上均发挥重要作用。其中,PDHc作为糖代谢过程中的门...

同时生成蛋白序列和结构,David Baker团队序列空间扩散新模型

蛋白质功能源于序列和结构特征的复杂相互作用;因此,设计新的蛋白质功能需要对序列和结构空间进行推理。许多蛋白质设计方法分步对结构和序列进行采样,通常先生成蛋白质主链,然后使用逆折叠方法生成序列。传统方法,如Rosetta灵活主链蛋白质设计,在结构和序列设计之间交替进行,而最近基于深度学习的方法通常先生成主链,然后...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

大多数NMPFs(64,186个,占60.44%)由来自宏基因组和宏转录本组的蛋白质混合组成,进一步证实了它们的存在,而38,292个NMPFs(占36.06%)只包含在宏基因组中发现的蛋白质,3,720个NMPFs(占3.50%)只包含在宏转录本组中发现的蛋白质(补充表5)。含有来自宏基因组和宏转录本组的成员的科的百分比随着...

AI从业者怎么做Science?清华大学AIR周浩:从文本生成到蛋白质设计...

但蛋白质的双向依赖性非常强,其前后左右顺序又不易确定,如果直接使用文本或图像模型来生成分子结构,将面临极大的困难。为了应对上述挑战,周浩教授团队在数据结构、生成算法以及基座构建等方面进行了深入研究。从数据结构出发,找到本征的数据刻画空间仅保留二面角自由度,重构分子3D结构表示「如何确定分子或目标数据...

31.5公斤 空间科学实验样品顺利返回并交付科学家

据央视新闻客户端消息,4月30日,中国空间站第六批空间科学实验样品随神舟十七号飞船顺利返回。本次下行返回的科学实验样品涉及23项科学实验项目,包括人成骨细胞、骨髓间充质干细胞、蛋白质晶体、生命有机分子、种子等32种生命实验样品以及无容器材料、高温材料和舱外暴露材料等18种材料样品,总重量约31.5公斤。

Cell | 单细胞测序+蛋白质组成像,绘制迄今最全面的空间分辨健康...

CODEX细胞类型的蛋白质表达谱与scRNA-seq数据高度匹配,匹配的细胞类型得分非常高,最终细胞类型注释可用于“细胞表型图”中细胞拓扑结构可视化(www.e993.com)2024年11月8日。该注释参考图是造血细胞在其微环境背景下的拓扑综合图谱,凸显了这两个图谱在了解人类骨髓细胞解剖学方面的互补性。

孙奋勇教授:分子诊断创新技术研究前沿

该研究开发了一种可逆HCR,与成熟的DNA交换技术相结合,利用CAD构建了可扩展序列数据库,并通过与免疫识别偶联,使CAD-HCR成功应用于单细胞水平的空间蛋白质组学的敏感成像分析。研究人员采用荧光染料修饰HCR的发夹来验证其放大效应。与未扩增组相比,经过扩增后的信号放大了65倍,大大有利于后续的成像;同时,用荧光染料修...

整合生命组学数据,揭示生命复杂系统构成原理

阐释人类发育、衰老和重大疾病的发生机制?本文是国家蛋白质科学中心(北京)谢林海博士撰写的对转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间转录组学的概念、数据、方法、应用等各方面的介绍。关键词:生命复杂系统,转录组学,蛋白质组学,机器学习谢林海|作者...

“小柯”秀---中国科学院

据介绍,根据图谱建立三维结构模型是利用冷冻电镜研究蛋白质及其复合物不可或缺的一步。虽然冷冻电镜图谱的分辨率已普遍提高,但在许多情况下仍难以追踪蛋白质主链。相关论文信息:httpsdoi/10.1038/s41592-023-02099-0《自然-遗传学》一种算法框架揭示空间细胞微环境...

“两院院士评选2023年中国/世界十大科技进展新闻”揭晓—新闻...

科学家表示,这项研究为人们理解人类大脑的结构和功能提供了宝贵信息,将有助于进一步的研究和临床应用。它代表了科学界在解开大脑奥秘方面的重大突破,为未来的神经科学研究开辟了新方向。2.人工智能首次成功从零生成原始蛋白质(图片来源:IANC.HAYDON)