AI面临的五个蛋白质设计问题,Nature找了一群专家来讨论

在8月份的预印本中,Baker团队利用RFdiffusion创建了一组称为水解酶的酶,这些酶通过多步骤过程利用水来破坏化学键。研究人员利用机器学习分析了酶的哪些部分或基序在每个步骤中处于活跃状态。然后,他们复制了这些基序,并要求RFdiffusion围绕它们构建全新的蛋白质。当研究人员测试了20种设计时,他们发现其中两...

中国科大揭示Lon蛋白酶在单个蛋白水解位点对底物进行持续切割

晶体结构表明,AAA+和蛋白酶结构域形成一个封闭的腔室,六个ATP酶位点朝外,六个蛋白水解活性位点朝内。已有研究表明了与共价抑制剂结合的蛋白水解活性位点的结构,然而,与蛋白酶活性位点结合的底物结构尚未确定。迄今为止,人们致力于了解蛋白质底物如何被AAA+蛋白酶的AAA+环识别、去折叠和移位,张凯铭/张崇毅团队在2021...

FSAP | 重庆工商大学杨景副教授:酶解对食物过敏原致敏性和消化率...

常用的酶包括水解酶(胰蛋白酶和木瓜蛋白酶),而其它酶,如酪氨酸酶、多酚氧化酶、漆酶和乙酰转移酶转谷氨酰胺酶,主要用于蛋白质的交联。基本机制大致分为两类:(1)蛋白酶将过敏原分解为肽、氨基酸或其他小分子,从而改变其空间结构;(2)酶导致分子间或分子内交联,从而改变蛋白质构象。总体而言,酶解是降低蛋白质过敏...

100%降解,中国科学院团队基于AI计算策略设计新水解酶

总的来说，这项研究通过结合蛋白质语言模型和基于力场算法设计出新型PET水解酶，兼具平衡热稳定性和高效水解能力，解决此前残留不可生物降解PET废弃物的挑战，在工业级PET塑料循环利用中展现出较大潜力。▲图｜TurboPETase等酶在生物反应器中对PET塑料的降解（来源：NatureCommunications）这篇论文的共同...

吉安市人民政府 灵华山白茶

在白化期,由于叶绿素合成受阻,蛋白质水解酶活性升高,可溶性蛋白质的大量水解,导致氨基酸含量上升,平均含量是一般品种的2—3倍。据农业部茶叶质量监督检验测试中心检测,氨基酸含量高达6-7%,比常茶高二至四倍,茶多酚含量10.7%,比常茶低一半,叶绿素含量甚低,正是永丰良好的生态环境孕育出了灵华山白茶这一茶中奇葩。

《食品科学》:上海交通大学焦顺山副教授等:米糠酸败机制及其稳定...

当处理温度高于100℃时,米糠分离蛋白的发泡性能和溶解度降低,而吸收和乳化性能提高;米糠分离蛋白的一级结构未观察到显著变化,但二级结构随无规卷曲含量的增加和α-螺旋与β-折叠含量的减少而改变,三级结构也发生了变化(www.e993.com)2024年11月29日。然而,在射频电极板间距10.5cm、射频温度92℃、射频时间5.3min的条件下,米糠蛋白含量变化不...

中国肉类食品综合研究中心张凯华高级工程师等:磷脂分子调控畜禽肉

宰后生鲜肉中磷脂经磷脂酶水解,使线粒体膜和细胞膜完整性下降、通透性增加,进而加速蛋白水解酶释放和肌纤维降解、促进肉的嫩化;膜完整性的下降在一定程度上影响肌肉组织表面光的散射,进而改变肉的亮度(L*)。在生鲜肉贮藏和加工过程中,磷脂分子经内/外源磷脂酶和脂肪酶水解生成游离不饱和脂肪酸,油酸、亚油酸、花生...

iMetaOmics | 张勇/李福平-先进糖蛋白组学在男性生殖研究中的潜在...

几年后,人类精子和精液的大规模N-糖蛋白组逐渐被报道。然而,这些研究无法提供详细的糖链结构及其在糖蛋白中的确切糖基化位点,导致结构-功能相关性不清晰。最近,通过利用大规模和位点特异性糖蛋白组学方法克服了这一缺点。基于这些发展,可以认为,正常精子质量的男性的精子和精液N-糖蛋白组已被大致描述,为进一步研究...

“口服胰岛素”治疗糖尿病的研究进展与展望

为了克服口服胰岛素的给药屏障及提高生物利用度,主要通过以下几方面对口服胰岛素的给药系统进行探索:(1)对胰岛素进行化学结构修饰;(2)设计新型载药系统。(3)渗透增强剂和吸收促进剂。(4)蛋白酶抑制剂。有时将多种方式联合使用。1.化学结构修饰将胰岛素与配体或聚合物偶联等化学结构修饰,可改善其理化性质及跨膜...

吃菠萝不扎嘴的方法(不是泡盐水),学到了!

菠萝蛋白酶是存在于菠萝植株中的一种蛋白质水解酶,这种蛋白酶不是单一的成分,而是由多种不同分子量和分子结构的酶组成的多种酶,属于巯基蛋白酶类。这种蛋白酶会破坏牙龈、口腔黏膜等结构,让我们产生不适感。菠萝蛋白酶也会导致一部分人对菠萝过敏,出现腹泻、呕吐、全身发痒、四肢及口舌发麻等症状,甚至还可能出现...