超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用

下图展示了AlphaFold3对RNA修饰蛋白复合物的结构预测,该复合物包含一个蛋白质(蓝色)、一条RNA链(紫色)和两个离子(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。下图展示了AlphaFold3对一种分子复合物的结构预测,该复合物包含一种酶蛋白(蓝色)、离子(黄色球体)和单糖(黄色),预测结果与真实结构(灰色)非常吻合。这种酶...

...生物相容性和多功能性于一体的自组装β-折叠蛋白纳米纤维与...

蛋白质纳米纤维的二级结构在复合材料的性能中扮演着关键角色。通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)和圆二色谱(CD)等技术,研究人员对SPI-Ga复合材料中的蛋白质二级结构进行了表征。实验结果表明,自组装的蛋白质纳米纤维中富含β-折叠结构,这种结构提供了材料所需的机械强度和稳定性。FTIR光谱中的酰胺I带(1700–1600cm??...

??研究蛋白质热稳定性的几种方法

圆二色光谱(简称CD),或红外(傅里叶变换红外(FourierTransformInfrared,FTIR)光谱),是应用最为广泛的测定蛋白质二级结构的方法,是研究稀溶液中蛋白质构象的一种快速、简单的方法。圆二色谱法诞生于20世纪60年代,其原理是利用左、右两束偏振光透过具有手性结构的生物大分子等活性介质,获得的圆二色谱来分析其结构特点,...

...副教授等:辣木籽ACE抑制肽的分离纯化、结构鉴定及其体外活性评价

通过对吸收峰面积变化计算蛋白质二级结构相对含量,得出该肽由22.8%α-螺旋、33.3%β-折叠和43.9%β-转角构成。研究发现,通常肽二级结构中β-转角中含有较多的氢键是较有序、规则的结构,表明肽QGPRPQ结构较为稳定。06肽QGPRPQ的酶抑制动力学分析通过Lineweaver-Burk双倒数图探究肽QGPRPQ抑制ACE的动力学模式...

“阿尔法折叠3”来了极大提升对蛋白质—分子结构的预测能力

研发团队认识到这一新方法还存在一些局限性,比如约4.4%的结构会出现不正确的手性(一种对称特性),或是幻觉导致“飘带”(一种常见的蛋白质二级结构元素)的出现减少。他们补充道,准确率进一步提升需要生成一个很大的预测集并对预测结构进行排序,而这会产生额外的计算成本。(张梦然)...

又一突破性成果!人工智能大模型预测蛋白质结构速度再次提高数百倍!

在最底层,一些氨基酸通过肽键结合在一起,组成一些多肽链,多肽链内部的氨基酸序列,被称为蛋白质的一级结构(www.e993.com)2024年11月3日。然后,不同的多肽链又通过氢键连接,折叠成简单的形状,如螺旋状或环状等,这种结构被称为蛋白质的二级结构。接下来,在更大的层面上,螺旋或环又进一步折叠成一个三维空间内紧凑的结构,被称为蛋白质的三级...

深圳湾实验室周耀旗:填补AlphaFold 2缺口,开启所有蛋白质结构的高...

2020年底，其人工智能系统“AlphaFold2”一战成名，将人工智能预测的蛋白质结构达到了实验测定的精确度。直到今年10月底，DeepMind对蛋白质结构的研究仍在继续，并对外剧透：AlphaFold3即将推出，已用于药物设计。具体细节可点击文章：「AlphaFold3」要来了？DeepMind最新推出新一代蛋白质结构预测工具，已用于药物设计...

圆二色光谱分析指导蛋白质结构与功能关系的研究

2.圆二色光谱在蛋白质结构研究中的应用:2.1α-螺旋和β-折叠的鉴定:圆二色光谱可以区分α-螺旋和β-折叠等常见的二级结构形式。通过分析吸收曲线的特征峰值和谷值,可以确定蛋白质中这些二级结构的含量和空间分布。2.2蛋白质折叠状态的研究:圆二色光谱可以帮助研究蛋白质的折叠状态。变性条件下,蛋白质会失去原...

生物药物质量控制利器:圆二色谱测蛋白质结构为生物制品表征带来

圆二色谱是一种基于手性分子对圆偏振光的吸收和旋转的测量技术。蛋白质中的手性氨基酸残基对圆偏振光具有旋光效应,不同二级结构元素表现出特定的圆二色谱光谱图。圆二色谱通过测量样品对左旋和右旋圆偏振光的吸收差异来获得蛋白质的结构信息。2.圆二色谱在蛋白质结构分析中的重要性...

...河北农业大学王文秀副教授等:南美白对虾热风干制过程蛋白质与...

拉曼光谱中酰胺I区(1600～1700cm-1)峰的变化与蛋白质二级结构变化密切相关。蛋白质二级结构主要包含α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲,其中α-螺旋与1651～1660cm-1之间的峰有关,表征蛋白质分子的规整性。干制会使虾的蛋白质二级结构发生变化,因此酰胺I区的峰形会随之变化。