亲和力与天然蛋白相当,中国科大蛋白质从头设计方法登Nature子刊

在生成实验可实现的蛋白质结构方面,SCUBA-D与基于预训练RoseTTAFold的RFdiffusion的性能相当,但它可以轻松生成尚未观察到的整体折叠与RoseTTAFold可预测的折叠不同的蛋白质结构。SCUBA-D的准确性已通过16种设计蛋白质和一种蛋白质复合物的X射线结构以及验证设计的血红素结合蛋白和Ras结合蛋白的实验...

西湖大学卢培龙/陶亮团队从头设计迷你结合蛋白,广谱中和艰难梭菌...

研究团队从头设计了由50-65个氨基酸残基组成的D型蛋白质,旨在靶向L型蛋白质或L型多肽的特定表面区域。从头设计靶向L型蛋白质的D型蛋白质该研究设计的D型蛋白质结合物对人工L型多肽以及两种具有治疗意义的天然蛋白质(人TrkA蛋白的D5结构域、人IL-6蛋白)表现出纳摩尔级(nmol)亲和力。值得注意的是,这些D型蛋白...

蛋白质减肥法的原理和方法有哪些

一、限制蛋白质的摄入量1.建议每天蛋白质的摄入量不超过每公斤体重0.8克,并且以植物蛋白为主,如豆腐、豆浆等。2.避免高蛋白食物,例如肉类、鱼类以及奶制品等。3.增加膳食纤维的摄入,例如水果、蔬菜等,有助于提高饱腹感并降低总热量的摄入。4.注意补充其他营养素,例如维生素、矿物质和碳水化合物等,以确保身...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

答案在于,蛋白质拥有丰富而复杂的空间结构,这些结构决定了蛋白质的功能。蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上...

蛋白质折叠的细胞密码破解,有望为治疗多种疾病开辟新途径

大约7000种不同的蛋白质（占人体所有蛋白质的1/3）在内质网中制造。分泌蛋白质负责从人体的酶到免疫和消化系统的一切，必须正确折叠才能使人体正常运作。而一种称为“伴侣”的特殊分子，有助于将蛋白质折叠成最终形状，同时其还能识别错误折叠，并在它们造成损害之前“解决”它们。“伴侣系统”的发现，归功于糖蛋白...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生

图|蛋白质结构水平(来源:MarkBelan)地球上已知的蛋白质有数亿种,未知的也有很多(www.e993.com)2024年11月25日。它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

图|蛋白质结构水平(来源:MarkBelan)地球上已知的蛋白质有数亿种,未知的也有很多。它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。

入选ACL 2024!实现蛋白质数据与文本信息跨模态解读,中科大王翔...

中国科学技术大学王翔,联合新加坡国立大学刘致远团队、北海道大学研究团队提出了一个全新的蛋白质-文本建模框架ProtT3,该框架通过跨模态投影器,将具有模态差异的PLM与LM结合,在蛋白质字幕、蛋白质问答、蛋白质-文本检索任务中均取得了优异性能。探索蛋白质动态结构的奥秘,不仅是推动新药研发的关键一步,更是理解...

...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...

??项目1:蛋白质序列数据分析,如统计特定序列的频率、可视化序列分布等。??项目2:蛋白质结构预测,使用机器学习技术预测蛋白质的二级结构或功能位点。??项目3:开发一个小型的蛋白质设计工具,集成数据处理、分析及可视化功能。第二天shell命令行操作基础...

蛋白质也有等级,择优“指标”看这里

对于健康人群来说,可以通过一个简单的方法,计算自己每日需要的蛋白质摄入量,它涉及以下2个步骤:①计算标准体重(kg)◎男性的标准体重为:(身高cm-80)*70%◎女性的标准体重为:(身高cm-70)*60%②用标准体重乘以0.8～1比如一个健康女性的身高是155cm,减去70,乘以60%,那么她的标准体重就是51公斤,再乘以0....