宇宙最强Alphafold3,“下海”了|蛋白质|氨基酸|大分子|化合物...
折叠5,6次后的绳子,你去踢一脚,大概率是没法把它踢直的。对应到蛋白质中,折叠其实就是多肽链的结构逐渐变稳定的过程,就像高处的水始终会向下流一样。蛋白质的二级结构在折叠的花样上就很丰富了:α螺旋,β折叠,β转角等等。这些折叠方式都是有规律可循的,因为它们的底层原因是化学键的形成。比如α螺旋就...
很急!AI能不能让救命药来得更快一点?|靶点|高通量|克罗恩|化合物|...
这部分大体上有两种思路,一种我称之为“自下而上”式,从出问题的地方开始,比如某种蛋白质折叠错误,然后顺着与这个蛋白质相关的生理活动顺藤摸瓜,找到最终的病因;另一种我称之为“自上而下”式。直接从源头找问题,所谓源头也就是基因,在庞大的基因组里找相关的突变片段。PD-1正是这种方式里找到的。第二部...
AI能为科学研究做什么
最直观的方法就是根据他发现的规律计算出这个星体在未来某个时间点的位置,然后进行比对。从这个意义上讲,精确的计算和模拟就是验证理论的关键。但计算并不是那么容易的事情。例如,从理论上讲,各大星体之间的相对运动关系都可以由万有引力定律推出。牛顿在发现三大定律之后,就曾经很自豪地宣称,他已经掌握了宇宙运行...
为巩固权力玛雅统治者会在纪念性建筑上打上个人烙印
中科院古脊椎所所长邓涛研究员表示,共建分子古生物学实验室,就是希望用最前沿的分子古生物学方法,在揭示早期现代人在中国起源与演化的规律,复原中国乃至东亚不同时期现代人的迁徙路径、行为方式和生存面貌,厘清其与古老型人类的遗传关系和互动过程等这些关键的、亟待探索的科学问题上取得重要突破,为更新世晚期以来中国境...
Science 2020年十大科学突破解读
蛋白质结构预测的问题并没有完全解决,仍然需要很多工作。尽管AlphaFold2可以高精度预测蛋白质结构,但值得注意的是,在结果中还有超过三分之一的蛋白质的结构预测没有达到实验精度;而且蛋白质折叠过程和原理也有待进一步研究。此外,对于蛋白质—蛋白质相互作用、蛋白质动态结构变化以及蛋白质—生物分子复合物的结构也需要新...
Science 2020年十大科学突破解读—新闻—科学网
蛋白质结构预测的问题并没有完全解决,仍然需要很多工作(www.e993.com)2024年9月18日。尽管AlphaFold2可以高精度预测蛋白质结构,但值得注意的是,在结果中还有超过三分之一的蛋白质的结构预测没有达到实验精度;而且蛋白质折叠过程和原理也有待进一步研究。此外,对于蛋白质—蛋白质相互作用、蛋白质动态结构变化以及蛋白质—生物分子复合物的结构也需要新...
物理学咬文嚼字之一百:万物皆旋(上)
用四元数描述三维转动,有诸多优点:1)比矩阵表示紧凑;2)比矩阵表示容易快速计算;3)一对单位四元数可以表示四维空间的转动;4)没有奇点的问题。欧拉角就有这个问题,即所谓的gimbal-lock(方向支架锁定)现象,出现于比如pitch~yaw~roll(俯仰-偏航-翻滚)这样的转动系统。当pitch上下转了90°时,yawandroll...
2015第五届数学花园探秘科普活动分析
试听题目第6题,折叠剪绳子——间隔问题。一个绳子有两根头,找一找剪完之后一共有几个头就可以算出有几根绳子。在一年级秋季学期中小朋友们接触过不同类型的简单的剪绳子问题。笔试题目第2题,巧填数字——巧填算符。这个题目需要小朋友们有很好的数感以及计算能力。同时也考察枚举过程中孩子们的耐心,其实是很...
盘点2006安徽中考
5.强调过程和方法,降低计算难度。第23题计算题第1小问要求学生根据题意选择滑轮组绕线,第2小问计算滑轮组的机械效率,本题的重点在于学生要能明确承担动滑轮的绳子股数n=3,计算的难度较小;第24小题将效率问题分解成3个小问题,先求汽油的质量;再求汽油放出的热量;再计算汽油放出的热量用于发电,在效率为50%的...
独家专访DeepMind CEO哈萨比斯:我们将看到一种全新的科学复兴!今...
在某种程度上,这两个问题并没有太大不同。就像围棋一样,蛋白质折叠是一个极其复杂的组合问题,这是暴力计算方法无法比拟的。围棋和蛋白质折叠的另一个共同之处是,可以获得关于如何解决问题的大量数据。其中,AlphaGo使用了自己在过去积累的经验;AlphaFold使用了蛋白质数据库中现有的蛋白质结构(蛋白质数据库是一个...