AI赢麻了?2024年诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测|科技观察

DeepMind已经发布了该系统的详细工作原理，并发布了源代码。AlphaFold开源之后，影响力逐渐扩大。该公司还与欧洲生物信息学研究所（EuropeanBioinformaticsInstitute）建立了一个公共数据库，该数据库正在填充AI预测的新的蛋白质结构，条目几乎是科学已知的所有蛋白质。时至今日，借助AI工具，人类终于可以预测蛋白质结...

他们用AI破译蛋白质结构“密码”——三位科学家分享2024年诺贝尔...

诺贝尔化学奖委员会主席海纳·林克指出,今年的诺贝尔化学奖如同“双花并蒂”,他们一方面用计算软件构建出全新蛋白质结构,另一方面则基于氨基酸序列开发出名叫“阿尔法折叠2”的人工智能(AI)模型,实现对蛋白质复杂结构的预测。这两项科学突破携手开辟出巨大的可能性。从头设计全新蛋白质2024年诺贝尔化学奖“花落”蛋白质...

用AI模型预测蛋白质结构

“以20万的数据,推测出1亿多个蛋白质结构,准确率达90%,这就是AI的神奇之处。”许建和表示,自己的实验室也在以传统方式(包括冷冻电子显微镜、核磁共振或X射线晶体学等技术)破解蛋白质的结构,解析一个蛋白质,短至一个月,长的两三年,而且仅有1/3的成功率,由此可见Alphafold模型的意义所在。当然,AI模型目前不能...

AI概念大热!诺贝尔化学奖授予蛋白质结构预测领域科学家

“2024年诺贝尔化学奖得主大卫·贝克(DavidBaker)近几十年来一直从事蛋白质设计研究,设计出自然界中不存在的蛋白质分子,使其具有更好的功能或新颖的结构。”郑鹏介绍,蛋白质由氨基酸排列组合而成,设计难度非常高,最近5至10年里伴随着人工智能的发展,大卫·贝克将人工智能引入到蛋白质设计领域,使得蛋白质设计得到了质...

从计算机跨界生物学,坐了10年冷板凳后,他开创蛋白质预测新范式

在2023世界人工智能大会上，分子之心又推出了首个AI蛋白质生成大模型“达尔文（NewOrigin）”。分子之心曾向媒体透露，NewOrigin可“针对产业应用需求在几小时内、甚至是分钟级‘定制’具有特定功能的蛋白质”。此外，分子之心还推出了蛋白质动态结合设计算法，突破了AlphaFold等算法只能做蛋白质静态结构预测的局限，规避...

科学家开发生成式AI模型,可准确预测蛋白质-配体复合体结构

由团队开发的AI系统AlphaFold,是一个标志性的工作(www.e993.com)2024年11月25日。它把包括语言模型、视觉模型、生物学的归纳偏置等在内的建模思想,整合到一个大模型中,成功实现蛋白质结构预测。即便如此,AlphaFold依然存在较大的局限性。具体来说,该系统虽然可以良好地预测整个人类蛋白质组的蛋白单体结构,但如果想借助它在精准医疗、药物...

David Baker:可预测所有生物分子,生成具有高级结构的蛋白质

蛋白质是生命活动的物质基础,也是细胞内部的主要功能分子。公开资料显示,AlphaFold是DeepMind推出的蛋白结构预测工具;RoseTTAFold是DavidBaker实验室推出用于预测蛋白质结构的深度神经网络,RFdiffusion则是该实验室推出用于从头构建全新蛋白质的生成式AI工具。这些工具专注于蛋白质的氨基酸构建模块,而非捕获蛋白质...

...药物研发新革命,AlphaFold3太强了!专家团队手把手教授AI蛋白质...

2024年5月8日,谷歌旗下公司DeepMind与IsomorphicLabs合作,在《自然》期刊发表论文,发布了蛋白质结构预测领域最新人工智能模型——AlphaFold3!这一AI模型能够准确预测蛋白质、DNA、RNA以及配体等所有生命分子的结构及其相互作用方式。这是继AlphaFold2之后的又一重大突破。

为什么说想了解AI+合成生物学,必须先搞懂蛋白质?

2016年,被誉为“AI预测蛋白质结构*人”的许锦波博士在CASP12(“蛋白质结构预测奥运会”)首次展示了*代人工智能方法RaptorX。成功将残差网络应用于蛋白质残基接触图的预测中,人类对蛋白质结构的预测精度被大幅提升。后来领导DeepMind团队,设计了AlphaFold人工智能系统的JohnJumper博士当时就坐在台下,这位芝加哥大学生...

AlphaFold3来了!全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构...

AlphaFold3的核心是一个改进版的Evoformer模块(一种蛋白质语言模型),在处理输入后,AlphaFold3使用扩散(diffusion)网络进行预测(类似于AI绘图或ChatGPT生成文字),扩散过程从一团原子云开始,经过许多步骤后,最终生成最准确的分子结构。其对分子相互作用的预测准确度超过了所有已有的系统。