...全新核酸递送平台——蛋白脂质载体(PLV),有望开启基因治疗新时代
近年来,基因疗法能过治疗的疾病范围已从单基因遗传疾病扩展到了癌症等各种类型的疾病,这导致了数千项临床试验以及10多种获批上市的核酸药物。2012年,欧盟批准了世界首款基于腺相关病毒(AAV)载体的基因疗法Glybera上市,用于治疗脂蛋白脂肪酶缺乏症(LPLD),这推动了基因治疗领域使用AAV载体进行DNA递送。虽然AAV载体比许...
Nature子刊:何川团队开发超快速精准检测微量DNA与RNA中5-甲基胞...
随后研究团队将UBS-seq应用于具有复杂二级结构的tRNA,检测并且观察到NSUN2修饰位点的修饰比例能响应NSUN2基因的敲除(图2c),进一步验证了BS-seq的有效性和准确性。研究人员用UBS-seq对HeLa和HEK293T的mRNA进行了测序,发现了近两千多具有保守序列模式的位点(图2d)。随着NSUN2基因敲除,绝大多数m5C位点的修饰比例下降...
CRISPReporter战队:基因魔剪——CRISPR/Cas丨合成生物学竞赛
(ii)均包含多个短的直接重复序列,序列变异很小;(iii)均为重复序列与非保守序列(也被称为间隔区)穿插;(iv)几百个碱基对的共同前导序列均位于重复簇的一侧。图3:CRISPR结构特征YoshizumiIshinoetal.2018在研究CRIPSR的过程中,科学家们发现了在CRISPR区域相邻成簇的四个保守基因。这些基因被命名为CRISPR...
超越韩春雨?新一代基因编辑技术南京大学问世
这堪称技术演化之中还留下了历史痕迹,好似“保守序列”一样,让人惊叹“自然进化”与“人工进化”异曲同工之奇妙。所以,基因编辑工具开发工程化的基本方程式是:GPS定位模块+执行模块。话分两头说。先聊“执行模块”。FokⅠ屡战屡胜,但是,一定还有其它选择,毕竟,造物主应该是慷慨的,地球生命演化了四十亿年,留下...
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
O'Neill实验室的一位大学生在对基因组数据库进行保守序列筛查时,兴奋地发现大量物种间均存在一个相同的序列。然而当他尝试在实验室重复这些结果时却失败了。这位学生不禁开始质疑数据库基因组是否存在污染,于是他与实验室的同事合作对四个公共数据库(UCSCGenomeBrowser数据库,NCBI的GenBank数据库,DOEJointGenome...
基于直向同源序列的比较基因组学研究
直向同源基因通常是编码生命必需的酶、辅酶或关键性调控蛋白的基因,具有功能保守、进化缓慢、变化速度可覆盖整个进化历史、序列变化速度与进化距离相当等特征(www.e993.com)2024年10月17日。它代表了进化上分离的物种间保守的单拷贝基因,通常在物种进化过程中保持一种相当或是相似的功能[7,8],因此,比较基因组学、系统生物学、进化生物学等...
国家自然科学基金委员会发布七个2023年度项目指南
1.bulkTCR/BCR测序数据标准:外周血单样本clonotypes平均值不低于300,000种,组织样本clonotypes平均值不低于100,000种,单样本测序量不低于2Gbp(其中有效clonotype的定义为:能够组装出的全长氨基酸序列且不包含终止密码子,具有明确的胚系V和J基因ID信息,同时CDR3区域具有典型的保守序列)。2.bulkRNA-Seq测序标...
碳青霉烯类耐药性在人源和动物源产NDM酶大肠埃希菌间的传播丨...
(四)动物源和人源NDM阳性大肠杆菌间的保守序列分型由于NDM是CREC菌株中主要的碳青霉烯酶,因此利用生物信息学手段进一步研究了动物源和人源NDM阳性大肠杆菌间的关系。用463株NDM阳性大肠杆菌和463株随机选择匹配的NDM阴性大肠杆菌(1∶1)构建了基于序列分型(sequencingtypes,STs)的最小生成树,其菌株来源组成为人(...
特别关注|丁型肝炎病毒RNA检测的临床意义与方法|丁型肝炎病毒|丁...
常规反转录PCR:提取并纯化待测患者血液中的RNA成分,将其反转录所得cDNA作为扩增模板,选用一对HDV保守序列特异的引物,通过一定循环次数的变性、退火、延伸,获得所需片段的拷贝。Madejón等[41]用RT-PCR产物进行Southern印记杂交,发现常规PCR方法检测HDVRNA比狭缝杂交要灵敏10000倍。
专家论坛|张振锋:丁型肝炎抗体检测方法比较分析|丁型肝炎抗体|...
上述胶体金试纸条检测方法使用了一种所谓的“保守”HDV抗原,即首先对8个基因型的HDV抗原序列进行比对,获得保守序列,然后通过人工合成的方式获得该“保守”抗原的编码DNA[25]。该试纸条可以成功检测到多种HDV基因型感染的患者血清中的抗体。但其主要是定性分析,准确测定该“保守”抗原与不同基因型HDV抗体的交叉反应...