大涨150%,RNA编辑疗法爆火

与CRISPR技术相比，RNA编辑在mRNA水平进行，不直接改变DNA序列，可以有效避免脱靶效应和伦理问题。RNA分子的短暂性质意味着通过RNA编辑介入的效果是可逆的，不会改变基因，这为临床应用提供了更多的安全保障。RNA编辑技术为原本无法治疗的疾病开辟了新的治疗可能性，按编辑方法又可分为单碱基编辑和RNA外显子编辑两种主要类...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

而以上这些方法都依赖于cDNA转换,这一过程抹去了有关RNA碱基修饰的信息,而且也只能粗略估计多聚腺苷酸(poly(A))尾巴的长度,而directRNA-seq可以直接分析全长转录本异构体、度量碱基修饰(比如N6-甲基腺苷(M6A))和检测poly(A)尾巴长度。RNA-seq技术的进步在NCBIShortReadArchive(SRA)数据共享平台中多于95%...

“无中生有”的新基因起源机制发现

DNA一次复制一个碱基,通常情况下,单个碱基复制错误就会造成突变。他们研究了一种造成更大错误的机制,比如从另一个文本中复制粘贴文本。研究人员认识到,DNA复制错误有时可能是有益的。在RNA分子中,相邻回文序列的碱基可配对并形成类似发夹的结构,这种结构对RNA分子的功能至关重要。研究人员决定将重点放在microRNA基因...

...基因组吗?首次由AI从头设计的基因编辑器成功编辑人类细胞中DNA

OpenCRISPR-1是一款AI创建的基因编辑器,由类似Cas9的蛋白质和引导RNA组成,完全使用Profluence的大语言模型(LLM)开发。通过OpenCRISPR的训练过程,该公司的AI从大规模序列和生物背景中学习,生成数百万种自然界中不存在的多种CRISPR类蛋白质,从而以指数方式扩展了几乎所有已知的CRISPR家族。

测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?

长读长测序由于读长超长,能够对短读长测序无法处理的区域进行测序:如端粒,高重复区域以及复杂的结构变异,照亮了此前基因组中的暗区域。长读长测序能够检测长度为1000到20000个碱基或更长的DNA(或RNA)片段。这些片段通常来自于“原生”分子,这些分子是直接从生物样本中提取出来进行分析的。相比之下,大多数短读长测序...

复旦上医团队系统描绘DNA转录成RNA起始连续动态全程

生命的遗传物质是DNA，而DNA可以通过自我复制，伴随着细胞的分裂传递遗传信息(www.e993.com)2024年11月15日。DNA可以通过转录形成RNA，RNA通过翻译的过程合成蛋白质。转录是基因表达调控的核心，基因表达调控在人的发育、疾病发生过程中起到重要作用。真核细胞的基因转录需要经历起始、延伸、终止等多个阶段。多细胞生物为了满足在同一套基因组的基础上...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

(4)测序过程不依赖PCR扩增,避免了扩增给测序带来的偏好性,可无偏倚地直接对原始DNA或RNA进行测序,保留了原始碱基的修饰信息。(5)可实时进行碱基识别与分析,并能按需终止测序,显著缩短了测序流程及分析时间,可满足动态检测需求。(6)纳米孔芯片经清洗后可反复使用,直至纳米孔蛋白失活,因此上样更加灵活,有效提高了...

北京大学伊成器课题组综述基于RNA靶向修饰的碱基编辑技术

碱基编辑器是生物学研究中的强大工具,并为治疗人类疾病带来了巨大希望。DNA碱基编辑工具已被开发用于纠正遗传物质中的永久性错误,然而其产生的脱靶编辑也将是永久性的,这给治疗带来了风险。相较于永久改变遗传信息的DNA编辑,RNA编辑的结果是瞬时可逆的,因此更为安全。

AI 成功改写人类 DNA:全球首个基因编辑器开源,近 5 倍蛋白质宇宙...

通过训练OpenCRISPR,AI从大规模序列和生物背景中学习,生成了自然界不存在的数百万种CRISPR样蛋白。研究人员称,AI生成了自然界中已发现的「CRISPR-Cas家族」的4.8倍的蛋白质集群,完全实现了指数级扩展!而且,语言模型还为类Cas9效应蛋白定制了单引导RNA序列。

AI成功改写人类DNA,全球首个基因编辑器震撼开源!近5倍蛋白质宇宙...

通过训练OpenCRISPR,AI从大规模序列和生物背景中学习,生成了自然界不存在的数百万种CRISPR样蛋白。研究人员称,AI生成了自然界中已发现的「CRISPR-Cas家族」的4.8倍的蛋白质集群,完全实现了指数级扩展!而且,语言模型还为类Cas9效应蛋白定制了单引导RNA序列。