...器团队合作开发不依赖于亚硫酸氢盐RNA m??C单碱基测序检测方法
此外,对于具有复杂二级结构且序列复杂度较低的tRNA,m5C-TAC-seq不仅能够鉴定所有已报道位点及其修饰酶,并且由于保留了四元碱基组成使得其可以实现对不同tRNAisodecoder的精准检测。利用m5C-TAC-seq,研究人员绘制了HeLa、HEK293T和mESC的单碱基分辨率m5C修饰图谱,分别鉴定了2499、765和664个m5C位点,并利用无修饰转录组...
南加大揭示全新snoRNA-tRNA互作网络,捕获7000多种snoRNA靶点
更有意思的是，snoRNA-tRNA修饰网络的起源并非偶然，可能来源于生命对氧化应激的防卫，这也是一个绝大多数物种进化中所必须面对的难题。蛋白质中的甲硫氨酸（methionine），是少数几种在氧化之后可以原位修复的氨基酸。这一特性会被所有物种用于保护蛋白质免受氧化损伤，类似于军事装备中所常用的“反应装甲”，或者X...
研究揭示翻译调控型T-box核糖开关折叠与识别tRNA耦联的结构与动态...
科研人员采用基于非天然碱基系统的位点特异性正交荧光标记策略,在T-box核糖开关适配体结构域上选择七对标记位点,构建了一个密集的标记网络,得以全面探究tRNA及镁离子诱导的T-box核糖开关适配体的构象动态。研究发现,镁离子可以稳定stemIIA/B假结结构,使其与stemII结构域共轴堆积,进而诱导stemI与stemII结构域的...
鲁白:我们要做出真正一流的基础研究,还有很长一段路要走|科学|...
第二个是1919年,美籍俄罗斯医生和化学家菲巴斯·利文(PhoebusLevene)首先分析出DNA含有的四种碱基(A,T,G,C);第三个是1944年,美国细菌学家奥斯瓦尔德·艾弗里(OswaldAvery)提取出“转化因子”,并证实它就是DNA。艾弗里是整个分子生物学兴起事件中的核心人物,他的实验说明传递遗传信息的物质是DNA而不是蛋白质。
对话诺奖得主:那位拯救了数亿生命的“mRNA疯女人”
RNA：RNA是细胞内的另一种分子类型的统称，其中包括mRNA、tRNA、rRNA，每种RNA都有其独特的作用。相比RNA，RNA的核糖-磷酸骨架中。多含一个氧原子，并且其四个碱基中，也有一个与DNA不一样。这两者一个很重要的区别是：DNA“是个i人”、有点社交恐惧，主要在我们的细胞核内闭门不出，主要活动就是保护它编码的...
浙大细胞“黑客”技术登上《科学》:改写氨基酸“代码”,创造全新...
每个密码子由3个碱基组成,A、C、U、G四种碱基按不同的排列组合方式形成了64个密码子,其中61个对应编码了20种天然氨基酸,还有3个意味着终止符(www.e993.com)2024年11月12日。这张密码子表是几乎所有生物都通用的“单词表”,从细菌到大象、从爬虫到人类,都用这20个氨基酸“单词”。一个个氨基酸连接起来,再加上“句号”,就形成了蛋白质“...
半人工生命诞生,我们离成为“上帝”还有多远?
为完成目标,研究人员将从头开始合成酵母基因组,去除所有转座子和重复元件,重新编码终止密码子,并将转运RNA基因搬到全新的染色体上,同时还要避免引起适应性缺陷,并增加有助于染色体构建和操作的特征。在Sc2.0计划的设计过程中,虽然对基因序列进行了碱基删除、插入和替换,但原则上仍要保持合成菌株与天然菌株的相同表...
Nature子刊:伊成器课题组开发升级版不依赖CRISPR的RNA编辑技术
利用近同源tRNA与PTC中Ψ的碱基配对特性,RESTARTv3系统从mRNA层面上有效地拓展了RNA单碱基编辑类型,并且避免了脱靶修饰导致的遗传信息改变,为新型RNA碱基编辑器的发展提供了新的策略与方向。北京大学生命科学学院、核糖核酸北京研究中心伊成器教授为该论文的通讯作者,课题组博士研究生罗楠、博士后黄强、博士董利婷(已...
tRNA疗法明星公司亮相ASGCT,称首个候选分子对多种罕见病突变位点...
PTC疾病突变类型简单,发病比例较高,是单基因遗传病治疗的一个重要切入点。抑制性tRNA(suppressor-tRNA)能够诱导无义突变的通读,它与天然tRNA的序列大部分相同,但它的反密码子通过碱基配对原则可以识别终止密码子(UAG,UGA,UAA)。因此当核糖体在翻译过程中遇到PTC时,抑制性tRNA可以引入对应的...
专访北大夏青:用非天然氨基酸和碱基建构“全新世界”,突破合成...
正常翻译至终止密码子后,由多个氨基酸以“脱水缩合”方式生成的多肽链,就会从tRNA上切割下来,并进一步盘曲、折叠,最终生成蛋白质这种具有一定空间结构的物质。如果因为某个碱基的改变,导致正常编码某种氨基酸的三联体密码子突变为赭石型(UAA)、琥珀型(UAG)、蛋白石型(UGA)这三种不能编码氨基酸的终止密码子,就会使...